More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6291 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007972  Rmet_6291  type II secretion system protein E  100 
 
 		 605 aa  1249    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563661  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4762  type II secretion system protein E  38.7 
 
 		 641 aa  402  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228994  normal  0.63689 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7246  type II secretion system protein E  32.48 
 
 		 672 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4235  type II secretion system protein E  30.37 
 
 		 655 aa  253  8.000000000000001e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5555  type II secretion system protein E  29.73 
 
 		 770 aa  157  4e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.095618 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6561  type II secretion system protein E  29.88 
 
 		 755 aa  154  5e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3702  type II secretion system protein E  26.71 
 
 		 618 aa  129  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  27.83 
 
 		 616 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3239  type II secretion system protein E  27 
 
 		 600 aa  114  6e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0590846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  26.97 
 
 		 603 aa  113  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0360  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein T  25.23 
 
 		 503 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.547799  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0585  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 392 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  27.89 
 
 		 578 aa  110  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 613 aa  110  1e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  29.61 
 
 		 546 aa  108  3e-22  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  29.13 
 
 		 604 aa  108  4e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  29.06 
 
 		 611 aa  107  5e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 550 aa  107  8e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  26.65 
 
 		 598 aa  106  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  26.65 
 
 		 598 aa  106  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5395  type II secretion system protein E  27.14 
 
 		 600 aa  106  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1249  type II secretion system protein E  26.2 
 
 		 595 aa  105  3e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 579 aa  103  6e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4246  type II secretion system protein E  24.14 
 
 		 596 aa  103  7e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  25.24 
 
 		 502 aa  103  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  31.74 
 
 		 611 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  31.74 
 
 		 611 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  31.49 
 
 		 611 aa  103  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  29.09 
 
 		 594 aa  103  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 599 aa  103  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.21 
 
 		 571 aa  102  2e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  28.38 
 
 		 613 aa  102  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  30.47 
 
 		 500 aa  102  3e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  30.66 
 
 		 501 aa  101  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  30.19 
 
 		 503 aa  101  4e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  27.89 
 
 		 575 aa  100  5e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  27.33 
 
 		 578 aa  100  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  31.44 
 
 		 611 aa  100  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  26.81 
 
 		 594 aa  100  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3214  type II secretion system protein E  28.33 
 
 		 595 aa  99.8  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  29.79 
 
 		 559 aa  99.8  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  27.82 
 
 		 497 aa  99.8  1e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  27.45 
 
 		 563 aa  100  1e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  26.91 
 
 		 577 aa  99  2e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  28.33 
 
 		 513 aa  99.4  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  25.81 
 
 		 506 aa  99.4  2e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.8 
 
 		 571 aa  99  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  28.49 
 
 		 511 aa  99  2e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 597 aa  98.6  3e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 599 aa  98.2  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  31.56 
 
 		 599 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  31.56 
 
 		 599 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  26.27 
 
 		 467 aa  97.4  6e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 601 aa  97.4  6e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  28.21 
 
 		 564 aa  97.1  9e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  26.12 
 
 		 527 aa  96.3  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  27.3 
 
 		 571 aa  96.3  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  27.17 
 
 		 787 aa  96.7  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  27.68 
 
 		 515 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12090  type IV pilus assembly protein  27.27 
 
 		 566 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  26.87 
 
 		 526 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2310  type II secretion system protein E  29.25 
 
 		 615 aa  95.5  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  26.4 
 
 		 514 aa  95.5  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.48 
 
 		 572 aa  96.3  2e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  25.86 
 
 		 558 aa  96.3  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  27.13 
 
 		 567 aa  95.9  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  26.76 
 
 		 553 aa  95.1  3e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  27.4 
 
 		 558 aa  95.1  3e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0889  type II secretion system protein  26.19 
 
 		 595 aa  95.1  3e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.691436 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  26.59 
 
 		 513 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  28.06 
 
 		 568 aa  94.7  4e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  28.17 
 
 		 499 aa  95.1  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  27.47 
 
 		 595 aa  94.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  25.95 
 
 		 595 aa  94.7  4e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  25.6 
 
 		 885 aa  94.4  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  29.26 
 
 		 474 aa  94  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  27.11 
 
 		 563 aa  94.4  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  26.35 
 
 		 484 aa  94  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  31.15 
 
 		 495 aa  94  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  30.35 
 
 		 497 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  30.35 
 
 		 497 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  30.35 
 
 		 497 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  30.35 
 
 		 497 aa  93.6  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  30.35 
 
 		 497 aa  93.6  9e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  30.35 
 
 		 497 aa  93.6  9e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  30.35 
 
 		 497 aa  93.6  9e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.82 
 
 		 569 aa  93.6  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  31.91 
 
 		 533 aa  93.2  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3859  type II secretion system protein E  26.6 
 
 		 568 aa  93.2  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  30.35 
 
 		 498 aa  93.2  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.55 
 
 		 568 aa  93.6  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  30.35 
 
 		 497 aa  93.2  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  29.02 
 
 		 568 aa  92.8  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.55 
 
 		 568 aa  93.2  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  30.38 
 
 		 522 aa  93.2  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  30.35 
 
 		 499 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  30.35 
 
 		 499 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0392  putative type II protein secretion system E protein CtsE  26.07 
 
 		 504 aa  92.8  1e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  29.38 
 
 		 494 aa  92.4  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  30.35 
 
 		 499 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>