More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_A0653 on replicon NC_007435
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  99.63 
 
 		 536 aa  1083    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  99.63 
 
 		 536 aa  1083    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  65.16 
 
 		 594 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  99.63 
 
 		 536 aa  1083    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  100 
 
 		 536 aa  1086    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  95.64 
 
 		 538 aa  966    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  99.63 
 
 		 536 aa  1083    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  64.96 
 
 		 506 aa  635    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  67.12 
 
 		 544 aa  672    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  99.81 
 
 		 536 aa  1084    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  45.82 
 
 		 520 aa  409  1e-113  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  46.03 
 
 		 518 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  39.19 
 
 		 526 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  38.79 
 
 		 513 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  38.53 
 
 		 543 aa  298  2e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  33.81 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  34.97 
 
 		 517 aa  264  4e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  36.59 
 
 		 517 aa  228  3e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5434  type II secretion system protein E  33.46 
 
 		 609 aa  216  9e-55  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5028  type II secretion system protein E  33.46 
 
 		 609 aa  216  9.999999999999999e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  29.57 
 
 		 510 aa  200  6e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  32.52 
 
 		 616 aa  193  8e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  31.65 
 
 		 462 aa  192  1e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  33.25 
 
 		 594 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  35.5 
 
 		 486 aa  191  4e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  32.14 
 
 		 563 aa  191  4e-47  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  30.05 
 
 		 569 aa  190  7e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  32.67 
 
 		 806 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  34.09 
 
 		 511 aa  189  1e-46  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  33.33 
 
 		 520 aa  188  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  32.51 
 
 		 558 aa  188  3e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  31.39 
 
 		 462 aa  187  4e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  37.54 
 
 		 513 aa  186  7e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  35.26 
 
 		 522 aa  186  8e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  35.91 
 
 		 477 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  34.84 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  35.01 
 
 		 495 aa  184  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  33.92 
 
 		 521 aa  184  3e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  33.83 
 
 		 578 aa  184  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  33.67 
 
 		 514 aa  184  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  33.92 
 
 		 521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  35.6 
 
 		 571 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  33.92 
 
 		 521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  33.92 
 
 		 521 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  28.67 
 
 		 560 aa  184  4.0000000000000006e-45  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  33.5 
 
 		 577 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  33.67 
 
 		 521 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  33.92 
 
 		 521 aa  183  6e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  31.52 
 
 		 787 aa  183  7e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  33.9 
 
 		 599 aa  183  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  34.23 
 
 		 509 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  35.01 
 
 		 499 aa  182  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1341  type II secretion system protein E  34.08 
 
 		 570 aa  182  1e-44  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  33.92 
 
 		 521 aa  182  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  33.66 
 
 		 599 aa  182  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  34.42 
 
 		 520 aa  182  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  34.42 
 
 		 520 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  31.78 
 
 		 871 aa  181  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  32.77 
 
 		 885 aa  181  2e-44  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  34.34 
 
 		 521 aa  181  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  31.2 
 
 		 482 aa  181  2.9999999999999997e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  31.46 
 
 		 571 aa  181  2.9999999999999997e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  34.17 
 
 		 524 aa  181  2.9999999999999997e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  33.76 
 
 		 603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  35.01 
 
 		 474 aa  181  4e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  33.58 
 
 		 503 aa  181  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2308  putative GSPE-related protein  32.43 
 
 		 567 aa  181  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.173672 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  37.57 
 
 		 491 aa  181  4e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  34.6 
 
 		 471 aa  181  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  32.5 
 
 		 553 aa  181  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  34 
 
 		 520 aa  181  4e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  34.59 
 
 		 521 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  33.82 
 
 		 746 aa  180  4.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  36.42 
 
 		 554 aa  180  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  30.48 
 
 		 502 aa  180  7e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0585  type II secretion system protein E  33.65 
 
 		 392 aa  180  7e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  33.75 
 
 		 500 aa  179  8e-44  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  34.76 
 
 		 499 aa  179  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  31.14 
 
 		 575 aa  179  1e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  34.17 
 
 		 514 aa  179  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  32.18 
 
 		 477 aa  178  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  34.01 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  34.26 
 
 		 498 aa  177  3e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  34.01 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  34.01 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  34.01 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  34.01 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  34.01 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  34.01 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  33.66 
 
 		 599 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  34.01 
 
 		 497 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  34.42 
 
 		 523 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1576  type II secretion system protein E  31.02 
 
 		 546 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.22471  normal  0.0615675 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  36.51 
 
 		 527 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  33.52 
 
 		 570 aa  177  5e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  34.17 
 
 		 515 aa  177  5e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  33.92 
 
 		 523 aa  177  6e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2481  type II secretion system protein E  32.77 
 
 		 611 aa  177  6e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.271892  normal  0.269219 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  34.26 
 
 		 499 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  34.26 
 
 		 499 aa  176  7e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>