More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0617 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  100 
 
 		 467 aa  947    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3196  type II general secretion pathway (GSP) E protein  55.72 
 
 		 478 aa  524  1e-147  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  55.84 
 
 		 477 aa  518  1e-146  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  45.58 
 
 		 558 aa  352  7e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  46.51 
 
 		 558 aa  352  8e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.41 
 
 		 568 aa  349  6e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  45.89 
 
 		 501 aa  349  7e-95  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  41.08 
 
 		 559 aa  349  7e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  48.41 
 
 		 562 aa  347  2e-94  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  39.64 
 
 		 787 aa  347  3e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.21 
 
 		 568 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40.41 
 
 		 568 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.21 
 
 		 568 aa  346  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  39.29 
 
 		 561 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  45.87 
 
 		 499 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  46.67 
 
 		 495 aa  343  4e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  46.4 
 
 		 522 aa  343  5e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  38.53 
 
 		 482 aa  342  1e-92  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.04 
 
 		 568 aa  341  1e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  39.46 
 
 		 558 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  46.13 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  45.12 
 
 		 494 aa  341  2e-92  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  41.09 
 
 		 569 aa  341  2e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  46.54 
 
 		 482 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  46.13 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  45.87 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  45.87 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  46.13 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  45.33 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.78 
 
 		 562 aa  340  2.9999999999999998e-92  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  45.33 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  45.33 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  45.33 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  45.33 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  45.33 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  45.33 
 
 		 497 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  45.87 
 
 		 498 aa  340  4e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  45.33 
 
 		 497 aa  339  5e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  39.47 
 
 		 486 aa  339  8e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  45.12 
 
 		 494 aa  339  8e-92  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  45.93 
 
 		 568 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  46.01 
 
 		 482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  44.88 
 
 		 494 aa  338  1.9999999999999998e-91  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.17 
 
 		 568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.34 
 
 		 568 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  45.24 
 
 		 515 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  44.15 
 
 		 505 aa  336  3.9999999999999995e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.88 
 
 		 568 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  46.3 
 
 		 566 aa  336  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  43.34 
 
 		 507 aa  336  5e-91  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.44 
 
 		 568 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  45.79 
 
 		 871 aa  335  7.999999999999999e-91  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.19 
 
 		 568 aa  335  7.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1044  type II secretion system protein E  46.51 
 
 		 482 aa  335  1e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1047  type II secretion system protein E  45.74 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  44.2 
 
 		 497 aa  334  2e-90  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  41.33 
 
 		 484 aa  333  3e-90  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  37.94 
 
 		 570 aa  333  3e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  39.21 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  39.21 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  44.8 
 
 		 468 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  39.21 
 
 		 493 aa  333  4e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  40 
 
 		 497 aa  333  5e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  39.33 
 
 		 497 aa  333  5e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  40 
 
 		 497 aa  333  5e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  39.14 
 
 		 498 aa  333  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  39.33 
 
 		 497 aa  332  8e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.89 
 
 		 569 aa  332  8e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  38.98 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  44 
 
 		 469 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.07 
 
 		 565 aa  331  2e-89  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  44.05 
 
 		 503 aa  330  2e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.41 
 
 		 563 aa  330  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  45.67 
 
 		 579 aa  330  2e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  38.98 
 
 		 493 aa  331  2e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  39.11 
 
 		 497 aa  331  2e-89  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  47.48 
 
 		 561 aa  331  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.9 
 
 		 571 aa  331  2e-89  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  42.71 
 
 		 513 aa  330  3e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.45 
 
 		 570 aa  330  4e-89  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  48.66 
 
 		 571 aa  330  4e-89  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  45.82 
 
 		 566 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  45.71 
 
 		 563 aa  329  6e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.71 
 
 		 569 aa  329  6e-89  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.42 
 
 		 569 aa  329  6e-89  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.15 
 
 		 570 aa  329  7e-89  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  43.16 
 
 		 556 aa  329  7e-89  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  44.12 
 
 		 502 aa  329  7e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  50.44 
 
 		 569 aa  329  8e-89  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  44.83 
 
 		 576 aa  329  8e-89  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.15 
 
 		 570 aa  329  8e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  44.41 
 
 		 577 aa  328  9e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.15 
 
 		 570 aa  328  9e-89  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  44.12 
 
 		 502 aa  328  9e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  44.56 
 
 		 498 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  40.95 
 
 		 523 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  44 
 
 		 471 aa  328  1.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.71 
 
 		 569 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.84 
 
 		 569 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  42.26 
 
 		 553 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>