237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1653 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_1653  periplasmic binding protein  100 
 
 
386 aa  782    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  51.36 
 
 
387 aa  367  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  51.79 
 
 
370 aa  366  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  50.27 
 
 
401 aa  346  5e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  49.01 
 
 
401 aa  329  6e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0248  periplasmic binding protein  45.77 
 
 
375 aa  326  5e-88  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0774691  normal  0.65467 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2328  periplasmic binding protein  48.59 
 
 
384 aa  320  3e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  46.03 
 
 
403 aa  315  9e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2329  periplasmic binding protein  49.15 
 
 
384 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1047  Fe3+-hydroxamate binding protein  44.71 
 
 
370 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.271921  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0219  periplasmic binding protein  44.3 
 
 
370 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293771  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  46.53 
 
 
373 aa  293  4e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  40.11 
 
 
376 aa  264  2e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  38.73 
 
 
381 aa  263  4.999999999999999e-69  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  41.87 
 
 
358 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0411  periplasmic binding protein  41.41 
 
 
374 aa  248  9e-65  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  38.96 
 
 
373 aa  248  2e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  39.78 
 
 
358 aa  247  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  37.74 
 
 
386 aa  245  8e-64  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0410  periplasmic binding protein  37.9 
 
 
373 aa  245  9.999999999999999e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.579049  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0427  periplasmic binding protein  38.71 
 
 
373 aa  244  3e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0425  periplasmic binding protein  39.38 
 
 
365 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.264248  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  37.4 
 
 
374 aa  242  7e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  38.44 
 
 
374 aa  242  9e-63  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3056  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.72 
 
 
369 aa  241  2e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1091  hypothetical protein  40.53 
 
 
337 aa  232  8.000000000000001e-60  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  36.52 
 
 
369 aa  229  8e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0496  periplasmic binding protein  35.84 
 
 
372 aa  224  3e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.296202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  34.97 
 
 
381 aa  223  4e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0495  periplasmic binding protein  37.33 
 
 
372 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0117562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  36.28 
 
 
378 aa  217  2e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1092  hypothetical protein  35.42 
 
 
378 aa  215  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  37.47 
 
 
375 aa  212  1e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  36.68 
 
 
362 aa  206  6e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  38.24 
 
 
375 aa  206  7e-52  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1823  periplasmic binding protein  37.11 
 
 
366 aa  204  2e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.717749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  37.5 
 
 
373 aa  202  7e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  37.71 
 
 
409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  35.47 
 
 
375 aa  193  5e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  32.37 
 
 
369 aa  189  5e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0494  periplasmic binding protein  36.25 
 
 
390 aa  186  6e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0203786  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  34.01 
 
 
396 aa  177  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  33.81 
 
 
377 aa  177  3e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0216  periplasmic binding protein  34.1 
 
 
393 aa  176  5e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.941778  normal  0.148136 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  33.62 
 
 
689 aa  176  8e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  33.62 
 
 
688 aa  176  8e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  33.53 
 
 
374 aa  172  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1174  iron ABC transporter periplasmic-binding protein  31.83 
 
 
367 aa  139  6e-32  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00124091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0816  periplasmic binding protein  30.61 
 
 
344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0991  periplasmic binding protein  30.79 
 
 
359 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.960819  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  28.77 
 
 
360 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  31.18 
 
 
354 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  30.06 
 
 
354 aa  103  5e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  29.78 
 
 
354 aa  102  1e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.36 
 
 
334 aa  101  2e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  28.4 
 
 
350 aa  99.4  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  28.4 
 
 
350 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  28.1 
 
 
350 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  27.49 
 
 
350 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.9 
 
 
333 aa  94.7  2e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.91 
 
 
375 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  28.57 
 
 
361 aa  94.7  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1354  periplasmic binding protein  26.33 
 
 
371 aa  92  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  24.86 
 
 
378 aa  89  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  24.33 
 
 
426 aa  87.4  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
350 aa  87  5e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  27.17 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  26.89 
 
 
349 aa  82  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  26.9 
 
 
354 aa  79.7  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1702  periplasmic binding protein  25.56 
 
 
364 aa  79.7  0.00000000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  24.93 
 
 
370 aa  79  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  26.18 
 
 
353 aa  79.3  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.77 
 
 
393 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  27.41 
 
 
375 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1221  ABC transporter substrate binding protein (iron)  26.24 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  25.64 
 
 
351 aa  78.6  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.16 
 
 
344 aa  77.8  0.0000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  24.85 
 
 
362 aa  77.4  0.0000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39880  periplasmic solute-binding component of iron(III) ABC transporter  29.25 
 
 
357 aa  77.4  0.0000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0745  periplasmic binding protein  26.95 
 
 
407 aa  77  0.0000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.300436 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.08 
 
 
353 aa  77  0.0000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  25.35 
 
 
351 aa  77  0.0000000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.37 
 
 
427 aa  75.5  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7622  ABC transporter substrate binding protein (iron)  27.63 
 
 
429 aa  75.5  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  23.84 
 
 
362 aa  75.5  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2617  periplasmic binding protein  27.33 
 
 
380 aa  75.5  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  23.84 
 
 
360 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  25.42 
 
 
351 aa  74.7  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  30.53 
 
 
361 aa  75.5  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2539  periplasmic binding protein  26.74 
 
 
368 aa  74.7  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  24.08 
 
 
343 aa  74.3  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.93 
 
 
372 aa  74.3  0.000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  25.07 
 
 
369 aa  73.6  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.31 
 
 
360 aa  72.4  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  24.52 
 
 
346 aa  72.4  0.00000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1127  periplasmic binding protein  25 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  26.74 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  24.26 
 
 
315 aa  71.6  0.00000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.89 
 
 
349 aa  72  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  29.07 
 
 
363 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>