More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0585 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_0585  type II secretion system protein E  100 
 
 		 392 aa  782    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  49.07 
 
 		 558 aa  357  1.9999999999999998e-97  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  45.26 
 
 		 498 aa  339  5e-92  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  48.15 
 
 		 570 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  46.95 
 
 		 558 aa  336  5e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  46.19 
 
 		 497 aa  335  5e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  46.19 
 
 		 497 aa  336  5e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  48.55 
 
 		 562 aa  335  5.999999999999999e-91  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  46.19 
 
 		 497 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  48.02 
 
 		 563 aa  334  1e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  46.19 
 
 		 497 aa  334  1e-90  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  46.19 
 
 		 556 aa  332  8e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  45.67 
 
 		 497 aa  332  8e-90  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.65 
 
 		 578 aa  332  1e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  44.21 
 
 		 515 aa  330  2e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  46.58 
 
 		 571 aa  330  2e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  43.42 
 
 		 495 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.81 
 
 		 553 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  43.27 
 
 		 499 aa  329  5.0000000000000004e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.36 
 
 		 578 aa  329  5.0000000000000004e-89  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.59 
 
 		 577 aa  329  6e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.59 
 
 		 577 aa  329  6e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  44.91 
 
 		 570 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  44.19 
 
 		 513 aa  328  1.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  46.92 
 
 		 871 aa  327  2.0000000000000001e-88  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.65 
 
 		 555 aa  326  3e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  43.65 
 
 		 498 aa  327  3e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  43.6 
 
 		 578 aa  327  3e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  42.74 
 
 		 499 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  42.74 
 
 		 499 aa  326  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  43.01 
 
 		 498 aa  326  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  43.01 
 
 		 497 aa  325  6e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  45.12 
 
 		 521 aa  325  1e-87  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.33 
 
 		 580 aa  325  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.9 
 
 		 553 aa  324  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  42.74 
 
 		 497 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  42.74 
 
 		 497 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  42.74 
 
 		 497 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  42.74 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  44.59 
 
 		 523 aa  323  2e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  42.74 
 
 		 497 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  42.74 
 
 		 497 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  42.63 
 
 		 522 aa  324  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  42.74 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  42.74 
 
 		 497 aa  323  2e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  44.88 
 
 		 417 aa  324  2e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  42.74 
 
 		 499 aa  324  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  42.74 
 
 		 497 aa  323  2e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  42.71 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  42.71 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  43.68 
 
 		 498 aa  323  3e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  42.71 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  42.71 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  42.71 
 
 		 493 aa  323  3e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.39 
 
 		 568 aa  323  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  46.6 
 
 		 482 aa  323  4e-87  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  44.91 
 
 		 583 aa  323  4e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  44.33 
 
 		 471 aa  323  5e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  45.91 
 
 		 519 aa  322  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.18 
 
 		 568 aa  321  9.999999999999999e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  44.59 
 
 		 577 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  44.3 
 
 		 503 aa  321  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  44.59 
 
 		 523 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  44.59 
 
 		 521 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  47.76 
 
 		 787 aa  321  9.999999999999999e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  44.33 
 
 		 521 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12090  type IV pilus assembly protein  43.01 
 
 		 566 aa  321  1.9999999999999998e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  44.62 
 
 		 583 aa  320  1.9999999999999998e-86  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  44.85 
 
 		 521 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  44.94 
 
 		 569 aa  321  1.9999999999999998e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  45.67 
 
 		 563 aa  321  1.9999999999999998e-86  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  45.12 
 
 		 524 aa  320  3e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3108  type II secretion system protein E  43.85 
 
 		 573 aa  320  3e-86  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.275217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  44.06 
 
 		 503 aa  319  3.9999999999999996e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  42.75 
 
 		 468 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  44.1 
 
 		 482 aa  319  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1047  type II secretion system protein E  44.1 
 
 		 483 aa  319  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  44.83 
 
 		 559 aa  319  5e-86  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.38 
 
 		 568 aa  319  6e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  44.3 
 
 		 555 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  41.97 
 
 		 469 aa  318  7e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  44.1 
 
 		 482 aa  319  7e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.57 
 
 		 553 aa  319  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  43.15 
 
 		 570 aa  319  7e-86  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  42.05 
 
 		 585 aa  318  7.999999999999999e-86  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  43.62 
 
 		 579 aa  318  7.999999999999999e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  44.59 
 
 		 523 aa  318  9e-86  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  44.88 
 
 		 561 aa  318  9e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.12 
 
 		 571 aa  318  9e-86  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  45.41 
 
 		 583 aa  318  1e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  43.8 
 
 		 514 aa  318  1e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  41.97 
 
 		 469 aa  318  1e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  42.74 
 
 		 501 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  44.06 
 
 		 520 aa  318  1e-85  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  44.47 
 
 		 564 aa  317  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  43.92 
 
 		 568 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  44.3 
 
 		 563 aa  317  2e-85  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  43.42 
 
 		 498 aa  317  2e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  44.18 
 
 		 561 aa  317  3e-85  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1044  type II secretion system protein E  43.77 
 
 		 482 aa  317  3e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>