More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_3385 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1867  type II secretion system protein E  100 
 
 
693 aa  1425    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.383587  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3385  type II secretion system protein E  100 
 
 
693 aa  1425    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00475521 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  41.42 
 
 
553 aa  318  2e-85  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  43 
 
 
520 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  40.23 
 
 
558 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.94 
 
 
871 aa  304  4.0000000000000003e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  38.48 
 
 
553 aa  303  9e-81  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  36.96 
 
 
558 aa  301  2e-80  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  40.81 
 
 
560 aa  301  3e-80  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  44.09 
 
 
515 aa  301  3e-80  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  39.91 
 
 
521 aa  300  5e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  35.04 
 
 
569 aa  299  1e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  41.18 
 
 
514 aa  298  2e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  38.45 
 
 
571 aa  297  5e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  43.5 
 
 
469 aa  296  8e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  42.59 
 
 
497 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  42.59 
 
 
497 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  42.59 
 
 
497 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  42.59 
 
 
497 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  42.59 
 
 
497 aa  295  1e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  42.59 
 
 
497 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  42.59 
 
 
497 aa  295  1e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  43.16 
 
 
489 aa  295  1e-78  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.67 
 
 
553 aa  295  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  43.55 
 
 
554 aa  295  3e-78  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  43.5 
 
 
469 aa  294  3e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  45.58 
 
 
520 aa  294  5e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  42.59 
 
 
499 aa  293  6e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  42.59 
 
 
497 aa  293  6e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  43.65 
 
 
493 aa  293  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  36.98 
 
 
561 aa  293  7e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  43.65 
 
 
493 aa  293  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  43.65 
 
 
493 aa  293  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  36.29 
 
 
555 aa  293  8e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  42.35 
 
 
520 aa  293  9e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  42.59 
 
 
499 aa  293  1e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  42.35 
 
 
520 aa  292  1e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  43.65 
 
 
493 aa  292  2e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  42.59 
 
 
498 aa  291  2e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  43.65 
 
 
493 aa  292  2e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  33.87 
 
 
563 aa  290  4e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  37.58 
 
 
560 aa  290  5.0000000000000004e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  43.68 
 
 
513 aa  290  5.0000000000000004e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  36.75 
 
 
559 aa  290  6e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  42.33 
 
 
499 aa  290  7e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  41.06 
 
 
787 aa  289  1e-76  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  41.53 
 
 
495 aa  289  1e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  37.72 
 
 
565 aa  289  1e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  41.94 
 
 
561 aa  288  2.9999999999999996e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  34.17 
 
 
568 aa  288  2.9999999999999996e-76  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  42.06 
 
 
499 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  42.4 
 
 
471 aa  288  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  40.72 
 
 
599 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  42.06 
 
 
499 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  42.06 
 
 
499 aa  287  4e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  34.04 
 
 
563 aa  287  5e-76  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  41.27 
 
 
522 aa  287  5e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  35.71 
 
 
585 aa  287  5e-76  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  41.87 
 
 
468 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  40.72 
 
 
599 aa  286  7e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  40.48 
 
 
599 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  36.67 
 
 
563 aa  286  1.0000000000000001e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  40.21 
 
 
562 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  37.31 
 
 
583 aa  285  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  41.58 
 
 
494 aa  285  3.0000000000000004e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  42.57 
 
 
566 aa  284  4.0000000000000003e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  37.53 
 
 
538 aa  284  4.0000000000000003e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  43.22 
 
 
577 aa  283  6.000000000000001e-75  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  43.01 
 
 
491 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  40.63 
 
 
520 aa  283  8.000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  35.8 
 
 
571 aa  283  8.000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  33.98 
 
 
583 aa  282  1e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  39.86 
 
 
554 aa  282  1e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  35.51 
 
 
561 aa  282  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  39.35 
 
 
591 aa  281  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  42.01 
 
 
518 aa  281  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  42.01 
 
 
518 aa  281  3e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0249  type II secretion system protein E  40.29 
 
 
522 aa  281  3e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  38.38 
 
 
583 aa  281  3e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  35.64 
 
 
746 aa  281  4e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  41.49 
 
 
533 aa  280  5e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  36.02 
 
 
885 aa  280  5e-74  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  39.9 
 
 
482 aa  280  5e-74  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  44.41 
 
 
417 aa  280  7e-74  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  42.11 
 
 
502 aa  279  1e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2611  putative general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)  36.05 
 
 
517 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  42.08 
 
 
474 aa  278  2e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  42.93 
 
 
498 aa  278  2e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  40.52 
 
 
563 aa  278  2e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  39.44 
 
 
888 aa  278  2e-73  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  34.81 
 
 
568 aa  278  3e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  35.8 
 
 
563 aa  278  3e-73  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  39.37 
 
 
570 aa  277  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  39.95 
 
 
494 aa  277  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  40.44 
 
 
565 aa  277  5e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  42.11 
 
 
502 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  46.41 
 
 
498 aa  276  6e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  36.48 
 
 
589 aa  276  7e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  45.7 
 
 
498 aa  276  8e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  40.05 
 
 
603 aa  276  9e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>