More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2989 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2989  type II secretion system protein E  100 
 
 		 636 aa  1297    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327814  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3898  type II secretion system protein E  47.87 
 
 		 648 aa  630  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000434114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0368  type II secretion system protein E  49.59 
 
 		 638 aa  628  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0349  type II secretion system protein E  49.12 
 
 		 638 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000754733 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2634  type II secretion system protein E  49.11 
 
 		 626 aa  608  1e-173  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2457  type II secretion system protein E  49.51 
 
 		 623 aa  592  1e-168  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  37.71 
 
 		 888 aa  390  1e-107  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.16 
 
 		 558 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.96 
 
 		 553 aa  384  1e-105  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  37.08 
 
 		 885 aa  380  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  37.83 
 
 		 871 aa  369  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  37.99 
 
 		 573 aa  372  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  37.35 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  37.88 
 
 		 553 aa  369  1e-100  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  35.46 
 
 		 891 aa  367  1e-100  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  37.14 
 
 		 572 aa  365  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.9 
 
 		 556 aa  364  3e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  38.2 
 
 		 553 aa  362  1e-98  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.02 
 
 		 571 aa  361  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  38.79 
 
 		 557 aa  358  1.9999999999999998e-97  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 558 aa  357  2.9999999999999997e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  37.66 
 
 		 599 aa  357  5e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.29 
 
 		 571 aa  357  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  36.28 
 
 		 567 aa  355  2e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  38.45 
 
 		 553 aa  355  2e-96  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  37.66 
 
 		 599 aa  354  4e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  37.9 
 
 		 557 aa  353  7e-96  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  37.3 
 
 		 599 aa  352  1e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  38.6 
 
 		 571 aa  351  2e-95  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  36.69 
 
 		 559 aa  350  4e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  40.31 
 
 		 520 aa  350  6e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  37.3 
 
 		 603 aa  349  7e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  40.62 
 
 		 520 aa  349  9e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  36.15 
 
 		 558 aa  348  2e-94  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  36.72 
 
 		 568 aa  347  3e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  39.88 
 
 		 520 aa  346  6e-94  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 565 aa  346  6e-94  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 571 aa  344  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  37.18 
 
 		 561 aa  344  2e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  36.19 
 
 		 568 aa  345  2e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  34.58 
 
 		 570 aa  344  2.9999999999999997e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.25 
 
 		 568 aa  343  5e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  34.88 
 
 		 577 aa  343  5.999999999999999e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  36.4 
 
 		 552 aa  341  2e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  35.5 
 
 		 561 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  36.27 
 
 		 554 aa  340  4e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  37.43 
 
 		 575 aa  340  4e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  47.27 
 
 		 514 aa  340  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  37.01 
 
 		 569 aa  339  8e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  36.98 
 
 		 564 aa  339  8e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  34.83 
 
 		 561 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  36.41 
 
 		 568 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  35.26 
 
 		 570 aa  337  5e-91  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  33.68 
 
 		 787 aa  337  5.999999999999999e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  36.66 
 
 		 560 aa  336  9e-91  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  35.82 
 
 		 570 aa  335  1e-90  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1586  type II secretion system protein E  36.01 
 
 		 546 aa  335  1e-90  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.562805 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.23 
 
 		 568 aa  335  1e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.7 
 
 		 568 aa  336  1e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  37.21 
 
 		 570 aa  335  1e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  35.27 
 
 		 568 aa  334  3e-90  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  38.18 
 
 		 520 aa  333  4e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  35.93 
 
 		 637 aa  333  4e-90  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  34.98 
 
 		 577 aa  332  9e-90  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  36.25 
 
 		 561 aa  332  1e-89  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  37.16 
 
 		 569 aa  331  2e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  34.83 
 
 		 563 aa  332  2e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 564 aa  332  2e-89  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.47 
 
 		 568 aa  331  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.35 
 
 		 568 aa  331  3e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.59 
 
 		 563 aa  330  5.0000000000000004e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  36.93 
 
 		 568 aa  330  6e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  35.91 
 
 		 559 aa  330  7e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.52 
 
 		 568 aa  329  8e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  38.08 
 
 		 589 aa  329  8e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.88 
 
 		 568 aa  329  9e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  36.19 
 
 		 563 aa  329  9e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  37.6 
 
 		 580 aa  329  1.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  37.81 
 
 		 550 aa  328  1.0000000000000001e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  34.93 
 
 		 567 aa  328  2.0000000000000001e-88  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  39.75 
 
 		 566 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  36.64 
 
 		 563 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  34.28 
 
 		 566 aa  327  4.0000000000000003e-88  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  39.75 
 
 		 566 aa  326  6e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  36.51 
 
 		 570 aa  326  9e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  37.03 
 
 		 591 aa  325  1e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  36.7 
 
 		 585 aa  325  2e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  36.49 
 
 		 573 aa  325  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  34.76 
 
 		 562 aa  325  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  35.18 
 
 		 569 aa  325  2e-87  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.35 
 
 		 568 aa  324  4e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1041  type II secretion system protein E  36.1 
 
 		 547 aa  323  6e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  36.48 
 
 		 566 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  38.69 
 
 		 573 aa  322  9.999999999999999e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  36.25 
 
 		 577 aa  322  9.999999999999999e-87  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  35.19 
 
 		 610 aa  322  1.9999999999999998e-86  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  36.68 
 
 		 582 aa  321  3e-86  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  35.32 
 
 		 578 aa  320  3.9999999999999996e-86  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  35.56 
 
 		 574 aa  319  7.999999999999999e-86  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  35.55 
 
 		 612 aa  319  1e-85  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>