More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_1132 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  100 
 
 
378 aa  760    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  55.71 
 
 
374 aa  437  1e-121  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  58.6 
 
 
369 aa  437  1e-121  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  55.32 
 
 
369 aa  424  1e-117  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  54.73 
 
 
381 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  53.43 
 
 
358 aa  356  5e-97  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  46.86 
 
 
373 aa  354  1e-96  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  47.31 
 
 
386 aa  353  2e-96  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  49.6 
 
 
372 aa  352  8e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  47.84 
 
 
373 aa  350  3e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  53.45 
 
 
358 aa  349  4e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  45.65 
 
 
374 aa  336  5e-91  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  45.31 
 
 
373 aa  330  2e-89  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  43.62 
 
 
374 aa  323  2e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  43.94 
 
 
365 aa  323  3e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  45.24 
 
 
409 aa  306  3e-82  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  45.91 
 
 
369 aa  304  2.0000000000000002e-81  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  45.69 
 
 
688 aa  298  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  42.74 
 
 
373 aa  296  4e-79  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  48.09 
 
 
396 aa  296  6e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  47.77 
 
 
393 aa  293  3e-78  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  45.11 
 
 
689 aa  293  5e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  43.28 
 
 
372 aa  291  1e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  42.25 
 
 
403 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  39.52 
 
 
370 aa  264  2e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  40.25 
 
 
401 aa  262  8.999999999999999e-69  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  42.41 
 
 
390 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  39.03 
 
 
374 aa  258  1e-67  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  40.36 
 
 
401 aa  258  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  41.95 
 
 
384 aa  249  5e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  38.18 
 
 
375 aa  249  7e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  36.56 
 
 
375 aa  246  4e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  41.71 
 
 
384 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  37.32 
 
 
387 aa  238  2e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  36.53 
 
 
375 aa  236  4e-61  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  36.8 
 
 
375 aa  233  6e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  38.6 
 
 
370 aa  232  1e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  34.84 
 
 
370 aa  231  2e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  36.22 
 
 
362 aa  229  6e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  36.68 
 
 
381 aa  228  2e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  37.85 
 
 
373 aa  222  7e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  35.77 
 
 
367 aa  219  7e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  36.28 
 
 
386 aa  217  2e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  36.56 
 
 
377 aa  215  9.999999999999999e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  39.13 
 
 
337 aa  212  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  36.12 
 
 
376 aa  211  1e-53  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  31.48 
 
 
366 aa  206  6e-52  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  37.07 
 
 
344 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  31.93 
 
 
359 aa  183  5.0000000000000004e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  31.73 
 
 
378 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  27.4 
 
 
375 aa  139  7e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  27.37 
 
 
366 aa  129  1.0000000000000001e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  26.4 
 
 
365 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  29.12 
 
 
370 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  28.82 
 
 
350 aa  112  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  26.4 
 
 
369 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  29.11 
 
 
351 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  26.37 
 
 
376 aa  109  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  29.08 
 
 
344 aa  108  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  26.25 
 
 
378 aa  109  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.74 
 
 
354 aa  107  3e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  28.65 
 
 
354 aa  106  6e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  28.76 
 
 
368 aa  106  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  24.86 
 
 
371 aa  104  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.72 
 
 
370 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.14 
 
 
354 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  28.92 
 
 
315 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  24.34 
 
 
363 aa  102  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  28.86 
 
 
384 aa  101  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  28.79 
 
 
315 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  28.11 
 
 
350 aa  100  3e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  24.44 
 
 
360 aa  100  5e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  28.11 
 
 
350 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  28.11 
 
 
350 aa  100  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  26.92 
 
 
350 aa  99.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  24.47 
 
 
375 aa  99  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  26.96 
 
 
363 aa  97.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.93 
 
 
426 aa  97.1  5e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  27.07 
 
 
351 aa  96.3  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.35 
 
 
353 aa  95.9  1e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.17 
 
 
380 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  25.98 
 
 
483 aa  95.5  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1708  periplasmic binding protein  24.81 
 
 
392 aa  94.4  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  24.44 
 
 
349 aa  94  4e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  26.95 
 
 
354 aa  93.2  7e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  27.71 
 
 
389 aa  92.8  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.71 
 
 
389 aa  92.8  8e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  27.71 
 
 
381 aa  92.8  8e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  25.85 
 
 
348 aa  92.4  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  27.3 
 
 
382 aa  92.4  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  25.07 
 
 
397 aa  90.9  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  26.92 
 
 
408 aa  90.1  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  26.26 
 
 
362 aa  90.5  5e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  27.69 
 
 
364 aa  90.1  6e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.3 
 
 
406 aa  88.6  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.98 
 
 
351 aa  88.6  2e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  26.88 
 
 
318 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  23.39 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.55 
 
 
354 aa  87.8  3e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  26.26 
 
 
406 aa  87.4  4e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>