231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0425 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  100 
 
 
365 aa  746    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  88.19 
 
 
373 aa  671    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  89.86 
 
 
374 aa  680    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  89.04 
 
 
374 aa  676    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  57.22 
 
 
372 aa  421  1e-116  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  56.16 
 
 
386 aa  415  9.999999999999999e-116  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  56.99 
 
 
373 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  56.44 
 
 
373 aa  408  1e-113  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  50.42 
 
 
372 aa  384  1e-105  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  51.34 
 
 
358 aa  345  8.999999999999999e-94  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  50.75 
 
 
358 aa  342  8e-93  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  43.94 
 
 
378 aa  323  3e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  42.35 
 
 
374 aa  318  7e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  43.96 
 
 
369 aa  317  2e-85  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  45.78 
 
 
369 aa  308  8e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  39.71 
 
 
369 aa  279  6e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  41.89 
 
 
370 aa  271  9e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  40.42 
 
 
390 aa  269  7e-71  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  40.34 
 
 
381 aa  267  2e-70  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  38.52 
 
 
373 aa  263  3e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  40.62 
 
 
387 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  43.02 
 
 
370 aa  261  2e-68  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  38.54 
 
 
370 aa  256  5e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  40.82 
 
 
384 aa  251  1e-65  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  38.23 
 
 
401 aa  251  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  39.34 
 
 
375 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  39.89 
 
 
375 aa  249  7e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  38.86 
 
 
403 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  36.9 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  39.89 
 
 
384 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  39.38 
 
 
386 aa  242  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  38.17 
 
 
409 aa  242  7.999999999999999e-63  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  39.18 
 
 
396 aa  241  1e-62  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  39.35 
 
 
375 aa  237  3e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  39.02 
 
 
376 aa  237  3e-61  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  38.83 
 
 
689 aa  236  4e-61  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  38.4 
 
 
373 aa  233  3e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  35.9 
 
 
375 aa  233  5e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  38.21 
 
 
362 aa  232  7.000000000000001e-60  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  37.94 
 
 
393 aa  230  2e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  37.99 
 
 
688 aa  229  4e-59  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  36.46 
 
 
381 aa  226  3e-58  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  37.77 
 
 
377 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  36.6 
 
 
337 aa  216  7e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  34.57 
 
 
374 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  35.11 
 
 
366 aa  214  1.9999999999999998e-54  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  34.94 
 
 
367 aa  210  3e-53  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  35.73 
 
 
378 aa  206  8e-52  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  31.78 
 
 
359 aa  181  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  31.1 
 
 
344 aa  144  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  27.25 
 
 
371 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  26.91 
 
 
375 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  27.97 
 
 
369 aa  106  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  24.62 
 
 
354 aa  101  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  27.42 
 
 
365 aa  99.4  9e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  24.62 
 
 
354 aa  98.6  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  28.22 
 
 
362 aa  97.1  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.8 
 
 
334 aa  94.7  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  25.85 
 
 
360 aa  94.4  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  25.44 
 
 
354 aa  92.8  9e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
350 aa  92.4  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  25.07 
 
 
368 aa  92  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1174  iron ABC transporter, solute-binding protein  25.56 
 
 
438 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1176  ABC transporter, solute-binding protein  26.1 
 
 
408 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  26.67 
 
 
384 aa  87.8  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  22.74 
 
 
333 aa  84.3  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.38 
 
 
351 aa  84  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  21.47 
 
 
349 aa  82.8  0.000000000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2395  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.45 
 
 
408 aa  82  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.02 
 
 
344 aa  82.4  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  27.27 
 
 
370 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  23.64 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  23.64 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  23.64 
 
 
350 aa  80.9  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  23.3 
 
 
353 aa  80.5  0.00000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  22.73 
 
 
350 aa  78.2  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  25.42 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  22.65 
 
 
370 aa  77  0.0000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  25.43 
 
 
353 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.32 
 
 
381 aa  76.6  0.0000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  24.32 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  24.32 
 
 
389 aa  76.3  0.0000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  24.54 
 
 
380 aa  75.9  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.36 
 
 
362 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  27.52 
 
 
375 aa  75.1  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  25.42 
 
 
426 aa  75.1  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  24.56 
 
 
349 aa  75.1  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  23.38 
 
 
483 aa  74.7  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  24.28 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  25.69 
 
 
366 aa  73.9  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25.8 
 
 
351 aa  73.9  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1470  periplasmic binding protein  24.34 
 
 
419 aa  73.6  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.000805448  normal  0.0690389 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.12 
 
 
357 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  22.86 
 
 
374 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1467  periplasmic binding protein  27.75 
 
 
406 aa  72  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  unclonable  0.0000000012515  normal  0.0723513 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  25.23 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  26.04 
 
 
382 aa  70.9  0.00000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  22.56 
 
 
378 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  24.93 
 
 
360 aa  70.5  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  24.85 
 
 
378 aa  70.1  0.00000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>