More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_59290 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  100 
 
 		 526 aa  1088    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  98.44 
 
 		 513 aa  1047    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  47.13 
 
 		 543 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  40.97 
 
 		 544 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 518 aa  333  5e-90  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  43.75 
 
 		 520 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  37.05 
 
 		 499 aa  322  7e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  40 
 
 		 594 aa  322  8e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  39.84 
 
 		 506 aa  321  1.9999999999999998e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  38.99 
 
 		 538 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  39.39 
 
 		 536 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  39.39 
 
 		 536 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  39.39 
 
 		 536 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  39.39 
 
 		 536 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  39.19 
 
 		 536 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  39.19 
 
 		 536 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  39.4 
 
 		 517 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  38.91 
 
 		 517 aa  303  7.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  34.84 
 
 		 616 aa  226  6e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  29.88 
 
 		 510 aa  224  3e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0629  type II secretion system protein E  32.17 
 
 		 519 aa  203  8e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  33.66 
 
 		 514 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 514 aa  189  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  33.91 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  32.97 
 
 		 569 aa  188  2e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  33.66 
 
 		 523 aa  186  9e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  33.66 
 
 		 521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  33.42 
 
 		 521 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  36.39 
 
 		 523 aa  184  3e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  33.33 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  33.76 
 
 		 787 aa  183  8.000000000000001e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  35.9 
 
 		 521 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  34.65 
 
 		 558 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1163  type II secretion system protein E  30.45 
 
 		 782 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  31.27 
 
 		 462 aa  181  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  35.24 
 
 		 521 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  35.24 
 
 		 521 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  33.83 
 
 		 561 aa  181  4e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  35.24 
 
 		 521 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  35.24 
 
 		 521 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  33.58 
 
 		 524 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  34.43 
 
 		 553 aa  180  5.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  34.24 
 
 		 561 aa  180  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  35.53 
 
 		 523 aa  179  8e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  33.5 
 
 		 520 aa  179  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  33.07 
 
 		 553 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  36.76 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0360  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein T  31.71 
 
 		 503 aa  178  3e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.547799  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  36.76 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0931  type II secretion system protein E  31.98 
 
 		 551 aa  177  3e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.1993  normal  0.0211669 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  36.47 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  31.88 
 
 		 570 aa  177  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  36.47 
 
 		 497 aa  177  5e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 583 aa  176  9e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  36.18 
 
 		 497 aa  176  9e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1133  type II secretion system protein  29.7 
 
 		 778 aa  176  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  31.83 
 
 		 462 aa  176  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1351  type II secretion system protein GspE  29.46 
 
 		 778 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  36.02 
 
 		 554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  34.5 
 
 		 503 aa  175  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  29.22 
 
 		 871 aa  175  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  32.95 
 
 		 494 aa  174  5e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  34.33 
 
 		 553 aa  173  5.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  30.67 
 
 		 571 aa  173  6.999999999999999e-42  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  35.63 
 
 		 484 aa  172  1e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  31.89 
 
 		 558 aa  172  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  29.8 
 
 		 561 aa  172  2e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  36.31 
 
 		 482 aa  172  2e-41  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  34.29 
 
 		 567 aa  171  2e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  32.11 
 
 		 499 aa  171  3e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  32.93 
 
 		 885 aa  171  4e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  34.32 
 
 		 500 aa  171  4e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  32.74 
 
 		 578 aa  170  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  33.6 
 
 		 565 aa  169  8e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  32.34 
 
 		 520 aa  169  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  29.95 
 
 		 558 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  33.78 
 
 		 563 aa  169  9e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  34.92 
 
 		 502 aa  169  9e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  30.2 
 
 		 598 aa  169  9e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  34.67 
 
 		 477 aa  169  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  34.02 
 
 		 501 aa  169  1e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  32.99 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  31.04 
 
 		 578 aa  169  1e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  32.23 
 
 		 417 aa  169  1e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  34.91 
 
 		 566 aa  168  2e-40  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  33.15 
 
 		 568 aa  168  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  31.77 
 
 		 585 aa  168  2e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  31.88 
 
 		 583 aa  169  2e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  34.92 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  30.56 
 
 		 561 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  33.14 
 
 		 566 aa  168  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  35.07 
 
 		 503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  34.65 
 
 		 490 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  31.55 
 
 		 555 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  32.38 
 
 		 511 aa  167  4e-40  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  31.03 
 
 		 557 aa  167  4e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  35.45 
 
 		 586 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  35.33 
 
 		 595 aa  167  5.9999999999999996e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  31.74 
 
 		 573 aa  166  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  34.65 
 
 		 566 aa  166  6.9999999999999995e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>