More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2722 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  100 
 
 		 502 aa  1037    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 616 aa  212  1e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  30.99 
 
 		 538 aa  184  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  32.49 
 
 		 544 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  29.79 
 
 		 536 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  29.79 
 
 		 536 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  29.79 
 
 		 536 aa  171  3e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  29.79 
 
 		 536 aa  170  6e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  29.79 
 
 		 536 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  29.79 
 
 		 536 aa  169  8e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  28.94 
 
 		 526 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  28.73 
 
 		 513 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  27.11 
 
 		 518 aa  160  5e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  27.85 
 
 		 520 aa  160  6e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4206  type II secretion system protein E  27.71 
 
 		 621 aa  156  7e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0360  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein T  28.53 
 
 		 503 aa  155  1e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.547799  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  29.25 
 
 		 594 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  29.25 
 
 		 506 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  28.11 
 
 		 510 aa  149  8e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  29.09 
 
 		 554 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  30.84 
 
 		 569 aa  148  2.0000000000000003e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5028  type II secretion system protein E  27.62 
 
 		 609 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5434  type II secretion system protein E  27.62 
 
 		 609 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  26.22 
 
 		 543 aa  144  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4246  type II secretion system protein E  25.81 
 
 		 596 aa  144  3e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  33.9 
 
 		 523 aa  144  3e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  27.95 
 
 		 467 aa  142  9.999999999999999e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  32.49 
 
 		 524 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  32.68 
 
 		 520 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  33.14 
 
 		 521 aa  140  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  33.43 
 
 		 521 aa  140  7e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  33.05 
 
 		 523 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  26.62 
 
 		 499 aa  139  8.999999999999999e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  33.14 
 
 		 521 aa  139  1e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  33.14 
 
 		 521 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  31.02 
 
 		 514 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  32.2 
 
 		 514 aa  138  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  33.14 
 
 		 521 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4235  type II secretion system protein E  31.48 
 
 		 655 aa  137  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  32.86 
 
 		 523 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  29.97 
 
 		 846 aa  137  6.0000000000000005e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3196  type II general secretion pathway (GSP) E protein  30.1 
 
 		 478 aa  136  7.000000000000001e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  27.9 
 
 		 563 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  30.65 
 
 		 554 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  27.38 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  29.15 
 
 		 517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  31.39 
 
 		 497 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  31.64 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  31.64 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  31.64 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  31.64 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  27.92 
 
 		 787 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  30.94 
 
 		 571 aa  134  3.9999999999999996e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  31.28 
 
 		 522 aa  134  5e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  28.61 
 
 		 461 aa  133  6.999999999999999e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2634  type II secretion system protein E  29.34 
 
 		 626 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  31.25 
 
 		 568 aa  133  9e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  30.71 
 
 		 494 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  29.71 
 
 		 565 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1351  type II secretion system protein GspE  27.58 
 
 		 778 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  28.26 
 
 		 746 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3058  general secretory pathway related protein  29.36 
 
 		 613 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.438801 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  30.45 
 
 		 494 aa  131  3e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  29.92 
 
 		 885 aa  131  3e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  29.4 
 
 		 637 aa  131  3e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  30.83 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  31.11 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  31.11 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  28.33 
 
 		 482 aa  130  5.0000000000000004e-29  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  30.83 
 
 		 497 aa  130  5.0000000000000004e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3029  general secretion pathway protein E  29.35 
 
 		 550 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599486  hitchhiker  0.00121357 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 693 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3385  type II secretion system protein E  28.8 
 
 		 693 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  28.7 
 
 		 579 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1284  type II secretion system protein E  28.81 
 
 		 611 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.417466  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  29.82 
 
 		 573 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  28.68 
 
 		 582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  29.25 
 
 		 521 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1163  type II secretion system protein E  27.3 
 
 		 782 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  30.25 
 
 		 611 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  31.5 
 
 		 498 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  30.5 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  27.52 
 
 		 570 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  29.84 
 
 		 477 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  30.67 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2989  type II secretion system protein E  29.61 
 
 		 636 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327814  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0364  putative secretion pathway ATPase  30.2 
 
 		 592 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  31.11 
 
 		 513 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  30.5 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3232  type II secretion system protein E  35.31 
 
 		 545 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.17007  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  30.5 
 
 		 499 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  28.45 
 
 		 566 aa  128  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0113  type II secretion system protein E  29.51 
 
 		 688 aa  128  3e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  unclonable  0.00290435  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  28.98 
 
 		 611 aa  127  3e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  28.45 
 
 		 567 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2672  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 611 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.137026  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1133  type II secretion system protein  27.02 
 
 		 778 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2576  type II secretion system protein E  28.61 
 
 		 611 aa  127  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0841979  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  29.77 
 
 		 561 aa  127  5e-28  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0766  type II secretion system protein E  29.48 
 
 		 596 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>