197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1174 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1174  iron ABC transporter, solute-binding protein  100 
 
 		 438 aa  897    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  51.21 
 
 		 408 aa  435  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  44.94 
 
 		 408 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  45.7 
 
 		 419 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  33.57 
 
 		 406 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  27.25 
 
 		 374 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  25.12 
 
 		 374 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  25.85 
 
 		 373 aa  92.8  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 365 aa  92.4  1e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 378 aa  88.2  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 374 aa  87.4  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 361 aa  87.4  5e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.13 
 
 		 375 aa  86.3  9e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  23.54 
 
 		 333 aa  85.5  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  23.92 
 
 		 350 aa  82.4  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  23.86 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  23.31 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  24.57 
 
 		 351 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 350 aa  81.3  0.00000000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  23.79 
 
 		 377 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  23.92 
 
 		 350 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  23.67 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  24.57 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  26.43 
 
 		 370 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  24.88 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  25.58 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  23.66 
 
 		 351 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.68 
 
 		 337 aa  75.9  0.000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 393 aa  75.9  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  26.32 
 
 		 334 aa  76.3  0.000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0448  periplasmic binding protein  26.3 
 
 		 345 aa  75.9  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0352349  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 348 aa  76.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  24.93 
 
 		 358 aa  76.3  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.78 
 
 		 349 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  26.94 
 
 		 376 aa  74.7  0.000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  24.39 
 
 		 372 aa  73.6  0.000000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  24.86 
 
 		 354 aa  73.6  0.000000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  25.33 
 
 		 349 aa  73.2  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  24.57 
 
 		 401 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  23.59 
 
 		 362 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  25.75 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  24.26 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  21.7 
 
 		 353 aa  71.2  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2078  periplasmic binding protein  25.42 
 
 		 327 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25.68 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 375 aa  70.9  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  24.04 
 
 		 354 aa  69.7  0.00000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 369 aa  69.3  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  28.28 
 
 		 375 aa  69.7  0.0000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.57 
 
 		 369 aa  68.2  0.0000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.26 
 
 		 344 aa  67.4  0.0000000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  26.84 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 378 aa  67.4  0.0000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  23.57 
 
 		 351 aa  67  0.0000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.39 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  22.96 
 
 		 370 aa  66.6  0.0000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 386 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  27.17 
 
 		 367 aa  66.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  23.23 
 
 		 348 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 354 aa  66.2  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.32 
 
 		 393 aa  65.5  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  23.11 
 
 		 366 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  27.67 
 
 		 682 aa  65.5  0.000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  24.6 
 
 		 381 aa  65.9  0.000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  23.32 
 
 		 360 aa  64.7  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  24.87 
 
 		 351 aa  64.3  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  23.74 
 
 		 403 aa  63.9  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.75 
 
 		 353 aa  63.9  0.000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  24.07 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  21.89 
 
 		 369 aa  63.9  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  22.71 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  22.81 
 
 		 396 aa  62.8  0.00000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.08 
 
 		 362 aa  62.4  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 361 aa  61.6  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  22.91 
 
 		 362 aa  62  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  33.83 
 
 		 342 aa  62  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  22.47 
 
 		 373 aa  60.8  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  26.24 
 
 		 682 aa  60.8  0.00000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  24 
 
 		 341 aa  60.8  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  25.93 
 
 		 380 aa  60.5  0.00000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  23.2 
 
 		 337 aa  60.1  0.00000007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.53 
 
 		 343 aa  60.1  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 344 aa  59.7  0.00000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  24.53 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2396  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.56 
 
 		 375 aa  59.7  0.0000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.507465 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  23.86 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2004  putative ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  24.53 
 
 		 354 aa  59.3  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00731234  normal  0.178178 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 371 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 373 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  21.83 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  23.18 
 
 		 315 aa  58.9  0.0000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  21.83 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  22.03 
 
 		 381 aa  58.9  0.0000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  22.6 
 
 		 337 aa  58.9  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  26.76 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  26.27 
 
 		 384 aa  58.2  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>