More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3702 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3702  type II secretion system protein E  100 
 
 		 618 aa  1268    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6561  type II secretion system protein E  30.6 
 
 		 755 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  27.52 
 
 		 616 aa  173  5.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5555  type II secretion system protein E  29.92 
 
 		 770 aa  170  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.095618 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4246  type II secretion system protein E  26.39 
 
 		 596 aa  151  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4762  type II secretion system protein E  28.97 
 
 		 641 aa  144  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228994  normal  0.63689 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  28.31 
 
 		 544 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6291  type II secretion system protein E  27.07 
 
 		 605 aa  133  7.999999999999999e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  26.28 
 
 		 502 aa  130  9.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  29.69 
 
 		 538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  23.08 
 
 		 520 aa  127  5e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7246  type II secretion system protein E  27.35 
 
 		 672 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  24.77 
 
 		 518 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  28.79 
 
 		 536 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  28.79 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  28.79 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  28.79 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  28.79 
 
 		 536 aa  122  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  28.79 
 
 		 536 aa  121  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4235  type II secretion system protein E  28.25 
 
 		 655 aa  121  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  27.54 
 
 		 594 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  27.77 
 
 		 506 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0360  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein T  27.93 
 
 		 503 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.547799  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  26.5 
 
 		 621 aa  117  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  28.22 
 
 		 517 aa  116  1.0000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  26.35 
 
 		 517 aa  113  9e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  30.97 
 
 		 871 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  26.79 
 
 		 553 aa  110  5e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  29.19 
 
 		 545 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  29.68 
 
 		 561 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  27.86 
 
 		 599 aa  109  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  26.45 
 
 		 583 aa  108  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  31.53 
 
 		 561 aa  106  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  27.21 
 
 		 521 aa  106  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  25.45 
 
 		 560 aa  105  2e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  27.19 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 567 aa  105  2e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  27.21 
 
 		 521 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  26.97 
 
 		 514 aa  105  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  25.95 
 
 		 526 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  27.98 
 
 		 523 aa  105  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  27.21 
 
 		 521 aa  105  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  27.5 
 
 		 513 aa  105  3e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  27.63 
 
 		 553 aa  103  9e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  27.21 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  26.71 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  26.71 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  24.77 
 
 		 571 aa  103  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  26.71 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  26.71 
 
 		 521 aa  103  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  28.76 
 
 		 558 aa  102  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  28.5 
 
 		 559 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  26.45 
 
 		 603 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  25.67 
 
 		 585 aa  102  2e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  25.53 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  27.6 
 
 		 503 aa  101  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1189  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like  32.23 
 
 		 594 aa  102  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  27.27 
 
 		 559 aa  102  3e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  26.82 
 
 		 570 aa  101  3e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  30.98 
 
 		 558 aa  101  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  28 
 
 		 585 aa  101  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  28.24 
 
 		 566 aa  101  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  31.42 
 
 		 561 aa  101  4e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  25.4 
 
 		 583 aa  101  4e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3196  type II general secretion pathway (GSP) E protein  26.25 
 
 		 478 aa  101  4e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3859  type II secretion system protein E  26.03 
 
 		 568 aa  101  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  27.32 
 
 		 583 aa  101  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  29.33 
 
 		 527 aa  101  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  27.81 
 
 		 493 aa  100  6e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  27.81 
 
 		 493 aa  100  6e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  27.81 
 
 		 493 aa  100  6e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  27.23 
 
 		 547 aa  100  6e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  27.21 
 
 		 514 aa  100  7e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0931  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 551 aa  100  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.1993  normal  0.0211669 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  28.15 
 
 		 493 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  28.15 
 
 		 493 aa  100  8e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  28.18 
 
 		 576 aa  100  1e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2655  type II secretion system protein E  30.48 
 
 		 432 aa  100  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  30.92 
 
 		 566 aa  99.8  1e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  26.62 
 
 		 520 aa  99.8  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  28.27 
 
 		 543 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  26.9 
 
 		 577 aa  99  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  26.64 
 
 		 568 aa  99.4  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014214  Mesil_3585  type II secretion system protein E  30.24 
 
 		 832 aa  99  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  27.85 
 
 		 501 aa  98.6  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  27.88 
 
 		 572 aa  98.6  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  26.51 
 
 		 520 aa  98.2  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1990  hypothetical protein  29.67 
 
 		 344 aa  98.2  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  26.81 
 
 		 500 aa  98.2  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  26.93 
 
 		 558 aa  98.2  4e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  26.5 
 
 		 510 aa  98.2  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  34.44 
 
 		 591 aa  97.8  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  26.16 
 
 		 599 aa  97.8  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  34.76 
 
 		 613 aa  97.8  5e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5434  type II secretion system protein E  24.12 
 
 		 609 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  27.49 
 
 		 523 aa  97.8  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5028  type II secretion system protein E  24.12 
 
 		 609 aa  97.8  5e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  27.93 
 
 		 567 aa  97.4  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  26.16 
 
 		 599 aa  97.4  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>