More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_2330 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_2330  periplasmic binding protein  100 
 
 		 372 aa  767    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.690031  normal  0.0917181 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2074  periplasmic binding protein  60.37 
 
 		 340 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  48.67 
 
 		 346 aa  339  5e-92  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3702  periplasmic binding protein  41.54 
 
 		 348 aa  271  2e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1477  periplasmic binding protein  38.82 
 
 		 345 aa  260  2e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.47905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0153  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.88 
 
 		 357 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.661173  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2069  periplasmic binding protein  36.31 
 
 		 340 aa  236  4e-61  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0148  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  39.32 
 
 		 349 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0440522  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00450  ABC transporter, periplasmic binding protein  36.2 
 
 		 342 aa  219  3.9999999999999997e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.123713  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0024  periplasmic binding protein  37.76 
 
 		 360 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1419  periplasmic binding protein  37.54 
 
 		 375 aa  207  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.364808  normal  0.918075 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  33.05 
 
 		 360 aa  206  4e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1489  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  32.06 
 
 		 343 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.236067  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1204  periplasmic binding protein  32.06 
 
 		 352 aa  201  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.96916  hitchhiker  0.000051068 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1687  periplasmic binding protein  34.95 
 
 		 378 aa  199  5e-50  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.372146  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1598  periplasmic binding protein  35.26 
 
 		 369 aa  199  9e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.796704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0500  ABC Fe3+-siderophore transporter, substrate binding subunit  31.85 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1494  iron compound ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  36.25 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1212  periplasmic binding protein  36.25 
 
 		 344 aa  191  1e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.109555  hitchhiker  0.0000000987512 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0603  periplasmic binding protein  30.26 
 
 		 348 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1690  periplasmic binding protein  32.02 
 
 		 366 aa  191  2e-47  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00951352  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2097  periplasmic binding protein  31.38 
 
 		 376 aa  182  6e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.328694  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  33.45 
 
 		 324 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0513  ABC transporter, solute-binding protein  32.31 
 
 		 365 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1286  ABC transporter, solute-binding protein  30.7 
 
 		 370 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  36.73 
 
 		 361 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1285  periplasmic binding protein  30.84 
 
 		 346 aa  169  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  31.87 
 
 		 363 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0417  periplasmic binding protein  35.29 
 
 		 346 aa  166  8e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0407983 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47140  Periplasmic binding protein  32.42 
 
 		 353 aa  164  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.910007  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0866  periplasmic binding protein  33.12 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1991  periplasmic binding protein  27.61 
 
 		 377 aa  160  2e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0448  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 369 aa  161  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2480  periplasmic binding protein  31.14 
 
 		 350 aa  156  6e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.388226 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3842  periplasmic binding protein  33.23 
 
 		 349 aa  156  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.294669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1985  periplasmic binding protein  31.52 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4648  periplasmic binding protein  32.89 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.76116  hitchhiker  0.000482562 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4151  periplasmic binding protein  32.93 
 
 		 349 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00557597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1515  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 345 aa  144  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0278  periplasmic binding family protein  26.86 
 
 		 331 aa  134  3e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.429982  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4299  periplasmic binding protein  33.04 
 
 		 345 aa  130  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4265  periplasmic binding protein  27.07 
 
 		 393 aa  123  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1119  periplasmic binding protein  27.19 
 
 		 382 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000476149  hitchhiker  0.00000000000345093 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2551  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.391022  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1947  iron(III) ABC transporter, periplasmic iron(III)-binding protein  29.61 
 
 		 340 aa  115  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0791434 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1999  periplasmic binding protein  26.01 
 
 		 348 aa  114  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.205186 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3219  twin-arginine translocation pathway signal  27.62 
 
 		 354 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0247  periplasmic binding protein  28.17 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.779854  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0029  periplasmic binding protein  28.37 
 
 		 361 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2486  ferrichrome-binding periplasmic protein  27.3 
 
 		 370 aa  106  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1675  hypothetical protein  26.69 
 
 		 368 aa  102  9e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1657  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 367 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0487788  normal  0.142539 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30870  periplasmic solute binding protein of iron siderophore transporter  27.89 
 
 		 349 aa  97.1  5e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.359995  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26430  Periplasmic binding protein  28.74 
 
 		 360 aa  96.3  8e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.0027542  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2260  hypothetical protein  25.71 
 
 		 378 aa  95.1  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.032453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1492  periplasmic binding protein  26.59 
 
 		 362 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.104614  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  25.84 
 
 		 375 aa  93.2  6e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3033  periplasmic binding protein  24.34 
 
 		 345 aa  92.8  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2271  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  26.83 
 
 		 393 aa  92.4  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  0.104601 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1424  periplasmic binding protein  24 
 
 		 354 aa  92.8  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  26.44 
 
 		 353 aa  92  2e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2847  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  25.73 
 
 		 375 aa  88.6  2e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24.48 
 
 		 483 aa  87  5e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1611  periplasmic binding protein  26.42 
 
 		 341 aa  86.7  6e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  22.88 
 
 		 350 aa  86.3  7e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  24.38 
 
 		 363 aa  86.7  7e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  26.92 
 
 		 315 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1187  iron(III) ABC transporter, solute-binding protein  25.93 
 
 		 374 aa  84.3  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3384  periplasmic binding protein  25.97 
 
 		 358 aa  83.6  0.000000000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5706  periplasmic binding protein  24.65 
 
 		 351 aa  82.8  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  26.07 
 
 		 315 aa  82.8  0.00000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3543  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 358 aa  82.4  0.00000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  23.26 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2669  putative ABC transporter, periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.33 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1538  putative ABC transporter periplasmic iron siderophore/cobalamin-binding protein  26.33 
 
 		 381 aa  82.4  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.204367 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2751  periplasmic binding protein  26.33 
 
 		 389 aa  82  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.369256  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0426  periplasmic binding protein  25.45 
 
 		 375 aa  81.3  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1559  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  24.14 
 
 		 337 aa  81.6  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.307142  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  23.26 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1944  periplasmic binding protein  30.5 
 
 		 352 aa  81.3  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1481  periplasmic binding protein  23.87 
 
 		 354 aa  81.3  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1721  hypothetical protein  26.27 
 
 		 351 aa  80.9  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  23.88 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1612  iron chelatin ABC transporter, substrate binding protein  26.99 
 
 		 344 aa  80.5  0.00000000000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  23.37 
 
 		 347 aa  79.7  0.00000000000007  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0956  periplasmic binding protein  25.43 
 
 		 343 aa  79.7  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.94277  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  24.77 
 
 		 309 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2073  periplasmic binding protein  25.22 
 
 		 343 aa  79.3  0.00000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0530  periplasmic binding protein  29.38 
 
 		 342 aa  79.3  0.00000000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.519305  normal  0.848906 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  22.97 
 
 		 350 aa  78.6  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1691  periplasmic binding protein  22.41 
 
 		 353 aa  78.6  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000252356  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1422  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 333 aa  77.8  0.0000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.158314 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0033  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  22.97 
 
 		 350 aa  77  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  24.35 
 
 		 344 aa  74.3  0.000000000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1747  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 334 aa  73.2  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  27.15 
 
 		 304 aa  72.8  0.000000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1372  periplasmic binding protein  21.85 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01880  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  23.88 
 
 		 372 aa  72.4  0.00000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.09691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>