More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_2419 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  61.01 
 
 
566 aa  662    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  60 
 
 
558 aa  676    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1982  type II secretion system protein E  58.56 
 
 
573 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981524  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  60.07 
 
 
567 aa  678    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  57.38 
 
 
599 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  61.61 
 
 
570 aa  690    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  100 
 
 
559 aa  1144    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29150  type II secretion system protein E  58.36 
 
 
568 aa  625  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0342357  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2288  type II secretion system protein E  56.68 
 
 
598 aa  622  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0404074  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3483  type II secretion system protein E  56.5 
 
 
598 aa  621  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2463  type II secretion system protein E  56.62 
 
 
596 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3223  type II secretion system protein E  58.66 
 
 
564 aa  608  1e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2454  type II secretion system protein E  55.2 
 
 
557 aa  609  1e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  55.3 
 
 
567 aa  572  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  57.98 
 
 
561 aa  551  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4711  type II secretion system protein E  55.21 
 
 
568 aa  550  1e-155  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  53.37 
 
 
580 aa  543  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  51.98 
 
 
576 aa  537  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  50.57 
 
 
573 aa  519  1e-146  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  51.23 
 
 
573 aa  520  1e-146  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  49.28 
 
 
573 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  51.04 
 
 
573 aa  519  1e-146  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  51.89 
 
 
574 aa  515  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  60.05 
 
 
578 aa  506  9.999999999999999e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  49.91 
 
 
574 aa  505  9.999999999999999e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  48.41 
 
 
546 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  49.26 
 
 
577 aa  495  1e-139  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00952  GSPE-like protein  56.28 
 
 
414 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.543413  normal  0.759947 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1433  type II secretion system protein E  49.11 
 
 
544 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795188  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  38.49 
 
 
871 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.12 
 
 
570 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  50 
 
 
578 aa  384  1e-105  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  38.98 
 
 
565 aa  383  1e-105  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  38.74 
 
 
553 aa  378  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  48.44 
 
 
575 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.13 
 
 
563 aa  376  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  49.5 
 
 
521 aa  374  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  41.67 
 
 
571 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  38.53 
 
 
564 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  42.71 
 
 
554 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  39.92 
 
 
585 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.49 
 
 
571 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.61 
 
 
568 aa  363  3e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  43.88 
 
 
514 aa  363  4e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  38.48 
 
 
553 aa  363  4e-99  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  41.54 
 
 
577 aa  363  5.0000000000000005e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  39.53 
 
 
552 aa  363  6e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  42.63 
 
 
520 aa  362  1e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  45.35 
 
 
497 aa  361  2e-98  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.9 
 
 
568 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  42.48 
 
 
553 aa  361  2e-98  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  38.93 
 
 
571 aa  361  2e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  48.23 
 
 
520 aa  360  3e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  42.62 
 
 
578 aa  360  4e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  47.47 
 
 
497 aa  360  4e-98  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  46.05 
 
 
521 aa  359  7e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  38.31 
 
 
556 aa  359  7e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  45.31 
 
 
500 aa  358  9.999999999999999e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  42.13 
 
 
580 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.92 
 
 
568 aa  358  1.9999999999999998e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  37.14 
 
 
568 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  44.52 
 
 
497 aa  357  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  43.22 
 
 
573 aa  356  5.999999999999999e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  42.54 
 
 
514 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  46.82 
 
 
503 aa  355  8.999999999999999e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  44.88 
 
 
497 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  48.1 
 
 
520 aa  355  1e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  44.88 
 
 
497 aa  355  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  37.84 
 
 
559 aa  355  2e-96  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  40.3 
 
 
566 aa  354  2e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.48 
 
 
568 aa  355  2e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  41.48 
 
 
553 aa  354  2e-96  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  40.44 
 
 
567 aa  355  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  44.84 
 
 
501 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  45.35 
 
 
521 aa  354  2e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  48.1 
 
 
520 aa  355  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  39.81 
 
 
575 aa  354  2e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  46.17 
 
 
514 aa  353  4e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  40.3 
 
 
566 aa  353  4e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  34.59 
 
 
564 aa  353  4e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  45.24 
 
 
514 aa  353  4e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  41.67 
 
 
502 aa  353  4e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  39.49 
 
 
573 aa  353  5e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  40.66 
 
 
557 aa  353  5.9999999999999994e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  38.22 
 
 
561 aa  352  7e-96  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  45.33 
 
 
521 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  42.16 
 
 
577 aa  352  8.999999999999999e-96  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.78 
 
 
568 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  45.35 
 
 
521 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.78 
 
 
568 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  47.24 
 
 
487 aa  351  2e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.58 
 
 
568 aa  351  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.59 
 
 
557 aa  351  2e-95  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  47.31 
 
 
515 aa  351  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  45.12 
 
 
521 aa  350  3e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  45.15 
 
 
570 aa  350  3e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  44.73 
 
 
523 aa  350  6e-95  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  41.47 
 
 
502 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.65 
 
 
568 aa  349  6e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  41.92 
 
 
567 aa  349  7e-95  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>