More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lferr_1204 on replicon NC_011206
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  100 
 
 		 352 aa  727    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  100 
 
 		 343 aa  709    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  43.73 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  43.73 
 
 		 344 aa  251  2e-65  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  36.34 
 
 		 348 aa  244  9.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  34.1 
 
 		 346 aa  225  1e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  33.96 
 
 		 340 aa  224  2e-57  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  36.95 
 
 		 349 aa  223  3e-57  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  33.93 
 
 		 340 aa  218  2e-55  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  31.98 
 
 		 345 aa  217  2e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  35.19 
 
 		 357 aa  209  6e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  31.01 
 
 		 360 aa  202  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  32.06 
 
 		 372 aa  201  1.9999999999999998e-50  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  31.59 
 
 		 360 aa  194  2e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  31.68 
 
 		 362 aa  187  2e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  34.04 
 
 		 342 aa  184  2.0000000000000003e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  33.44 
 
 		 378 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  29.48 
 
 		 366 aa  181  1e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  30.14 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  30.84 
 
 		 370 aa  179  7e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  33.75 
 
 		 361 aa  176  4e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  30.98 
 
 		 369 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  33.96 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  28.18 
 
 		 376 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  25.86 
 
 		 348 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  27.02 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  32.47 
 
 		 353 aa  159  6e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  29.7 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  30.67 
 
 		 363 aa  152  8e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  30.58 
 
 		 349 aa  149  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  30.35 
 
 		 331 aa  149  8e-35  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  29.5 
 
 		 349 aa  147  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 369 aa  146  4.0000000000000006e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  30.43 
 
 		 345 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  31.76 
 
 		 346 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  30.63 
 
 		 343 aa  139  7e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 350 aa  139  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  27.12 
 
 		 377 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 352 aa  132  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  25.76 
 
 		 346 aa  129  8.000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  25 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  28.78 
 
 		 353 aa  120  3e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  25.48 
 
 		 382 aa  114  2.0000000000000002e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  28.93 
 
 		 354 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  28.09 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  28.36 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  27.93 
 
 		 361 aa  106  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  21.07 
 
 		 393 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 354 aa  101  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  28.19 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 350 aa  98.2  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 350 aa  97.4  4e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1168  periplasmic binding protein  25.6 
 
 		 353 aa  95.1  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.61734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  25 
 
 		 362 aa  94.4  3e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  26.76 
 
 		 351 aa  93.6  5e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  23.18 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  26.72 
 
 		 349 aa  92.8  9e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  28.18 
 
 		 349 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 353 aa  92.4  1e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  27.3 
 
 		 350 aa  90.9  3e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 334 aa  90.5  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  23.9 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  24.86 
 
 		 353 aa  90.1  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  24.8 
 
 		 368 aa  90.1  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  23.71 
 
 		 375 aa  89.4  9e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  21.41 
 
 		 378 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  23.72 
 
 		 375 aa  88.2  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  25.79 
 
 		 341 aa  87.8  3e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.52 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 333 aa  86.7  5e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.21 
 
 		 374 aa  86.7  6e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1544  periplasmic binding protein  24.62 
 
 		 360 aa  86.3  7e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  25.61 
 
 		 340 aa  86.3  7e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  25.31 
 
 		 370 aa  86.3  8e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  25.26 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.93 
 
 		 344 aa  85.9  0.000000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  25.26 
 
 		 389 aa  85.5  0.000000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  26.29 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  23.58 
 
 		 393 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  24.12 
 
 		 682 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  23.35 
 
 		 682 aa  80.9  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  22.63 
 
 		 372 aa  78.2  0.0000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0497  periplasmic binding protein  24.57 
 
 		 377 aa  78.2  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.292133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  22.86 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1622  iron transport periplasmic binding protein  23.55 
 
 		 370 aa  76.3  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00000308392  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  22.41 
 
 		 345 aa  75.5  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1870  iron(III) dicitrate-binding protein  23.05 
 
 		 403 aa  74.7  0.000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.874813  normal  0.198975 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0343  periplasmic binding protein  25.23 
 
 		 373 aa  74.7  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1494  periplasmic binding protein  22.6 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  decreased coverage  0.00826016  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  23.64 
 
 		 360 aa  73.6  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1093  V-type ATPase, 116 kDa subunit  25.3 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0424  periplasmic binding protein  22.32 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.212243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  21.91 
 
 		 363 aa  72.4  0.00000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  23.42 
 
 		 345 aa  71.2  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 322 aa  71.2  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0327  hypothetical protein  29.29 
 
 		 381 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  21.61 
 
 		 337 aa  71.6  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1493  periplasmic binding protein  24.3 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.277986  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2147  periplasmic binding protein  23.21 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.985671  normal  0.111935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>