More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_5555 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010087  Bmul_5555  type II secretion system protein E  100 
 
 
770 aa  1582    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.095618 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6561  type II secretion system protein E  68.83 
 
 
755 aa  1081    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4246  type II secretion system protein E  28.89 
 
 
596 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3702  type II secretion system protein E  29.92 
 
 
618 aa  158  4e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4762  type II secretion system protein E  25.96 
 
 
641 aa  146  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228994  normal  0.63689 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  26.6 
 
 
616 aa  139  1e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6291  type II secretion system protein E  29.73 
 
 
605 aa  140  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563661  normal 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4235  type II secretion system protein E  26.53 
 
 
655 aa  135  3e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  26.88 
 
 
594 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  27.12 
 
 
506 aa  130  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0360  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein T  25.74 
 
 
503 aa  129  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.547799  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  29.44 
 
 
576 aa  129  2.0000000000000002e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  26.02 
 
 
510 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  30.6 
 
 
573 aa  126  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  26.23 
 
 
543 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  32.79 
 
 
568 aa  122  3e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  30.84 
 
 
578 aa  121  3.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  27.44 
 
 
518 aa  121  3.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  27 
 
 
544 aa  120  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  30.66 
 
 
575 aa  120  9e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  24.75 
 
 
560 aa  120  9.999999999999999e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  27.02 
 
 
538 aa  120  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  28.75 
 
 
569 aa  120  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  26.44 
 
 
517 aa  119  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  25.54 
 
 
577 aa  118  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  28.19 
 
 
570 aa  117  6e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  26.6 
 
 
467 aa  117  6.9999999999999995e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7246  type II secretion system protein E  23.05 
 
 
672 aa  117  8.999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3483  type II secretion system protein E  26.46 
 
 
598 aa  117  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  26.89 
 
 
520 aa  116  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  30.29 
 
 
563 aa  116  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  26.97 
 
 
520 aa  116  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2288  type II secretion system protein E  26.23 
 
 
598 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0404074  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  26.75 
 
 
514 aa  115  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  29.32 
 
 
558 aa  115  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  30.38 
 
 
560 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  25.41 
 
 
621 aa  115  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  27.99 
 
 
604 aa  114  6e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3153  type II secretion system protein E  26.64 
 
 
684 aa  114  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4400  type II secretion system protein E  31.58 
 
 
575 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  28.66 
 
 
585 aa  114  9e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  30.89 
 
 
545 aa  114  9e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3763  hypothetical protein  28.25 
 
 
490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  26.26 
 
 
599 aa  114  1.0000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3576  hypothetical protein  27.98 
 
 
490 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356057  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  30.66 
 
 
566 aa  113  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1621  type II secretion system protein E  26.75 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.143192  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  28.53 
 
 
490 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3152  type II secretion system protein E  26.06 
 
 
677 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  29.6 
 
 
580 aa  112  2.0000000000000002e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  28.46 
 
 
611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  26.67 
 
 
545 aa  113  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  29.17 
 
 
612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  28.37 
 
 
514 aa  112  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  29.17 
 
 
578 aa  112  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  25.74 
 
 
513 aa  112  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  26.88 
 
 
517 aa  112  4.0000000000000004e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  25.05 
 
 
493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  25.05 
 
 
493 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  25.05 
 
 
493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  25.74 
 
 
526 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  25.05 
 
 
493 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  25.05 
 
 
493 aa  112  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2609  type IV pilus assembly protein, putative  27.01 
 
 
645 aa  111  5e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  28.12 
 
 
519 aa  111  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  28.33 
 
 
497 aa  111  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  28.33 
 
 
497 aa  111  5e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3029  general secretion pathway protein E  27.3 
 
 
550 aa  111  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599486  hitchhiker  0.00121357 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  27.01 
 
 
806 aa  111  6e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  27.56 
 
 
823 aa  111  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  29.26 
 
 
553 aa  111  6e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1659  type II secretion system protein E  26.22 
 
 
785 aa  111  6e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.233969  normal  0.903835 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  30.03 
 
 
599 aa  111  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  28.32 
 
 
565 aa  110  7.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1818  general secretory pathway protein E  26.57 
 
 
519 aa  110  7.000000000000001e-23  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  27.56 
 
 
502 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2634  type II secretion system protein E  25.75 
 
 
626 aa  111  7.000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  30.03 
 
 
599 aa  110  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  28.72 
 
 
578 aa  110  9.000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  28.17 
 
 
482 aa  110  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1644  general secretory pathway protein E  26.57 
 
 
519 aa  110  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.161212  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  26.09 
 
 
586 aa  110  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1464  general secretory pathway protein E  26.57 
 
 
519 aa  110  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  27.16 
 
 
520 aa  110  1e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  27.27 
 
 
502 aa  109  2e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  25.59 
 
 
489 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2463  type II secretion system protein E  25.16 
 
 
596 aa  109  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3585  type II secretion system protein E  28.5 
 
 
832 aa  109  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  27.89 
 
 
570 aa  109  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  28.61 
 
 
611 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  30.13 
 
 
520 aa  108  3e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  25.27 
 
 
559 aa  108  3e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  30.13 
 
 
520 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  26.22 
 
 
573 aa  108  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0626  hypothetical protein  29.23 
 
 
473 aa  108  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  28.05 
 
 
497 aa  108  4e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  25.37 
 
 
558 aa  108  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  29.26 
 
 
569 aa  108  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29150  type II secretion system protein E  25.9 
 
 
568 aa  108  4e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0342357  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2989  type II secretion system protein E  28.41 
 
 
636 aa  108  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>