More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4235 on replicon NC_008757
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008757  Pnap_4235  type II secretion system protein E  100 
 
 		 655 aa  1365    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4762  type II secretion system protein E  33.08 
 
 		 641 aa  286  8e-76  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228994  normal  0.63689 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6291  type II secretion system protein E  30.37 
 
 		 605 aa  234  4.0000000000000004e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7246  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 672 aa  214  4.9999999999999996e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  26.48 
 
 		 616 aa  150  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6561  type II secretion system protein E  26.04 
 
 		 755 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  31.48 
 
 		 502 aa  137  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5555  type II secretion system protein E  26.53 
 
 		 770 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.095618 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  26.28 
 
 		 513 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  28.07 
 
 		 546 aa  118  3e-25  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  25.45 
 
 		 526 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  26.11 
 
 		 518 aa  114  8.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  27.16 
 
 		 565 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 550 aa  112  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 846 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  26.17 
 
 		 520 aa  110  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 579 aa  108  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  27.08 
 
 		 574 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4246  type II secretion system protein E  25.21 
 
 		 596 aa  105  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  27.5 
 
 		 497 aa  104  4e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  27.5 
 
 		 497 aa  104  5e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  30.35 
 
 		 561 aa  104  6e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3702  type II secretion system protein E  27.68 
 
 		 618 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  27.61 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  26.22 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  27.61 
 
 		 497 aa  102  2e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  25.24 
 
 		 554 aa  102  2e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  26.22 
 
 		 536 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  29.7 
 
 		 558 aa  102  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  26.22 
 
 		 536 aa  102  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  26.85 
 
 		 517 aa  101  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  27.07 
 
 		 497 aa  101  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  24.82 
 
 		 577 aa  101  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  24.59 
 
 		 560 aa  100  6e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  28.62 
 
 		 571 aa  100  8e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  25.99 
 
 		 536 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  25.99 
 
 		 536 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  25.99 
 
 		 536 aa  100  9e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  25.48 
 
 		 594 aa  100  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0954  general secretory pathway protein E  27.45 
 
 		 503 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.120459  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3268  general secretion pathway protein E  27.45 
 
 		 503 aa  99.8  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000698586  hitchhiker  0.0000000000000127286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1005  type II secretion system protein E  27.45 
 
 		 503 aa  99.8  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  25.76 
 
 		 577 aa  99  2e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  29.53 
 
 		 494 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  27.38 
 
 		 538 aa  99.4  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  24.72 
 
 		 563 aa  99.4  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  26.32 
 
 		 595 aa  99.4  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0360  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein T  27.01 
 
 		 503 aa  99.4  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.547799  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  26.8 
 
 		 544 aa  99  2e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  25.48 
 
 		 568 aa  98.6  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  27.7 
 
 		 560 aa  98.6  3e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  27.08 
 
 		 576 aa  98.6  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  24.53 
 
 		 467 aa  98.6  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  28.99 
 
 		 494 aa  98.2  4e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1060  type II secretion system protein E  25.38 
 
 		 596 aa  98.6  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  26.93 
 
 		 503 aa  98.2  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  25.46 
 
 		 621 aa  98.2  4e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  27.42 
 
 		 573 aa  97.8  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  25.47 
 
 		 500 aa  97.4  8e-19  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  26.44 
 
 		 595 aa  97.4  8e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3085  type II secretion system protein E  28.33 
 
 		 560 aa  97.1  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.136067 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  25.27 
 
 		 591 aa  97.1  9e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  26.28 
 
 		 583 aa  97.1  1e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  28.91 
 
 		 510 aa  96.7  1e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  25.73 
 
 		 569 aa  97.1  1e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  27.08 
 
 		 599 aa  96.7  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0904  type II secretion system protein E  26.32 
 
 		 595 aa  95.9  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  26.04 
 
 		 498 aa  95.9  2e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  27.51 
 
 		 561 aa  95.9  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  26.79 
 
 		 495 aa  95.5  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4400  type II secretion system protein E  25.64 
 
 		 575 aa  95.5  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  26.2 
 
 		 594 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  25.12 
 
 		 569 aa  95.5  3e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  26.44 
 
 		 506 aa  95.5  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  25.54 
 
 		 577 aa  95.1  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  26.85 
 
 		 885 aa  95.1  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  27.37 
 
 		 577 aa  94.7  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3097  type II secretion system protein E  25.74 
 
 		 578 aa  94.7  5e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  25.89 
 
 		 552 aa  94.4  7e-18  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  25.7 
 
 		 503 aa  94  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  25.33 
 
 		 586 aa  94  9e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  25 
 
 		 477 aa  94  9e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  27.56 
 
 		 520 aa  93.6  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  24.07 
 
 		 569 aa  93.6  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  26.1 
 
 		 501 aa  93.2  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0643  type II secretion system protein E  23.8 
 
 		 371 aa  93.6  1e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000183544  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1818  general secretory pathway protein E  27.24 
 
 		 519 aa  93.2  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  26.27 
 
 		 553 aa  93.6  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  25.82 
 
 		 558 aa  93.6  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0186  type II secretion system protein E  29.58 
 
 		 360 aa  93.2  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.301874  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  25.53 
 
 		 577 aa  93.2  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  25.05 
 
 		 565 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  25.57 
 
 		 544 aa  92.8  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  27.22 
 
 		 469 aa  93.2  2e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  27.08 
 
 		 599 aa  92.4  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  27.62 
 
 		 599 aa  92.8  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  28.97 
 
 		 570 aa  92.4  2e-17  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  26.18 
 
 		 891 aa  92.8  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  26.5 
 
 		 489 aa  92.4  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1464  general secretory pathway protein E  27.24 
 
 		 519 aa  92.4  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>