More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0349 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2634  type II secretion system protein E  53.5 
 
 		 626 aa  680    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2457  type II secretion system protein E  60.26 
 
 		 623 aa  756    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.402344  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3898  type II secretion system protein E  71.77 
 
 		 648 aa  950    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000434114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0349  type II secretion system protein E  100 
 
 		 638 aa  1296    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000754733 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0368  type II secretion system protein E  97.49 
 
 		 638 aa  1266    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2989  type II secretion system protein E  49.12 
 
 		 636 aa  625  1e-178  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.327814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.96 
 
 		 553 aa  370  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  37.08 
 
 		 558 aa  370  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  35.86 
 
 		 888 aa  368  1e-100  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  38.06 
 
 		 885 aa  366  1e-100  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  37.21 
 
 		 570 aa  363  6e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  36.91 
 
 		 553 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  37.66 
 
 		 558 aa  358  9.999999999999999e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  35.9 
 
 		 891 aa  358  1.9999999999999998e-97  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  37.32 
 
 		 599 aa  356  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  35.69 
 
 		 564 aa  355  1e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  36.6 
 
 		 571 aa  355  2e-96  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  37.5 
 
 		 599 aa  355  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  36.85 
 
 		 553 aa  354  2e-96  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  37.5 
 
 		 577 aa  354  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  35.37 
 
 		 555 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  38.5 
 
 		 603 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  36.9 
 
 		 871 aa  352  8e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.61 
 
 		 559 aa  352  1e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  39.58 
 
 		 520 aa  352  1e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  37.94 
 
 		 570 aa  351  2e-95  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  39.58 
 
 		 520 aa  352  2e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  36.96 
 
 		 599 aa  350  5e-95  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  39.93 
 
 		 553 aa  347  3e-94  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  36.32 
 
 		 573 aa  347  6e-94  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  38.05 
 
 		 552 aa  346  6e-94  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.1 
 
 		 568 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  37.1 
 
 		 568 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.93 
 
 		 568 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.34 
 
 		 561 aa  344  2.9999999999999997e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.74 
 
 		 571 aa  344  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  38.06 
 
 		 571 aa  344  2.9999999999999997e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  37.48 
 
 		 572 aa  343  5e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  34.7 
 
 		 577 aa  343  5.999999999999999e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  36.4 
 
 		 586 aa  342  1e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  37.68 
 
 		 554 aa  342  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  36.97 
 
 		 586 aa  342  2e-92  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  36.97 
 
 		 586 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  36.97 
 
 		 586 aa  341  2e-92  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  35.97 
 
 		 561 aa  342  2e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.81 
 
 		 568 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  36.3 
 
 		 557 aa  340  5.9999999999999996e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  38.16 
 
 		 568 aa  340  5.9999999999999996e-92  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  36.23 
 
 		 556 aa  339  9e-92  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  35 
 
 		 569 aa  339  9e-92  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  36.86 
 
 		 568 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  36.13 
 
 		 585 aa  339  9.999999999999999e-92  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  34.76 
 
 		 787 aa  338  1.9999999999999998e-91  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  35.99 
 
 		 577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  37.59 
 
 		 568 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  36.8 
 
 		 586 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  39.11 
 
 		 520 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  36.2 
 
 		 557 aa  337  3.9999999999999995e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  36.2 
 
 		 567 aa  337  3.9999999999999995e-91  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.01 
 
 		 568 aa  336  7e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  34.27 
 
 		 565 aa  335  1e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  34.51 
 
 		 569 aa  335  1e-90  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  37.32 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  37.32 
 
 		 586 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  37.32 
 
 		 586 aa  336  1e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.3 
 
 		 568 aa  336  1e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  35.34 
 
 		 586 aa  335  2e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  36.01 
 
 		 558 aa  335  2e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.66 
 
 		 562 aa  335  2e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  35.05 
 
 		 564 aa  333  4e-90  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  35.59 
 
 		 570 aa  333  6e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  37.57 
 
 		 566 aa  332  1e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  36.61 
 
 		 563 aa  332  1e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  36.62 
 
 		 586 aa  332  2e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  36.15 
 
 		 570 aa  332  2e-89  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  35.38 
 
 		 584 aa  331  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  36.72 
 
 		 561 aa  332  2e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  35.16 
 
 		 557 aa  332  2e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.65 
 
 		 568 aa  330  4e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.4 
 
 		 563 aa  330  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  37.02 
 
 		 610 aa  330  4e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  35.01 
 
 		 586 aa  330  4e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  37.24 
 
 		 520 aa  330  5.0000000000000004e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  35.93 
 
 		 568 aa  330  5.0000000000000004e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  37.83 
 
 		 575 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  34.74 
 
 		 570 aa  329  8e-89  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.52 
 
 		 568 aa  329  9e-89  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  37.12 
 
 		 578 aa  328  2.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  36.44 
 
 		 586 aa  328  3e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  35.93 
 
 		 562 aa  327  4.0000000000000003e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.75 
 
 		 568 aa  326  9e-88  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  33.77 
 
 		 595 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2665  type II secretion system protein E  37.55 
 
 		 545 aa  324  2e-87  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  36.06 
 
 		 591 aa  324  3e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  34.02 
 
 		 587 aa  323  7e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  36.43 
 
 		 580 aa  322  9.999999999999999e-87  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  35.04 
 
 		 589 aa  322  9.999999999999999e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  44.73 
 
 		 514 aa  322  1.9999999999999998e-86  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  34.75 
 
 		 637 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  34.41 
 
 		 561 aa  321  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>