More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1341 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  62.57 
 
 
567 aa  691    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  62.85 
 
 
566 aa  677    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  63.87 
 
 
558 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  60.64 
 
 
599 aa  693    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  100 
 
 
570 aa  1166    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  61.61 
 
 
559 aa  682    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3223  type II secretion system protein E  63.01 
 
 
564 aa  621  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1982  type II secretion system protein E  55.22 
 
 
573 aa  616  1e-175  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981524  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2463  type II secretion system protein E  57.67 
 
 
596 aa  615  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  59.76 
 
 
561 aa  611  9.999999999999999e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3483  type II secretion system protein E  57.86 
 
 
598 aa  608  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2288  type II secretion system protein E  57.67 
 
 
598 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0404074  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2454  type II secretion system protein E  57.49 
 
 
557 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29150  type II secretion system protein E  57.04 
 
 
568 aa  603  1.0000000000000001e-171  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0342357  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4711  type II secretion system protein E  57.98 
 
 
568 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  56.98 
 
 
567 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  55.62 
 
 
580 aa  549  1e-155  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  57.38 
 
 
576 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  55.38 
 
 
573 aa  514  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  52.33 
 
 
573 aa  511  1e-143  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  55.18 
 
 
573 aa  510  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  55.08 
 
 
574 aa  504  1e-141  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  53.8 
 
 
578 aa  504  1e-141  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  53.25 
 
 
573 aa  498  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  50.19 
 
 
546 aa  489  1e-137  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  53.51 
 
 
574 aa  491  1e-137  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  61.44 
 
 
577 aa  480  1e-134  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00952  GSPE-like protein  57.5 
 
 
414 aa  454  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.759947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1433  type II secretion system protein E  49.9 
 
 
544 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  47.58 
 
 
871 aa  388  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  43.91 
 
 
521 aa  363  5.0000000000000005e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  42.06 
 
 
553 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.85 
 
 
568 aa  360  5e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.83 
 
 
568 aa  359  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  41.16 
 
 
570 aa  359  9e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  47.86 
 
 
575 aa  358  9.999999999999999e-98  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  42.08 
 
 
520 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  40.73 
 
 
565 aa  357  2.9999999999999997e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  41.27 
 
 
554 aa  357  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  41.22 
 
 
578 aa  357  5e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  41.14 
 
 
575 aa  355  1e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.97 
 
 
568 aa  355  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.5 
 
 
520 aa  355  2e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.82 
 
 
571 aa  354  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.32 
 
 
568 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  39.33 
 
 
577 aa  353  4e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.33 
 
 
563 aa  352  1e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  45.57 
 
 
571 aa  352  1e-95  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  41.01 
 
 
553 aa  351  2e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  39.15 
 
 
564 aa  351  2e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  38.82 
 
 
589 aa  349  6e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  41.22 
 
 
523 aa  350  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  42.52 
 
 
578 aa  349  9e-95  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  37.61 
 
 
563 aa  348  1e-94  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  40.78 
 
 
521 aa  348  1e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  40.52 
 
 
521 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  40.52 
 
 
521 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  40.52 
 
 
521 aa  348  1e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  43.43 
 
 
585 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  43.43 
 
 
585 aa  347  3e-94  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  41.06 
 
 
521 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  41.26 
 
 
521 aa  347  3e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  40.32 
 
 
521 aa  347  4e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  44.71 
 
 
557 aa  346  7e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  45.55 
 
 
500 aa  346  7e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  46.12 
 
 
561 aa  346  7e-94  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.72 
 
 
568 aa  346  8e-94  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.67 
 
 
568 aa  345  8.999999999999999e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40 
 
 
585 aa  345  2e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.67 
 
 
568 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  40.79 
 
 
521 aa  345  2e-93  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  45.2 
 
 
566 aa  345  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  40.67 
 
 
521 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  40.7 
 
 
569 aa  344  2.9999999999999997e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.61 
 
 
568 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0232  general secretory pathway protein E  41.41 
 
 
525 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  42.01 
 
 
514 aa  343  4e-93  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.4 
 
 
568 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  39.37 
 
 
558 aa  343  5e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  39.8 
 
 
553 aa  343  5e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  36.78 
 
 
885 aa  343  5.999999999999999e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  41.7 
 
 
580 aa  343  7e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  45.34 
 
 
497 aa  342  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40.2 
 
 
568 aa  342  1e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.8 
 
 
553 aa  342  1e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  45.82 
 
 
523 aa  342  1e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  45.19 
 
 
545 aa  342  1e-92  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  47.33 
 
 
515 aa  342  1e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  38.17 
 
 
569 aa  341  2e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  41.3 
 
 
509 aa  341  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  40.91 
 
 
523 aa  341  2e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  40.94 
 
 
514 aa  341  2e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  45.34 
 
 
499 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  45.34 
 
 
499 aa  341  2e-92  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  45.25 
 
 
515 aa  341  2e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  45.48 
 
 
497 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  37.8 
 
 
552 aa  340  2.9999999999999998e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  45.34 
 
 
499 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  45.48 
 
 
497 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  45.48 
 
 
497 aa  341  2.9999999999999998e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>