More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3232 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  100 
 
 		 545 aa  1111    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  51.1 
 
 		 569 aa  533  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  47.35 
 
 		 579 aa  495  9.999999999999999e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  46.61 
 
 		 575 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  43.2 
 
 		 575 aa  395  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  43.06 
 
 		 578 aa  394  1e-108  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  50.39 
 
 		 585 aa  390  1e-107  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  41.4 
 
 		 580 aa  390  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  46.45 
 
 		 482 aa  380  1e-104  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  47.57 
 
 		 514 aa  379  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  48.5 
 
 		 520 aa  378  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  48.99 
 
 		 520 aa  379  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  51.69 
 
 		 515 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  48.98 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  50.65 
 
 		 471 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  52.49 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  49.63 
 
 		 553 aa  374  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  51.97 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  51.97 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  51.97 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  47.25 
 
 		 520 aa  375  1e-102  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  52.76 
 
 		 499 aa  375  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.45 
 
 		 568 aa  374  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  50.51 
 
 		 487 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  51.97 
 
 		 497 aa  373  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  51.97 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  47.84 
 
 		 577 aa  373  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  47.25 
 
 		 520 aa  375  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  51.97 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  52.76 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  51.97 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  52.23 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  47.14 
 
 		 585 aa  373  1e-102  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  48.2 
 
 		 558 aa  372  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  52.23 
 
 		 499 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  47.03 
 
 		 566 aa  372  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  51.97 
 
 		 497 aa  374  1e-102  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  51.71 
 
 		 495 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  47.98 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  40.7 
 
 		 583 aa  369  1e-101  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  39.43 
 
 		 576 aa  370  1e-101  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  40.68 
 
 		 578 aa  370  1e-101  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  44.64 
 
 		 501 aa  372  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  51.71 
 
 		 522 aa  371  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  52.23 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  44.49 
 
 		 500 aa  370  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  49.23 
 
 		 561 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  52.23 
 
 		 499 aa  372  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  48.35 
 
 		 570 aa  369  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.62 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  48.59 
 
 		 569 aa  368  1e-100  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  40.92 
 
 		 559 aa  369  1e-100  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  49.5 
 
 		 599 aa  366  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.07 
 
 		 568 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3029  general secretion pathway protein E  38.26 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599486  hitchhiker  0.00121357 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  42.38 
 
 		 566 aa  366  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  46.84 
 
 		 520 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  50.13 
 
 		 599 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1278  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  50.26 
 
 		 549 aa  367  1e-100  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  43.18 
 
 		 503 aa  366  1e-100  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  42.38 
 
 		 566 aa  365  1e-100  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  48.56 
 
 		 513 aa  367  1e-100  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  45.84 
 
 		 499 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.15 
 
 		 568 aa  369  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.86 
 
 		 568 aa  366  1e-100  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  47.44 
 
 		 502 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  38.25 
 
 		 563 aa  368  1e-100  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  49.5 
 
 		 599 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.84 
 
 		 568 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.34 
 
 		 568 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  50.13 
 
 		 575 aa  365  2e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  49.74 
 
 		 468 aa  364  2e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  47.81 
 
 		 871 aa  364  2e-99  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  49.74 
 
 		 518 aa  364  2e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  46.98 
 
 		 502 aa  365  2e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  49.48 
 
 		 469 aa  364  3e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  40.11 
 
 		 885 aa  363  3e-99  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  49.23 
 
 		 474 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  48.54 
 
 		 477 aa  363  4e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  45.08 
 
 		 583 aa  363  4e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  46.32 
 
 		 503 aa  363  4e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  43.05 
 
 		 567 aa  363  4e-99  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  50.78 
 
 		 585 aa  363  6e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  50.64 
 
 		 585 aa  363  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  49.12 
 
 		 603 aa  362  7.0000000000000005e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  49.35 
 
 		 469 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.48 
 
 		 571 aa  362  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.32 
 
 		 568 aa  361  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  47.81 
 
 		 559 aa  360  3e-98  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  48.98 
 
 		 541 aa  360  3e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  41.23 
 
 		 558 aa  360  4e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  48.21 
 
 		 568 aa  360  5e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  48.98 
 
 		 572 aa  360  5e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  47.22 
 
 		 489 aa  359  7e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  45.43 
 
 		 495 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  37.97 
 
 		 573 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.33 
 
 		 568 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.33 
 
 		 568 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  47.79 
 
 		 474 aa  358  1.9999999999999998e-97  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  44.14 
 
 		 514 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>