More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CHU_3196 on replicon NC_008255
Organism: Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008255  CHU_3196  type II general secretion pathway (GSP) E protein  100 
 
 		 478 aa  989    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  59.87 
 
 		 477 aa  606  9.999999999999999e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  55.72 
 
 		 467 aa  524  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  45.97 
 
 		 497 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  45.97 
 
 		 497 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  45.97 
 
 		 497 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  45.97 
 
 		 497 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  47.43 
 
 		 787 aa  346  5e-94  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  45.97 
 
 		 497 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  45.97 
 
 		 497 aa  346  5e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  45.43 
 
 		 515 aa  346  5e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  45.97 
 
 		 497 aa  346  5e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  45.16 
 
 		 522 aa  345  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  44.89 
 
 		 495 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  39.26 
 
 		 558 aa  343  4e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.04 
 
 		 568 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.04 
 
 		 568 aa  342  5.999999999999999e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  45.97 
 
 		 497 aa  342  7e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  44.62 
 
 		 499 aa  342  8e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  45.19 
 
 		 499 aa  341  1e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  45.19 
 
 		 499 aa  342  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40 
 
 		 568 aa  341  2e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  41.22 
 
 		 562 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  45.19 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  45.19 
 
 		 499 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  44.92 
 
 		 498 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.93 
 
 		 568 aa  339  7e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  45.09 
 
 		 558 aa  338  9e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  43.62 
 
 		 503 aa  338  9.999999999999999e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  39.67 
 
 		 871 aa  338  9.999999999999999e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  39.53 
 
 		 568 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  43.98 
 
 		 505 aa  337  1.9999999999999998e-91  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  44.92 
 
 		 499 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  43.5 
 
 		 513 aa  337  3.9999999999999995e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  44.83 
 
 		 502 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 561 aa  335  9e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  43.88 
 
 		 502 aa  335  9e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  45.7 
 
 		 514 aa  334  2e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  44.09 
 
 		 501 aa  334  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.38 
 
 		 568 aa  333  3e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  42.22 
 
 		 503 aa  332  7.000000000000001e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  41.94 
 
 		 559 aa  332  8e-90  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  42.02 
 
 		 493 aa  332  9e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  44.27 
 
 		 486 aa  332  9e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  42.02 
 
 		 493 aa  332  9e-90  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  42.02 
 
 		 493 aa  332  9e-90  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  47.72 
 
 		 490 aa  331  1e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.61 
 
 		 568 aa  332  1e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  44.79 
 
 		 507 aa  332  1e-89  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  43.16 
 
 		 520 aa  331  2e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  41.78 
 
 		 493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  41.78 
 
 		 493 aa  330  5.0000000000000004e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  37.93 
 
 		 585 aa  330  5.0000000000000004e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  44.12 
 
 		 494 aa  329  8e-89  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  43.01 
 
 		 487 aa  328  9e-89  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.49 
 
 		 574 aa  328  9e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  41.84 
 
 		 500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  41.75 
 
 		 559 aa  328  1.0000000000000001e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.02 
 
 		 568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  45.19 
 
 		 571 aa  328  1.0000000000000001e-88  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.36 
 
 		 568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  42.63 
 
 		 489 aa  327  2.0000000000000001e-88  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  44.09 
 
 		 469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.5 
 
 		 553 aa  328  2.0000000000000001e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.39 
 
 		 572 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  35.77 
 
 		 561 aa  328  2.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  43.92 
 
 		 553 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  44.09 
 
 		 469 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  36.99 
 
 		 553 aa  327  2.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  45.36 
 
 		 563 aa  327  3e-88  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  38.75 
 
 		 583 aa  327  3e-88  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  39.25 
 
 		 520 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  45.26 
 
 		 579 aa  327  3e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  46.22 
 
 		 562 aa  327  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  40.52 
 
 		 538 aa  327  3e-88  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  44 
 
 		 514 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.1 
 
 		 568 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  44.12 
 
 		 494 aa  326  5e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.98 
 
 		 568 aa  325  8.000000000000001e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  43.85 
 
 		 495 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  43.11 
 
 		 522 aa  325  1e-87  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  43.86 
 
 		 497 aa  325  1e-87  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.19 
 
 		 571 aa  324  2e-87  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  42.47 
 
 		 520 aa  323  3e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.7 
 
 		 555 aa  324  3e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  36.38 
 
 		 558 aa  323  3e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  42.22 
 
 		 497 aa  323  4e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  46.43 
 
 		 561 aa  323  5e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  39.06 
 
 		 520 aa  323  5e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  46.6 
 
 		 561 aa  323  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  42.45 
 
 		 572 aa  323  5e-87  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  42.67 
 
 		 554 aa  323  5e-87  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  42.63 
 
 		 497 aa  322  6e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  42.59 
 
 		 515 aa  323  6e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  42.37 
 
 		 497 aa  323  6e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  43.16 
 
 		 520 aa  322  7e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.13 
 
 		 562 aa  322  8e-87  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  43.16 
 
 		 520 aa  322  8e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  43.19 
 
 		 484 aa  322  9.000000000000001e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  43.01 
 
 		 482 aa  321  9.999999999999999e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>