More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_1085 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_1085  GGDEF domain-containing protein  100 
 
 		 319 aa  645    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000216184  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2119  response regulatory protein  30.48 
 
 		 371 aa  124  3e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2120  signaling protein  33.33 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0333  GGDEF domain-containing protein  30.27 
 
 		 364 aa  119  9e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1086  diguanylate cyclase  29.14 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00113131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0332  DNA polymerase III delta prime subunit HolB  30.18 
 
 		 349 aa  107  3e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3489  GGDEF domain-containing protein  32.82 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  30.92 
 
 		 532 aa  105  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4604  diguanylate cyclase  30.86 
 
 		 489 aa  103  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1889  diguanylate cyclase  30.45 
 
 		 714 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.838759  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4283  diguanylate cyclase  28.02 
 
 		 480 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4163  diguanylate cyclase  32 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4045  diguanylate cyclase  32 
 
 		 385 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1404  diguanylate cyclase  32.29 
 
 		 390 aa  100  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1817  GGDEF family protein  32.53 
 
 		 512 aa  100  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3968  diguanylate cyclase  32 
 
 		 385 aa  99.8  6e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1382  response regulator receiver protein  33.72 
 
 		 302 aa  98.2  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3168  diguanylate cyclase  26.95 
 
 		 362 aa  97.8  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02711  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.09 
 
 		 605 aa  97.4  3e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.407326  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6813  diguanylate cyclase  31.94 
 
 		 285 aa  96.7  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.823191  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2926  diguanylate cyclase  32.72 
 
 		 250 aa  96.7  5e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0378  diguanylate cyclase  36.26 
 
 		 422 aa  96.3  7e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000891935  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3873  diguanylate cyclase  35.91 
 
 		 430 aa  95.9  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  35.62 
 
 		 425 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3232  hypothetical protein  32.94 
 
 		 498 aa  95.9  8e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0640076  normal  0.305585 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1171  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.61 
 
 		 416 aa  95.9  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.137039  normal  0.392599 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2364  diguanylate cyclase  28.37 
 
 		 351 aa  95.1  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000850784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.83 
 
 		 337 aa  95.1  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.32327  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1513  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  32.39 
 
 		 301 aa  95.1  1e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0153071 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0065  response regulator receiver protein  32.04 
 
 		 305 aa  94.4  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1377  diguanylate cyclase  32.78 
 
 		 368 aa  94.7  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2966  diguanylate cyclase  28.46 
 
 		 386 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0175816  decreased coverage  0.00586824 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0952  GGDEF domain-containing protein  31.89 
 
 		 430 aa  94  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  32.96 
 
 		 464 aa  94  3e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4153  putative sensory box/GGDEF family protein  35.91 
 
 		 430 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.36181  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3800  sensory box/GGDEF family protein  34.92 
 
 		 431 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0221299  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2653  diguanylate cyclase  26.74 
 
 		 397 aa  94  3e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170151 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4111  sensory box/GGDEF family protein, putative  34.92 
 
 		 430 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3954  sensory box/GGDEF family protein  34.92 
 
 		 431 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4263  sensory box/GGDEF family protein  34.92 
 
 		 430 aa  93.6  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4175  putative sensory box/GGDEF family protein  34.92 
 
 		 430 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00125122  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1232  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.76 
 
 		 416 aa  93.6  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4064  putative sensory box/GGDEF family protein  34.92 
 
 		 431 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3790  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.02 
 
 		 300 aa  93.6  4e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1577  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35 
 
 		 314 aa  93.2  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3785  sensory box/GGDEF family protein  34.92 
 
 		 431 aa  93.2  5e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  35.15 
 
 		 490 aa  92.8  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1761  diguanylate cyclase  36.08 
 
 		 720 aa  92.4  8e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  29.05 
 
 		 650 aa  92.4  8e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3791  diguanylate cyclase  30.59 
 
 		 572 aa  92.4  9e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0569  diguanylate cyclase  29.72 
 
