More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5912 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  68.72 
 
 		 536 aa  637    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  68.93 
 
 		 536 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  67.93 
 
 		 536 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  69.55 
 
 		 538 aa  657    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  68.72 
 
 		 536 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  74.85 
 
 		 594 aa  720    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  68.93 
 
 		 536 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  68.72 
 
 		 536 aa  637    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  75.31 
 
 		 506 aa  720    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  100 
 
 		 544 aa  1093    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  47.69 
 
 		 518 aa  429  1e-119  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  47.34 
 
 		 520 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  40.81 
 
 		 513 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  40.97 
 
 		 526 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  36.32 
 
 		 499 aa  292  9e-78  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  38.15 
 
 		 543 aa  282  1e-74  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  35.64 
 
 		 517 aa  271  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  37.99 
 
 		 517 aa  241  2.9999999999999997e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5434  type II secretion system protein E  32.44 
 
 		 609 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5028  type II secretion system protein E  32.44 
 
 		 609 aa  211  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  32.99 
 
 		 616 aa  210  6e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  30.35 
 
 		 510 aa  197  5.000000000000001e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  37.71 
 
 		 521 aa  194  3e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0585  type II secretion system protein E  35.42 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  37.43 
 
 		 521 aa  192  1e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  34.6 
 
 		 523 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  36.78 
 
 		 521 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  37.14 
 
 		 521 aa  191  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  32.86 
 
 		 462 aa  190  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  33.78 
 
 		 554 aa  190  5.999999999999999e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  35.35 
 
 		 523 aa  190  5.999999999999999e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  32.39 
 
 		 482 aa  188  2e-46  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  37.05 
 
 		 523 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  36.78 
 
 		 524 aa  187  3e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  35.92 
 
 		 521 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  35.92 
 
 		 521 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  35.92 
 
 		 521 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  37.54 
 
 		 520 aa  187  3e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  35.92 
 
 		 521 aa  188  3e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  34.5 
 
 		 520 aa  187  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  35.92 
 
 		 521 aa  187  4e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  32.67 
 
 		 462 aa  187  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  35.92 
 
 		 514 aa  187  5e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  34 
 
 		 520 aa  186  1.0000000000000001e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  36.29 
 
 		 513 aa  184  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  35.09 
 
 		 477 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  35.04 
 
 		 603 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  33.24 
 
 		 577 aa  182  1e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  34.65 
 
 		 486 aa  182  1e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 554 aa  182  2e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  33.25 
 
 		 571 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0629  type II secretion system protein E  33.83 
 
 		 519 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  34.41 
 
 		 580 aa  181  2.9999999999999997e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  32.41 
 
 		 569 aa  181  4e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  34.2 
 
 		 787 aa  181  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  35.63 
 
 		 514 aa  181  4e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  32.49 
 
 		 502 aa  181  4e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  32.48 
 
 		 467 aa  180  5.999999999999999e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  30.95 
 
 		 560 aa  180  5.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  33.93 
 
 		 498 aa  180  5.999999999999999e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  35.88 
 
 		 493 aa  179  9e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  35.88 
 
 		 493 aa  179  9e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  32.59 
 
 		 577 aa  179  9e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  35.88 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  35.88 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  35.88 
 
 		 493 aa  179  1e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  29.14 
 
 		 565 aa  179  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  34.17 
 
 		 509 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  34.38 
 
 		 568 aa  177  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  34.28 
 
 		 558 aa  177  3e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  33.25 
 
 		 599 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  34.54 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  34.54 
 
 		 502 aa  177  3e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  34.96 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0579  type II secretion system protein E  33.52 
 
 		 576 aa  177  4e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000642239 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  34.96 
 
 		 497 aa  177  4e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  32.18 
 
 		 871 aa  177  4e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  33.25 
 
 		 599 aa  177  4e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  33.62 
 
 		 578 aa  177  4e-43  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  35.06 
 
 		 494 aa  176  7e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  33.7 
 
 		 522 aa  176  8e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  32.15 
 
 		 514 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  31.39 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  33.61 
 
 		 501 aa  176  9.999999999999999e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  35.08 
 
 		 499 aa  175  9.999999999999999e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 606 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  34.7 
 
 		 497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  34.7 
 
 		 497 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  35.03 
 
 		 498 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  31.53 
 
 		 570 aa  175  1.9999999999999998e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  33.24 
 
 		 567 aa  174  2.9999999999999996e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  34.7 
 
 		 497 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  32.39 
 
 		 521 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1433  type II secretion system protein E  33.51 
 
 		 544 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.795188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  32.01 
 
 		 566 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  34.28 
 
 		 565 aa  174  5e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  34.63 
 
 		 495 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  37.28 
 
 		 491 aa  173  5.999999999999999e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  28.95 
 
 		 560 aa  173  5.999999999999999e-42  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  34.31 
 
 		 533 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>