More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1812 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2098  putative pilus biogenesis protein  98.7 
 
 		 462 aa  907    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00233002  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1812  pilus biogenesis protein, putative  100 
 
 		 462 aa  920    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.956983  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  48.92 
 
 		 558 aa  317  3e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  46.46 
 
 		 871 aa  307  3e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  43.75 
 
 		 493 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  43.75 
 
 		 493 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  43.75 
 
 		 493 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  43.44 
 
 		 493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  43.44 
 
 		 493 aa  304  3.0000000000000004e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  45.65 
 
 		 553 aa  300  5e-80  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  40.52 
 
 		 553 aa  299  6e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  42.68 
 
 		 495 aa  298  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  42.68 
 
 		 522 aa  298  2e-79  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  45.68 
 
 		 571 aa  297  2e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  42.19 
 
 		 515 aa  297  3e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  40.6 
 
 		 498 aa  297  3e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  45.65 
 
 		 564 aa  296  5e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.75 
 
 		 553 aa  296  6e-79  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  43.7 
 
 		 570 aa  295  9e-79  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.77 
 
 		 571 aa  295  1e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  38.3 
 
 		 527 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  35.64 
 
 		 497 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  35.64 
 
 		 497 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  35.64 
 
 		 497 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  41.43 
 
 		 490 aa  294  2e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  35.64 
 
 		 497 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  36.52 
 
 		 499 aa  294  2e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  35.64 
 
 		 497 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  35.64 
 
 		 497 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  35.64 
 
 		 497 aa  295  2e-78  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  41.61 
 
 		 501 aa  294  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  44.06 
 
 		 497 aa  293  4e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  40 
 
 		 468 aa  293  4e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  40.27 
 
 		 557 aa  293  4e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  44.81 
 
 		 562 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  44.06 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  41.43 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  44.06 
 
 		 497 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  36.23 
 
 		 569 aa  293  5e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1471  general secretory pathway protein E  42.28 
 
 		 498 aa  292  7e-78  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  36.03 
 
 		 499 aa  292  8e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  43.75 
 
 		 497 aa  291  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  41.43 
 
 		 498 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  43.75 
 
 		 497 aa  291  1e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  43.12 
 
 		 555 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  43.75 
 
 		 503 aa  291  1e-77  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  43.2 
 
 		 523 aa  292  1e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  43.52 
 
 		 503 aa  291  2e-77  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  36.03 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  45.77 
 
 		 482 aa  291  2e-77  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  41.3 
 
 		 513 aa  291  2e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  43.83 
 
 		 499 aa  291  2e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  43.73 
 
 		 521 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  42.28 
 
 		 498 aa  291  2e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  41.69 
 
 		 519 aa  290  3e-77  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  43.73 
 
 		 521 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  40.26 
 
 		 557 aa  290  4e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  41.43 
 
 		 499 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  36.03 
 
 		 499 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  43.17 
 
 		 885 aa  290  5.0000000000000004e-77  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  41.43 
 
 		 499 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  34.17 
 
 		 563 aa  290  5.0000000000000004e-77  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.81 
 
 		 553 aa  289  6e-77  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  38.86 
 
 		 560 aa  289  7e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  40.6 
 
 		 558 aa  289  7e-77  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  42.5 
 
 		 520 aa  289  8e-77  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3230  type II secretion system protein E (GspE)  41.3 
 
 		 491 aa  289  9e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0114833  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  43.3 
 
 		 523 aa  289  9e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  43.61 
 
 		 521 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1102  type II secretion system protein E  41.41 
 
 		 477 aa  288  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00726953  unclonable  0.00000000000588635 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0251  type II secretion system protein E  45.9 
 
 		 484 aa  288  1e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  40.87 
 
 		 487 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  42.99 
 
 		 501 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  40.76 
 
 		 561 aa  288  2e-76  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  42.41 
 
 		 507 aa  288  2e-76  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  43.21 
 
 		 521 aa  288  2e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  42.68 
 
 		 559 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  41.87 
 
 		 471 aa  287  2.9999999999999996e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  40.89 
 
 		 554 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  42.99 
 
 		 500 aa  287  2.9999999999999996e-76  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  40.91 
 
 		 561 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  41.67 
 
 		 498 aa  287  2.9999999999999996e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  43.91 
 
 		 586 aa  287  2.9999999999999996e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  42.94 
 
 		 561 aa  286  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  40.12 
 
 		 558 aa  286  4e-76  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  43.3 
 
 		 514 aa  286  4e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  43.87 
 
 		 520 aa  286  4e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  43.12 
 
 		 486 aa  286  5.999999999999999e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  45.02 
 
 		 482 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  43.44 
 
 		 598 aa  285  9e-76  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  43.12 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  43.12 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  42.41 
 
 		 518 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  43.12 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  38.92 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  43.12 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  42.94 
 
 		 524 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  41.07 
 
 		 469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  42.37 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  43.12 
 
 		 521 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>