More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_3223 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3223  type II secretion system protein E  100 
 
 		 564 aa  1134    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  63.01 
 
 		 570 aa  621  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  60.04 
 
 		 558 aa  617  1e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  62.28 
 
 		 566 aa  608  1e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  60.69 
 
 		 599 aa  608  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  58.66 
 
 		 559 aa  605  1.0000000000000001e-171  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  61.85 
 
 		 567 aa  603  1.0000000000000001e-171  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1982  type II secretion system protein E  59.84 
 
 		 573 aa  585  1e-166  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981524  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2463  type II secretion system protein E  60.65 
 
 		 596 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29150  type II secretion system protein E  60.89 
 
 		 568 aa  578  1.0000000000000001e-163  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0342357  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3483  type II secretion system protein E  58.88 
 
 		 598 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2288  type II secretion system protein E  58.48 
 
 		 598 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0404074  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  56.36 
 
 		 567 aa  569  1e-161  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2454  type II secretion system protein E  60.57 
 
 		 557 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  60.49 
 
 		 561 aa  557  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4711  type II secretion system protein E  55.77 
 
 		 568 aa  554  1e-156  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  55.53 
 
 		 580 aa  526  1e-148  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  53.23 
 
 		 576 aa  522  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  58.48 
 
 		 578 aa  514  1e-144  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  54.55 
 
 		 573 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  53.79 
 
 		 573 aa  505  9.999999999999999e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  58.52 
 
 		 573 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  54.25 
 
 		 573 aa  504  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  53.18 
 
 		 574 aa  499  1e-140  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  57.11 
 
 		 546 aa  499  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  53.95 
 
 		 574 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  50 
 
 		 577 aa  476  1e-133  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00952  GSPE-like protein  57.04 
 
 		 414 aa  463  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.759947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1433  type II secretion system protein E  48.54 
 
 		 544 aa  443  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  46.65 
 
 		 871 aa  379  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  48.32 
 
 		 578 aa  361  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  46.53 
 
 		 564 aa  353  2.9999999999999997e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.4 
 
 		 568 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  48.32 
 
 		 575 aa  352  8e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  43.82 
 
 		 521 aa  352  1e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  37.15 
 
 		 570 aa  352  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  45.36 
 
 		 571 aa  350  3e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  39.93 
 
 		 563 aa  350  3e-95  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  50.39 
 
 		 578 aa  350  4e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  47.73 
 
 		 503 aa  350  5e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  47.63 
 
 		 563 aa  349  7e-95  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  41.94 
 
 		 575 aa  349  7e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.52 
 
 		 571 aa  346  5e-94  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  47.61 
 
 		 500 aa  346  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  38.86 
 
 		 568 aa  346  8e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  46.94 
 
 		 557 aa  345  8.999999999999999e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.86 
 
 		 568 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.73 
 
 		 568 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  43.55 
 
 		 558 aa  344  2e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.86 
 
 		 568 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.66 
 
 		 568 aa  344  2.9999999999999997e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.05 
 
 		 568 aa  342  9e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  43.86 
 
 		 577 aa  342  1e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.27 
 
 		 568 aa  342  1e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  38.42 
 
 		 585 aa  341  2e-92  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  44.98 
 
 		 514 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  44.08 
 
 		 553 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  45.14 
 
 		 573 aa  340  2.9999999999999998e-92  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  40.72 
 
 		 550 aa  340  4e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  36.38 
 
 		 555 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  43.67 
 
 		 545 aa  340  5.9999999999999996e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.53 
 
 		 563 aa  340  5.9999999999999996e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  45.64 
 
 		 561 aa  339  7e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  43.74 
 
 		 497 aa  339  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  48.22 
 
 		 471 aa  339  8e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  40 
 
 		 580 aa  339  9e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.03 
 
 		 553 aa  339  9e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  43.76 
 
 		 497 aa  338  9.999999999999999e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  45.69 
 
 		 499 aa  338  9.999999999999999e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  42.61 
 
 		 520 aa  338  9.999999999999999e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  43.43 
 
 		 585 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  43.43 
 
 		 585 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  46.37 
 
 		 497 aa  338  1.9999999999999998e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  44.2 
 
 		 474 aa  338  1.9999999999999998e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.9 
 
 		 571 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.37 
 
 		 568 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  47.36 
 
 		 487 aa  337  2.9999999999999997e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  47.01 
 
 		 520 aa  337  2.9999999999999997e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  44.3 
 
 		 583 aa  337  2.9999999999999997e-91  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  43.84 
 
 		 497 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  42.16 
 
 		 514 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  46.6 
 
 		 501 aa  337  3.9999999999999995e-91  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  43.84 
 
 		 497 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.74 
 
 		 520 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  46.15 
 
 		 502 aa  336  5.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  46.15 
 
 		 502 aa  336  7e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  47.04 
 
 		 521 aa  336  9e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  47.7 
 
 		 553 aa  335  9e-91  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  46.65 
 
 		 520 aa  335  1e-90  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  36.38 
 
 		 566 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  45.84 
 
 		 522 aa  335  1e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  46.93 
 
 		 523 aa  335  2e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  37.74 
 
 		 553 aa  334  2e-90  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  44.36 
 
 		 583 aa  334  3e-90  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  46.1 
 
 		 497 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  46.1 
 
 		 497 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  46.1 
 
 		 497 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  46.1 
 
 		 497 aa  333  3e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  46.1 
 
 		 497 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  46.1 
 
 		 497 aa  333  3e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>