More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_5448 on replicon NC_007950
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  93.08 
 
 		 518 aa  1009    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  100 
 
 		 520 aa  1082    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  47.34 
 
 		 544 aa  427  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  46.44 
 
 		 538 aa  404  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  45.4 
 
 		 594 aa  398  1e-109  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  47.36 
 
 		 506 aa  395  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  45.82 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  45.82 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  45.82 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  45.82 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  45.82 
 
 		 536 aa  395  1e-108  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  45.82 
 
 		 536 aa  394  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_59290  type IV B pilus protein  43.75 
 
 		 526 aa  325  1e-87  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00365421  hitchhiker  0.000000107919 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4474  hypothetical protein  43.51 
 
 		 513 aa  325  2e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1514  type II secretion system protein E  37.08 
 
 		 543 aa  296  8e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0017  type IV pilus biosynthesis protein PilQ  34.99 
 
 		 499 aa  264  3e-69  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  35.76 
 
 		 517 aa  254  4.0000000000000004e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3731  type IV secretion system protein  35.41 
 
 		 517 aa  239  6.999999999999999e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  32.29 
 
 		 616 aa  213  9e-54  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  33.66 
 
 		 560 aa  197  6e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  35.85 
 
 		 521 aa  196  7e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  36.02 
 
 		 521 aa  196  7e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  36.07 
 
 		 520 aa  194  3e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009704  YpsIP31758_A0063  putative type IV secretion system protein PilQ  31.33 
 
 		 510 aa  194  3e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  31.02 
 
 		 871 aa  194  4e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  34.57 
 
 		 514 aa  194  4e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  36.29 
 
 		 521 aa  193  8e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  33.42 
 
 		 502 aa  192  8e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  35.48 
 
 		 521 aa  192  9e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  35.23 
 
 		 523 aa  192  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  34.46 
 
 		 486 aa  192  1e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  32.57 
 
 		 499 aa  191  2e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  35.54 
 
 		 514 aa  191  2e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  33.16 
 
 		 502 aa  191  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  35.22 
 
 		 521 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1783  type IV pilus biogenesis protein PilB, putative  30.04 
 
 		 574 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.989309  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  32.85 
 
 		 577 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  31.12 
 
 		 571 aa  190  4e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2614  type II secretion system protein E  35.01 
 
 		 580 aa  190  5.999999999999999e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.574914 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  34.15 
 
 		 578 aa  190  5.999999999999999e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  35.23 
 
 		 523 aa  189  9e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  34.43 
 
 		 523 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  33.84 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  33.66 
 
 		 544 aa  189  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  33.84 
 
 		 497 aa  189  1e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  35.03 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  35.03 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  35.03 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  35.03 
 
 		 521 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  32.23 
 
 		 500 aa  187  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  33.06 
 
 		 498 aa  187  3e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  36.94 
 
 		 578 aa  187  4e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  32.27 
 
 		 577 aa  186  7e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  33.33 
 
 		 501 aa  186  7e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  33.59 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  31.49 
 
 		 515 aa  186  8e-46  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  33.59 
 
 		 497 aa  186  8e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  33.84 
 
 		 497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  32.48 
 
 		 501 aa  186  1.0000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1864  type II secretion system protein E  29.75 
 
 		 573 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.468476 
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5434  type II secretion system protein E  30 
 
 		 609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_5028  type II secretion system protein E  30 
 
 		 609 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  33.06 
 
 		 498 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  30.1 
 
 		 538 aa  184  3e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  34.42 
 
 		 524 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  34.44 
 
 		 568 aa  183  7e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  31.97 
 
 		 511 aa  183  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  35.85 
 
 		 518 aa  183  8.000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  34.55 
 
 		 520 aa  182  9.000000000000001e-45  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  32.91 
 
 		 509 aa  182  1e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  33 
 
 		 603 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  32.56 
 
 		 490 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  33.67 
 
 		 491 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  34.38 
 
 		 577 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  32.23 
 
 		 477 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  32.99 
 
 		 558 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  35.96 
 
 		 497 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  30.45 
 
 		 573 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  35.11 
 
 		 513 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  34.33 
 
 		 515 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  28.89 
 
 		 576 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  33.42 
 
 		 477 aa  180  4e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  34.16 
 
 		 499 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  34.16 
 
 		 499 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  34.16 
 
 		 499 aa  181  4e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0954  general secretory pathway protein E  33.5 
 
 		 503 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.120459  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 484 aa  180  4.999999999999999e-44  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3268  general secretion pathway protein E  33.5 
 
 		 503 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000698586  hitchhiker  0.0000000000000127286 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1005  type II secretion system protein E  33.5 
 
 		 503 aa  180  4.999999999999999e-44  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  35.67 
 
 		 499 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02972  putative general secretion pathway GSPE-related protein  31.36 
 
 		 561 aa  180  5.999999999999999e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.976775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  34.78 
 
 		 575 aa  180  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  33.59 
 
 		 482 aa  180  7e-44  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  32.44 
 
 		 495 aa  180  7e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0741  type II secretion system protein E  32.69 
 
 		 569 aa  179  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.97893  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  32.14 
 
 		 787 aa  179  8e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  33.92 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  33.25 
 
 		 569 aa  179  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  33.92 
 
 		 497 aa  179  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  33.33 
 
 		 494 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>