More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0772 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  93.68 
 
 
536 aa  952    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  93.87 
 
 
536 aa  953    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  68.53 
 
 
544 aa  677    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  93.87 
 
 
536 aa  954    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  64.27 
 
 
594 aa  646    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  100 
 
 
538 aa  1089    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  94.42 
 
 
536 aa  990    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  65.75 
 
 
506 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  93.68 
 
 
536 aa  952    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  93.68 
 
 
536 aa  952    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  46.56 
 
 
518 aa  416  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  46.44 
 
 
520 aa  415  9.999999999999999e-116  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  38.99 
 
 
526 aa  326  6e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  38.59 
 
 
513 aa  323  5e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  38.74 
 
 
543 aa  303  6.000000000000001e-81  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  33.6 
 
 
499 aa  294  3e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  34.48 
 
 
517 aa  263  8e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  36.39 
 
 
517 aa  238  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5434  type II secretion system protein E  33.07 
 
 
609 aa  213  9e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5028  type II secretion system protein E  33.07 
 
 
609 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  30.02 
 
 
510 aa  207  4e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  33.91 
 
 
558 aa  196  8.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  34.09 
 
 
520 aa  196  1e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  33.76 
 
 
616 aa  196  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  31.65 
 
 
462 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  33.33 
 
 
594 aa  191  4e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  29.68 
 
 
569 aa  189  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  35.18 
 
 
520 aa  188  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  31.22 
 
 
502 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  35.18 
 
 
520 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  31.97 
 
 
563 aa  187  3e-46  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  39.38 
 
 
513 aa  187  4e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  35.5 
 
 
486 aa  187  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  35.01 
 
 
521 aa  186  7e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  32.23 
 
 
571 aa  186  8e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  31.9 
 
 
462 aa  186  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  35.25 
 
 
477 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  33.83 
 
 
511 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  35.09 
 
 
521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  35.22 
 
 
509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  34.62 
 
 
746 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  35.09 
 
 
521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  33.25 
 
 
553 aa  185  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  35.09 
 
 
521 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  34.34 
 
 
521 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  33.84 
 
 
514 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  35.09 
 
 
521 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  35.09 
 
 
523 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  34.53 
 
 
603 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  35.26 
 
 
521 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  31.37 
 
 
806 aa  183  6e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  35.01 
 
 
521 aa  183  6e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0629  type II secretion system protein E  34.18 
 
 
519 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  32.58 
 
 
577 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  35.34 
 
 
522 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  32.04 
 
 
787 aa  182  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  35.6 
 
 
571 aa  182  2e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  35.34 
 
 
495 aa  182  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  37.93 
 
 
491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  32.92 
 
 
567 aa  181  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  31.37 
 
 
482 aa  181  4e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  37.7 
 
 
554 aa  181  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  34.22 
 
 
599 aa  180  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  35.85 
 
 
521 aa  180  5.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  31.07 
 
 
570 aa  180  5.999999999999999e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  34.5 
 
 
520 aa  180  7e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  33.98 
 
 
599 aa  179  8e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  33.57 
 
 
477 aa  179  9e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  32.12 
 
 
467 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  33.5 
 
 
578 aa  179  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  33.75 
 
 
503 aa  179  1e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  34.09 
 
 
514 aa  178  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  30.88 
 
 
546 aa  178  2e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  32.33 
 
 
502 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  33.5 
 
 
489 aa  177  3e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  33.08 
 
 
610 aa  177  3e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  32.34 
 
 
502 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  29.81 
 
 
846 aa  177  4e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  35.09 
 
 
499 aa  177  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  34.22 
 
 
599 aa  177  5e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  32.83 
 
 
521 aa  177  5e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  34.16 
 
 
611 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  33.92 
 
 
524 aa  177  6e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  33.24 
 
 
570 aa  177  6e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  34.64 
 
 
500 aa  176  7e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  34.34 
 
 
523 aa  176  7e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  33.33 
 
 
494 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  28.27 
 
 
560 aa  176  8e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  31.84 
 
 
871 aa  176  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  32.11 
 
 
495 aa  176  9e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  30.54 
 
 
575 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  32.28 
 
 
885 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  29.55 
 
 
557 aa  176  9.999999999999999e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  33.84 
 
 
523 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  35.43 
 
 
474 aa  176  9.999999999999999e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  31.16 
 
 
577 aa  175  1.9999999999999998e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0160  hypothetical protein  33.49 
 
 
461 aa  175  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  34.59 
 
 
499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  34.59 
 
 
499 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  31.65 
 
 
553 aa  175  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>