289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2263 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2263  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  100 
 
 		 360 aa  746    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.128024  normal  0.494414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2264  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  71.93 
 
 		 362 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0217447  normal  0.506008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1479  iron(III) dicitrate-biding protein  32.87 
 
 		 360 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00808536  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39880  periplasmic solute-binding component of iron(III) ABC transporter  38.65 
 
 		 357 aa  207  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  30.15 
 
 		 344 aa  161  2e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.68 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  29.68 
 
 		 393 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.85 
 
 		 372 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  30.7 
 
 		 337 aa  153  4e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  29.57 
 
 		 369 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  30.28 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2805  periplasmic binding protein  29.39 
 
 		 344 aa  149  6e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000505659  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0815  iron ABC transporter, solute-binding protein  30.09 
 
 		 337 aa  147  3e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000212424  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  29.16 
 
 		 353 aa  146  4.0000000000000006e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  29.86 
 
 		 341 aa  145  1e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  30.67 
 
 		 358 aa  144  3e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1285  periplasmic binding protein  30.18 
 
 		 337 aa  143  5e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000393821  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1534  lipopolysaccharide biosynthesis protein  30.45 
 
 		 351 aa  140  3e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000374232  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  27.72 
 
 		 363 aa  140  3e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  32.13 
 
 		 354 aa  139  7e-32  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2004  putative ABC-type Fe3+ transport system periplasmic component  31.83 
 
 		 354 aa  139  7e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.00731234  normal  0.178178 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  32.13 
 
 		 354 aa  138  2e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  28.82 
 
 		 370 aa  138  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  27.08 
 
 		 351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  29.55 
 
 		 362 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 360 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  29.19 
 
 		 358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24730  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.27 
 
 		 386 aa  134  3e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  32.24 
 
 		 354 aa  134  3e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  33.73 
 
 		 350 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  32.13 
 
 		 349 aa  133  5e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 360 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 345 aa  132  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 342 aa  130  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  28.36 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  29.45 
 
 		 344 aa  127  3e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  27.99 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  30.89 
 
 		 350 aa  125  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  30.58 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  30.89 
 
 		 350 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  30.28 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  29.85 
 
 		 353 aa  119  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2225  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 348 aa  116  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000231713  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  26.8 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  27.89 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10530  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.7 
 
 		 376 aa  110  5e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 333 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 343 aa  107  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.2 
 
 		 349 aa  106  6e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  26.34 
 
 		 369 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  25 
 
 		 343 aa  104  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  23.85 
 
 		 378 aa  105  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 366 aa  104  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  32.92 
 
 		 365 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  25.21 
 
 		 370 aa  103  4e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  28.92 
 
 		 351 aa  103  6e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.45 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 360 aa  101  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.81 
 
 		 334 aa  99.8  6e-20  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1544  periplasmic binding protein  26.05 
 
 		 360 aa  99.8  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  28.53 
 
 		 367 aa  99.8  7e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  28.4 
 
 		 378 aa  97.8  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.3 
 
 		 357 aa  97.4  3e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  23.4 
 
 		 377 aa  95.5  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  26.71 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  30.05 
 
 		 353 aa  91.3  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  26.57 
 
 		 349 aa  89.7  7e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  24.2 
 
 		 397 aa  87.4  3e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 345 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  23.29 
 
 		 346 aa  86.7  5e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0428  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 375 aa  85.5  0.000000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 382 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  22.43 
 
 		 348 aa  85.1  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  23.5 
 
 		 376 aa  85.1  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.12 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  25.48 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  26.96 
 
 		 374 aa  83.2  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1869  iron(III) dicitrate-binding protein  26.91 
 
 		 401 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.444655  normal  0.203849 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1093  Fe3+-hydroxamate binding protein  32.98 
 
 		 426 aa  82  0.00000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000000629133  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26 
 
 		 315 aa  82  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1868  iron(III) dicitrate-binding protein  26 
 
 		 401 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.311818 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  25.75 
 
 		 347 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.99 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  21.14 
 
 		 346 aa  80.5  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  27.86 
 
 		 682 aa  80.1  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  22.92 
 
 		 348 aa  79.7  0.00000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  27.86 
 
 		 682 aa  79.3  0.0000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0998  iron ABC transporter, solute-binding protein  26.9 
 
 		 373 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.52 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  24.18 
 
 		 373 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  29.21 
 
 		 343 aa  77.8  0.0000000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.37 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 344 aa  77  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  24.11 
 
 		 378 aa  76.3  0.0000000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0273  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 381 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000312893  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  22.46 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>