More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_1576 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  100 
 
 
546 aa  1112    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  58.66 
 
 
576 aa  625  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  57.79 
 
 
573 aa  624  1e-177  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  58.56 
 
 
573 aa  615  1e-175  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  59.89 
 
 
574 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  57.09 
 
 
574 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  59.15 
 
 
573 aa  608  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  58.96 
 
 
573 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  56.51 
 
 
578 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  54.05 
 
 
577 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3223  type II secretion system protein E  57.11 
 
 
564 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  50.67 
 
 
566 aa  499  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  49.32 
 
 
559 aa  496  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  54.81 
 
 
558 aa  492  9.999999999999999e-139  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2454  type II secretion system protein E  51 
 
 
557 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  50.19 
 
 
570 aa  489  1e-137  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3483  type II secretion system protein E  53.1 
 
 
598 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2463  type II secretion system protein E  49.52 
 
 
596 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1982  type II secretion system protein E  58.82 
 
 
573 aa  488  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981524  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  56.21 
 
 
599 aa  487  1e-136  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2288  type II secretion system protein E  57.97 
 
 
598 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0404074  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29150  type II secretion system protein E  57.27 
 
 
568 aa  487  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0342357  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  57.95 
 
 
567 aa  478  1e-133  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  46.68 
 
 
567 aa  472  1e-132  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  51.37 
 
 
561 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4711  type II secretion system protein E  52.13 
 
 
568 aa  457  1e-127  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  50.45 
 
 
580 aa  450  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_003296  RS00952  GSPE-like protein  52.04 
 
 
414 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.759947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1433  type II secretion system protein E  44.83 
 
 
544 aa  412  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  41.19 
 
 
871 aa  408  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40 
 
 
568 aa  404  1e-111  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.28 
 
 
571 aa  404  1e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.89 
 
 
571 aa  402  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.34 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.92 
 
 
568 aa  395  1e-108  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.08 
 
 
568 aa  390  1e-107  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.85 
 
 
568 aa  392  1e-107  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  41.9 
 
 
564 aa  392  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  39.02 
 
 
561 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.09 
 
 
571 aa  388  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  41.1 
 
 
558 aa  388  1e-106  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.11 
 
 
553 aa  389  1e-106  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  39.07 
 
 
556 aa  383  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  40.62 
 
 
571 aa  383  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  42.02 
 
 
558 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  41.19 
 
 
557 aa  383  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  42.34 
 
 
521 aa  382  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  38.53 
 
 
566 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.96 
 
 
568 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  39.15 
 
 
568 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.48 
 
 
568 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.77 
 
 
568 aa  380  1e-104  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.04 
 
 
563 aa  381  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  39.2 
 
 
598 aa  380  1e-104  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.34 
 
 
568 aa  382  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.15 
 
 
568 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.57 
 
 
568 aa  377  1e-103  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  42.28 
 
 
553 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  41.76 
 
 
520 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  40.74 
 
 
610 aa  377  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.74 
 
 
599 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  46.87 
 
 
578 aa  375  1e-102  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  39.51 
 
 
787 aa  375  1e-102  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  42.44 
 
 
553 aa  373  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  39.93 
 
 
599 aa  372  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.98 
 
 
577 aa  374  1e-102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  41.43 
 
 
570 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  38.62 
 
 
559 aa  370  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  49.75 
 
 
514 aa  371  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.74 
 
 
599 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  38.21 
 
 
569 aa  370  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  40.43 
 
 
553 aa  369  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  38.42 
 
 
557 aa  370  1e-101  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  38.35 
 
 
561 aa  372  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  39.35 
 
 
583 aa  369  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  39.41 
 
 
603 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.72 
 
 
569 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  39.53 
 
 
552 aa  368  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  38.72 
 
 
591 aa  365  1e-100  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  37.72 
 
 
569 aa  366  1e-100  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  39.2 
 
 
561 aa  366  1e-100  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1022  type II secretion system protein E  40.44 
 
 
554 aa  366  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  38.91 
 
 
555 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  39.21 
 
 
577 aa  368  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.75 
 
 
563 aa  368  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  40.49 
 
 
520 aa  365  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  40.49 
 
 
520 aa  365  1e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  38.92 
 
 
583 aa  365  1e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.11 
 
 
557 aa  365  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  39.42 
 
 
885 aa  365  1e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  42.05 
 
 
575 aa  365  2e-99  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  42.15 
 
 
520 aa  364  2e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  42.62 
 
 
514 aa  363  3e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  39.08 
 
 
570 aa  363  3e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  39.22 
 
 
573 aa  362  7.0000000000000005e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  39.23 
 
 
888 aa  362  9e-99  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  40.84 
 
 
577 aa  362  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  39.54 
 
 
565 aa  362  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  36.92 
 
 
573 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  39.6 
 
 
580 aa  360  4e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>