More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0513 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  100 
 
 		 365 aa  757    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  78.05 
 
 		 370 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  50.56 
 
 		 360 aa  390  1e-107  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  50.7 
 
 		 369 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  47.65 
 
 		 362 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  40.44 
 
 		 360 aa  315  7e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  43.38 
 
 		 375 aa  280  4e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  39.07 
 
 		 366 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  41.1 
 
 		 378 aa  263  3e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  37.53 
 
 		 377 aa  243  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  35.69 
 
 		 376 aa  240  2e-62  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  34.89 
 
 		 369 aa  240  2.9999999999999997e-62  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  35.4 
 
 		 348 aa  219  3.9999999999999997e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  33.96 
 
 		 363 aa  209  5e-53  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  35.58 
 
 		 353 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  32.2 
 
 		 361 aa  204  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  34.14 
 
 		 349 aa  204  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  33.84 
 
 		 345 aa  202  5e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  33.43 
 
 		 357 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  31.66 
 
 		 346 aa  193  4e-48  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  32.49 
 
 		 340 aa  191  1e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  32.41 
 
 		 340 aa  189  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.82 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  32.82 
 
 		 344 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  29.83 
 
 		 346 aa  184  3e-45  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  29.34 
 
 		 346 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  30.14 
 
 		 352 aa  181  2e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  30.14 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  31 
 
 		 349 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  29.92 
 
 		 348 aa  178  1e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  32.31 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  30.4 
 
 		 349 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  30.3 
 
 		 345 aa  168  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  31.44 
 
 		 361 aa  166  8e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 350 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  30.22 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  30.46 
 
 		 393 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  30.91 
 
 		 382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  29.09 
 
 		 353 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  28.98 
 
 		 345 aa  159  9e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.53 
 
 		 370 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  31.08 
 
 		 368 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  28.75 
 
 		 354 aa  146  6e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  29.68 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 354 aa  139  4.999999999999999e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 354 aa  140  4.999999999999999e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  30.17 
 
 		 378 aa  137  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  31.11 
 
 		 345 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  28.43 
 
 		 331 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  28.76 
 
 		 349 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  28.22 
 
 		 324 aa  131  2.0000000000000002e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  30.12 
 
 		 350 aa  130  3e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  29.53 
 
 		 333 aa  129  8.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  28.28 
 
 		 374 aa  126  5e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  26.17 
 
 		 375 aa  124  2e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  28.36 
 
 		 351 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  25.74 
 
 		 353 aa  122  8e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 348 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  26.58 
 
 		 340 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  28.7 
 
 		 350 aa  116  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  26.4 
 
 		 378 aa  116  7.999999999999999e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  29.88 
 
 		 397 aa  115  8.999999999999998e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  27.91 
 
 		 375 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  26.56 
 
 		 344 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  27.49 
 
 		 350 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  25.68 
 
 		 349 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  26.08 
 
 		 351 aa  113  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  27.43 
 
 		 393 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  29.11 
 
 		 334 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  27.79 
 
 		 350 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  28.3 
 
 		 375 aa  110  6e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  27.81 
 
 		 362 aa  108  1e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.1 
 
 		 353 aa  107  3e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  27.15 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.53 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.92 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.93 
 
 		 315 aa  104  3e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  28.15 
 
 		 372 aa  104  3e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  32.92 
 
 		 360 aa  103  5e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.23 
 
 		 372 aa  103  5e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  24.32 
 
 		 353 aa  103  6e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  26.21 
 
 		 348 aa  102  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.93 
 
 		 315 aa  102  9e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.21 
 
 		 386 aa  102  1e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 374 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 341 aa  101  2e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  26.68 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.93 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.07 
 
 		 344 aa  100  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 365 aa  99.4  9e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  30.69 
 
 		 358 aa  99  1e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  28.49 
 
 		 322 aa  99  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  28.49 
 
 		 351 aa  99  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  29.9 
 
 		 358 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 345 aa  98.2  2e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  23.57 
 
 		 360 aa  95.5  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>