More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2833 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  100 
 
 		 616 aa  1278    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  33.26 
 
 		 513 aa  227  4e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  34.84 
 
 		 526 aa  226  7e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0360  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein T  33.58 
 
 		 503 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.547799  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  32.29 
 
 		 520 aa  213  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 502 aa  212  2e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  30.67 
 
 		 518 aa  211  5e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  32.99 
 
 		 544 aa  210  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  29.96 
 
 		 543 aa  192  1e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  29.24 
 
 		 517 aa  190  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  33.55 
 
 		 538 aa  189  2e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  32 
 
 		 499 aa  188  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  31.26 
 
 		 536 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  31.26 
 
 		 536 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  31.26 
 
 		 536 aa  182  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  31.26 
 
 		 536 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4762  type II secretion system protein E  31.07 
 
 		 641 aa  180  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228994  normal  0.63689 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  31.26 
 
 		 536 aa  180  8e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  31.06 
 
 		 536 aa  180  8e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  27.92 
 
 		 621 aa  179  9e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  32.64 
 
 		 594 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  32.64 
 
 		 506 aa  178  3e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  31.82 
 
 		 569 aa  167  5.9999999999999996e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  30.21 
 
 		 510 aa  166  9e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  29.09 
 
 		 517 aa  164  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  32.53 
 
 		 546 aa  160  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0931  type II secretion system protein E  31.27 
 
 		 551 aa  158  2e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.1993  normal  0.0211669 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  31.64 
 
 		 673 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  31.64 
 
 		 673 aa  156  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  32.95 
 
 		 670 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4246  type II secretion system protein E  30.98 
 
 		 596 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  30.96 
 
 		 846 aa  154  5.9999999999999996e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2118  type II secretion system protein E  31.78 
 
 		 594 aa  153  7e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  30.36 
 
 		 670 aa  152  1e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3702  type II secretion system protein E  27.52 
 
 		 618 aa  152  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  30.37 
 
 		 871 aa  152  3e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  29.95 
 
 		 566 aa  150  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1966  type II secretion system protein E  31.45 
 
 		 642 aa  151  4e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56575  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  34.25 
 
 		 554 aa  151  4e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  31.28 
 
 		 885 aa  150  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4235  type II secretion system protein E  26.48 
 
 		 655 aa  150  6e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  30.38 
 
 		 577 aa  150  8e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  30.83 
 
 		 563 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  30.97 
 
 		 559 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5028  type II secretion system protein E  28.92 
 
 		 609 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  31.55 
 
 		 888 aa  148  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5434  type II secretion system protein E  28.92 
 
 		 609 aa  148  3e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  31.78 
 
 		 585 aa  148  3e-34  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1748  type II secretion system protein E  31.01 
 
 		 723 aa  147  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  30.25 
 
 		 583 aa  147  4.0000000000000006e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  29.7 
 
 		 567 aa  147  5e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  31.37 
 
 		 564 aa  147  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  31.94 
 
 		 573 aa  147  5e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6561  type II secretion system protein E  27.53 
 
 		 755 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 611 aa  147  7.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  30.11 
 
 		 668 aa  146  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  32.7 
 
 		 558 aa  146  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  31.11 
 
 		 594 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  32.47 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  30.97 
 
 		 553 aa  145  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  27.93 
 
 		 583 aa  145  2e-33  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3859  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 568 aa  145  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  27.96 
 
 		 499 aa  145  3e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  31.19 
 
 		 599 aa  145  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  31.93 
 
 		 592 aa  144  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  30.91 
 
 		 611 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  30.33 
 
 		 462 aa  145  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  30.21 
 
 		 595 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  29.12 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  32.59 
 
 		 561 aa  144  3e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 611 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  31.8 
 
 		 611 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  32.09 
 
 		 568 aa  144  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  28.93 
 
 		 598 aa  144  6e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  25.68 
 
 		 561 aa  143  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  32.05 
 
 		 611 aa  143  9e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  29.11 
 
 		 553 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  29.97 
 
 		 571 aa  142  9.999999999999999e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  27.83 
 
 		 545 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  30.21 
 
 		 676 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  31.21 
 
 		 574 aa  143  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  32.11 
 
 		 578 aa  142  1.9999999999999998e-32  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  30.62 
 
 		 604 aa  142  1.9999999999999998e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  29.6 
 
 		 591 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  29.56 
 
 		 595 aa  141  3e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0911  type II secretion system protein E  30.62 
 
 		 601 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  30.21 
 
 		 494 aa  141  3e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  30.29 
 
 		 579 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  30.33 
 
 		 462 aa  141  3e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  28.53 
 
 		 583 aa  142  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  30.47 
 
 		 561 aa  141  3.9999999999999997e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  30.21 
 
 		 494 aa  141  3.9999999999999997e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  31.04 
 
 		 566 aa  141  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  31.67 
 
 		 574 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  30.66 
 
 		 580 aa  141  4.999999999999999e-32  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  28.46 
 
 		 527 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  32.21 
 
 		 520 aa  140  6e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  28.33 
 
 		 554 aa  140  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2969  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  31.89 
 
 		 841 aa  140  6e-32  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.515104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  31.69 
 
 		 595 aa  140  7e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>