96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0893 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014150  Bmur_0893  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 640 aa  1253    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000115174  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2048  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 573 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.732994  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0523  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.38 
 
 		 582 aa  77  0.000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  34.92 
 
 		 568 aa  73.6  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1233  intermediate filament protein  29.68 
 
 		 573 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.190296 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.34 
 
 		 571 aa  67.4  0.0000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.51 
 
 		 563 aa  66.6  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  30.22 
 
 		 573 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  32.19 
 
 		 638 aa  65.5  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.01 
 
 		 566 aa  65.1  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1589  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.86 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.499739 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  32.26 
 
 		 632 aa  64.3  0.000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  30.47 
 
 		 722 aa  61.6  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1618  TPR repeat-containing protein  20.22 
 
 		 586 aa  61.2  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.73577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37 
 
 		 572 aa  60.5  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0570  TPR repeat-containing protein  40.45 
 
 		 591 aa  60.1  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.25 
 
 		 557 aa  59.7  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3744  tetratricopeptide TPR_2  28.89 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  29.85 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  35.79 
 
 		 621 aa  57.8  0.0000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  29.1 
 
 		 425 aa  57  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  29.1 
 
 		 566 aa  57.4  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2555  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.36 
 
 		 804 aa  56.6  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.152731  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  29.31 
 
 		 595 aa  56.2  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  38.75 
 
 		 594 aa  56.6  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  29.25 
 
 		 581 aa  55.1  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  25.32 
 
 		 575 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  32.95 
 
 		 573 aa  54.7  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  24.86 
 
 		 565 aa  54.7  0.000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0927  TPR repeat-containing protein  30.09 
 
 		 291 aa  54.7  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  25.4 
 
 		 566 aa  54.3  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  30.77 
 
 		 677 aa  53.9  0.000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 621 aa  53.5  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  30 
 
 		 621 aa  53.5  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4107  TPR repeat-containing protein  31.97 
 
 		 552 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 613 aa  53.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  42.65 
 
 		 229 aa  52.8  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  25.87 
 
 		 566 aa  52.8  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  31.58 
 
 		 619 aa  53.1  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0617  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.93 
 
 		 579 aa  52  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2499  PEP-CTERM system TPR-repeat lipoprotein  30.83 
 
 		 935 aa  51.6  0.00005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00842249  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  36.25 
 
 		 592 aa  51.6  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.88 
 
 		 619 aa  50.8  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  23.61 
 
 		 579 aa  50.8  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  25.87 
 
 		 567 aa  50.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3624  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.33 
 
 		 571 aa  50.8  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 		 599 aa  50.1  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 617 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.91 
 
 		 610 aa  49.7  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1582  TPR repeat-containing protein  29.03 
 
 		 767 aa  50.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000189935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  27.91 
 
 		 610 aa  50.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  30.97 
 
 		 562 aa  50.4  0.0001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  35 
 
 		 593 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  31.21 
 
 		 585 aa  49.3  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3253  TPR domain-containing protein  27.12 
 
 		 591 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000563369  normal  0.0756352 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 592 aa  49.7  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  31.09 
 
 		 562 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3305  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 		 633 aa  49.7  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.68435  normal  0.412793 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1154  TPR repeat-containing protein  25.17 
 
 		 511 aa  49.7  0.0002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3074  TPR domain protein  25.38 
 
 		 584 aa  48.9  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.83813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2583  TPR repeat-containing protein  45.9 
 
 		 729 aa  48.9  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3111  TPR repeat-containing protein  34.94 
 
 		 631 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.651134 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3430  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.94 
 
 		 633 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.345499 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  26.36 
 
 		 607 aa  48.5  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2747  TPR repeat-containing protein  32.56 
 
 		 617 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.538174  normal  0.232228 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  27.1 
 
 		 603 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.1 
 
 		 553 aa  48.1  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  31.82 
 
 		 583 aa  47.8  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  27.12 
 
 		 575 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  37.04 
 
 		 572 aa  47.4  0.0008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  25.19 
 
 		 642 aa  47.4  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  27.12 
 
 		 556 aa  47.4  0.0008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  31 
 
 		 645 aa  47.4  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.43 
 
 		 612 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  33.75 
 
 		 593 aa  46.6  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  32 
 
 		 642 aa  47  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  22.12 
 
 		 574 aa  47.4  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 584 aa  47  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  28.16 
 
 		 609 aa  47  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0730  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 427 aa  46.6  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1506  tetratricopeptide TPR_4  31.19 
 
 		 729 aa  47  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1768  TPR repeat-containing protein  37.88 
 
 		 492 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31 
 
 		 645 aa  46.2  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.27 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  37.21 
 
 		 442 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2606  tetratricopeptide TPR_2  27.07 
 
 		 643 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2187  TPR repeat-containing protein  29.46 
 
 		 571 aa  45.4  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3508  TPR repeat-containing protein  35.29 
 
 		 426 aa  45.1  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  33.73 
 
 		 622 aa  45.1  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  26.32 
 
 		 520 aa  45.1  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3330  TPR repeat-containing protein  27.13 
 
 		 1038 aa  45.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0280  tetratricopeptide TPR_4  25.31 
 
 		 584 aa  45.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1566  TPR repeat-containing protein  32.32 
 
 		 738 aa  44.7  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.411848  hitchhiker  0.00925631 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.68 
 
 		 2240 aa  44.3  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0588  TPR repeat-containing protein  26.67 
 
 		 613 aa  43.9  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.498138  decreased coverage  0.00128079 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03050  ubiquitin-protein ligase, putative  31.13 
 
 		 773 aa  43.9  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>