More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS02972 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  100 
 
 		 561 aa  1125    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  55.7 
 
 		 570 aa  616  1e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  58.05 
 
 		 567 aa  611  1e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  56.74 
 
 		 558 aa  604  1.0000000000000001e-171  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  59.29 
 
 		 566 aa  593  1e-168  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1982  type II secretion system protein E  56.55 
 
 		 573 aa  593  1e-168  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981524  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  56.45 
 
 		 599 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3223  type II secretion system protein E  56.93 
 
 		 564 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29150  type II secretion system protein E  55.86 
 
 		 568 aa  559  1e-158  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0342357  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  55.15 
 
 		 567 aa  553  1e-156  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  57.98 
 
 		 559 aa  552  1e-156  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4711  type II secretion system protein E  53.26 
 
 		 568 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3483  type II secretion system protein E  54.84 
 
 		 598 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2288  type II secretion system protein E  54.84 
 
 		 598 aa  528  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0404074  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  57.06 
 
 		 580 aa  525  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2463  type II secretion system protein E  51.42 
 
 		 596 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2454  type II secretion system protein E  54.35 
 
 		 557 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  51.1 
 
 		 576 aa  503  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  54.12 
 
 		 573 aa  492  9.999999999999999e-139  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  52.77 
 
 		 578 aa  484  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  54.15 
 
 		 574 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  53.75 
 
 		 574 aa  478  1e-134  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  52.29 
 
 		 573 aa  476  1e-133  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  52.19 
 
 		 577 aa  477  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  52.12 
 
 		 573 aa  475  1e-133  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  52.33 
 
 		 573 aa  474  1e-132  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  51.37 
 
 		 546 aa  467  9.999999999999999e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1433  type II secretion system protein E  50.38 
 
 		 544 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795188  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00952  GSPE-like protein  53.99 
 
 		 414 aa  444  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.759947 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  48.39 
 
 		 871 aa  386  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  47.07 
 
 		 571 aa  371  1e-101  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  38.93 
 
 		 558 aa  368  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  42.27 
 
 		 523 aa  363  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  40.99 
 
 		 521 aa  362  9e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  41.56 
 
 		 521 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  41.05 
 
 		 521 aa  362  1e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  41.56 
 
 		 521 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  41.56 
 
 		 521 aa  362  1e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  42.5 
 
 		 524 aa  361  2e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 514 aa  360  3e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.62 
 
 		 553 aa  360  5e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.97 
 
 		 570 aa  359  6e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  42.47 
 
 		 523 aa  359  6e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  46.29 
 
 		 564 aa  359  7e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  41.81 
 
 		 523 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  47.7 
 
 		 573 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  42.38 
 
 		 497 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  40.68 
 
 		 521 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  40.8 
 
 		 514 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  40.68 
 
 		 521 aa  357  3.9999999999999996e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  40.49 
 
 		 521 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  43.12 
 
 		 585 aa  355  1e-96  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  41.98 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  47.46 
 
 		 497 aa  355  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  40.94 
 
 		 521 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  42.18 
 
 		 497 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  42.18 
 
 		 497 aa  353  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  48.21 
 
 		 554 aa  353  5.9999999999999994e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  48.21 
 
 		 511 aa  352  8.999999999999999e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  47.47 
 
 		 503 aa  351  2e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  48.73 
 
 		 553 aa  351  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  44.33 
 
 		 553 aa  350  5e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.55 
 
 		 568 aa  349  6e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  45.61 
 
 		 568 aa  349  7e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  46.17 
 
 		 494 aa  348  1e-94  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  42.07 
 
 		 521 aa  348  1e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.05 
 
 		 558 aa  348  1e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  44.77 
 
 		 575 aa  348  1e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.41 
 
 		 571 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  42.65 
 
 		 575 aa  348  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.58 
 
 		 568 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.58 
 
 		 568 aa  348  2e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  47.04 
 
 		 578 aa  347  2e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  43.93 
 
 		 482 aa  347  3e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  46.1 
 
 		 545 aa  347  3e-94  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  49.1 
 
 		 578 aa  347  3e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  46.82 
 
 		 519 aa  347  4e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  41.58 
 
 		 520 aa  347  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  43.35 
 
 		 568 aa  346  7e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.04 
 
 		 563 aa  346  7e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  44.12 
 
 		 571 aa  345  8.999999999999999e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  44.12 
 
 		 577 aa  345  8.999999999999999e-94  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  45.92 
 
 		 494 aa  345  1e-93  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.18 
 
 		 568 aa  345  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  42.89 
 
 		 670 aa  345  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  46.55 
 
 		 559 aa  344  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  47.83 
 
 		 514 aa  344  2.9999999999999997e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  45.29 
 
 		 525 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  46 
 
 		 571 aa  343  4e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  47.97 
 
 		 515 aa  342  7e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  45.45 
 
 		 568 aa  342  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  39.55 
 
 		 591 aa  342  1e-92  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.59 
 
 		 563 aa  342  1e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  43.45 
 
 		 484 aa  342  1e-92  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.65 
 
 		 568 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.96 
 
 		 568 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  45.12 
 
 		 668 aa  341  2e-92  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  43.82 
 
 		 520 aa  341  2e-92  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  47.45 
 
 		 495 aa  341  2e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  46.68 
 
 		 502 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>