 		 403 aa  92.4  9e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2382  GGDEF family protein  33.71 
 
 		 649 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0512687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2763  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.1 
 
 		 751 aa  91.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.256566 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4901  hypothetical protein  34.42 
 
 		 375 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.296494  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1085  putative sensory box/GGDEF family protein  35.36 
 
 		 430 aa  92  1e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 		 700 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.133326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1896  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.32 
 
 		 564 aa  91.7  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000133427  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3330  diguanylate cyclase  33.14 
 
 		 556 aa  91.7  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2896  cellulose binding, type IV  30.81 
 
 		 443 aa  91.7  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00808862 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0636  diguanylate cyclase  35.19 
 
 		 341 aa  91.3  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0544  diguanylate cyclase  30.41 
 
 		 414 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2463  diguanylate cyclase  34.46 
 
 		 637 aa  90.5  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.244329  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56280  hypothetical protein  33.12 
 
 		 375 aa  90.9  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3646  diguanylate cyclase  28.57 
 
 		 357 aa  90.1  4e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1163  diguanylate cyclase  33.54 
 
 		 308 aa  90.5  4e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3550  diguanylate cyclase  25.57 
 
 		 381 aa  90.5  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  28.16 
 
 		 482 aa  90.1  4e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1554  GGDEF domain-containing protein  32.98 
 
 		 729 aa  90.1  5e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00526113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1336  diguanylate cyclase  33.77 
 
 		 495 aa  90.1  5e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.474489  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0413  diguanylate cyclase  32 
 
 		 373 aa  90.1  5e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.191775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3824  diguanylate cyclase  36.42 
 
 		 659 aa  89.7  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05399  hypothetical protein  32.72 
 
 		 480 aa  89.7  6e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  28.16 
 
 		 482 aa  89.7  6e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1171  diguanylate cyclase  31.64 
 
 		 674 aa  89.4  7e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  36.09 
 
 		 483 aa  89.4  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0867  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.5 
 
 		 312 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.711393  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1377  diguanylate cyclase  35.56 
 
 		 411 aa  89.4  8e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1922  diguanylate cyclase  33.53 
 
 		 527 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.252712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1476  diguanylate cyclase  24.14 
 
 		 414 aa  89.4  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.64785  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2518  diguanylate cyclase  33.53 
 
 		 372 aa  89.4  8e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.165269  normal  0.0137006 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0392  diguanylate cyclase  31.25 
 
 		 768 aa  89  9e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000907702  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2165  diguanylate cyclase  31.61 
 
 		 333 aa  89  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000162389  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.62 
 
 		 675 aa  88.6  1e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1411  GGDEF domain-containing protein  27.75 
 
 		 493 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0895588  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  31.61 
 
 		 418 aa  89  1e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1107  two component signal transduction response regulator  33.91 
 
 		 323 aa  89  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2788  diguanylate cyclase  34.59 
 
 		 726 aa  88.6  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.282948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0109  diguanylate cyclase  31.14 
 
 		 461 aa  89  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1920  diguanylate cyclase  34.05 
 
 		 893 aa  89  1e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  33.96 
 
 		 427 aa  89  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0885  membrane associated GGDEF protein  30.43 
 
 		 712 aa  88.6  1e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4400  diguanylate cyclase  27.75 
 
 		 493 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3032  diguanylate cyclase  30.43 
 
 		 547 aa  89  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1907  diguanylate cyclase  32.97 
 
 		 487 aa  88.6  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.230991 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0817  diguanylate cyclase  34.24 
 
 		 1826 aa  88.6  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2332  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.78 
 
 		 324 aa  89  1e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.532356  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2848  diguanylate cyclase  34.88 
 
 		 575 aa  89  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0600  response regulator receiver protein  31.38 
 
 		 301 aa  88.2  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26970  hypothetical protein  31.82 
 
 		 525 aa  88.6  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0269  diguanylate cyclase  32.22 
 
 		 485 aa  89  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.853723  hitchhiker  0.00000177476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>