More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5434 on replicon NC_012851
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010683  Rpic_5028  type II secretion system protein E  99.51 
 
 		 609 aa  1233    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5434  type II secretion system protein E  100 
 
 		 609 aa  1241    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5201  type II secretion system protein E  46.2 
 
 		 528 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.963027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1536  type II secretion system protein E  46.2 
 
 		 528 aa  436  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.151056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  33.08 
 
 		 506 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  32.88 
 
 		 594 aa  212  1e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  32.44 
 
 		 544 aa  211  3e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  33.66 
 
 		 536 aa  209  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  33.66 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  33.66 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  33.46 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  33.66 
 
 		 536 aa  208  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  33.46 
 
 		 536 aa  208  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  33.07 
 
 		 538 aa  207  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  29.56 
 
 		 518 aa  192  1e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  30 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  28.12 
 
 		 543 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  28.46 
 
 		 526 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  28.26 
 
 		 513 aa  163  7e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  31.68 
 
 		 559 aa  160  9e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  32.04 
 
 		 746 aa  157  4e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  30.95 
 
 		 560 aa  157  4e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  30.9 
 
 		 561 aa  156  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  31.25 
 
 		 871 aa  154  4e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  31.17 
 
 		 570 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1571  type II secretion system protein E  29.85 
 
 		 587 aa  153  8.999999999999999e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.00763489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  31.56 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  34.19 
 
 		 585 aa  151  4e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  31.75 
 
 		 554 aa  151  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  29.2 
 
 		 574 aa  150  5e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  28.76 
 
 		 570 aa  150  6e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3223  type II secretion system protein E  29.7 
 
 		 564 aa  150  7e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.354851 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  36.8 
 
 		 595 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  28.92 
 
 		 616 aa  148  3e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  29.83 
 
 		 553 aa  148  3e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  29.45 
 
 		 558 aa  148  3e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  37.13 
 
 		 521 aa  147  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  27.62 
 
 		 502 aa  147  5e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 599 aa  147  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  30.29 
 
 		 503 aa  146  9e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29150  type II secretion system protein E  29.5 
 
 		 568 aa  146  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0342357  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  26.89 
 
 		 499 aa  146  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  29.37 
 
 		 566 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  33.18 
 
 		 569 aa  146  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2463  type II secretion system protein E  35.4 
 
 		 596 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3483  type II secretion system protein E  35.29 
 
 		 598 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 595 aa  145  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2288  type II secretion system protein E  35.29 
 
 		 598 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0404074  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  30.36 
 
 		 499 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  30.29 
 
 		 500 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  30.93 
 
 		 482 aa  145  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  29.74 
 
 		 787 aa  145  3e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1982  type II secretion system protein E  29.84 
 
 		 573 aa  144  4e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981524  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  35.92 
 
 		 595 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  24.32 
 
 		 510 aa  143  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  32.98 
 
 		 571 aa  143  7e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  36.11 
 
 		 580 aa  143  7e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  28.47 
 
 		 576 aa  144  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  27.52 
 
 		 517 aa  143  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 557 aa  143  9.999999999999999e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  26.72 
 
 		 517 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  30.57 
 
 		 578 aa  143  9.999999999999999e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  29.67 
 
 		 589 aa  142  1.9999999999999998e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  32.92 
 
 		 569 aa  142  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  30.83 
 
 		 577 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2454  type II secretion system protein E  34.67 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  34.73 
 
 		 585 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  29.55 
 
 		 520 aa  141  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  30.05 
 
 		 501 aa  142  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 553 aa  141  3.9999999999999997e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2634  type II secretion system protein E  37.56 
 
 		 626 aa  141  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  35.93 
 
 		 596 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  27.19 
 
 		 573 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  31.93 
 
 		 494 aa  140  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  38.74 
 
 		 486 aa  140  4.999999999999999e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  29.16 
 
 		 565 aa  140  6e-32  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  28.6 
 
 		 586 aa  140  7e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0131  type II secretory pathway and PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  28.61 
 
 		 578 aa  140  7.999999999999999e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  30.6 
 
 		 567 aa  140  8.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  29.44 
 
 		 568 aa  139  1e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  35.59 
 
 		 573 aa  139  1e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  31.09 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  31.09 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  26.95 
 
 		 558 aa  139  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  33.61 
 
 		 583 aa  139  2e-31  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  31.25 
 
 		 490 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  28.42 
 
 		 560 aa  138  3.0000000000000003e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  37.23 
 
 		 553 aa  138  3.0000000000000003e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  30.25 
 
 		 573 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3029  general secretion pathway protein E  34.98 
 
 		 550 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599486  hitchhiker  0.00121357 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  29.72 
 
 		 637 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  29.85 
 
 		 520 aa  138  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  34.5 
 
 		 567 aa  137  4e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  29.02 
 
 		 574 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  29.73 
 
 		 599 aa  137  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0629  type II secretion system protein E  27.62 
 
 		 519 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0931  type II secretion system protein E  36.05 
 
 		 551 aa  137  6.0000000000000005e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.1993  normal  0.0211669 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  30.56 
 
 		 520 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  28.39 
 
 		 578 aa  137  6.0000000000000005e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  29.27 
 
 		 591 aa  137  7.000000000000001e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>