More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_4400 on replicon NC_007901
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007901  Rfer_4400  type II secretion system protein E  100 
 
 		 575 aa  1176    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0410  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  41.07 
 
 		 555 aa  393  1e-108  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410101  hitchhiker  0.000278192 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  32.08 
 
 		 556 aa  238  2e-61  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  39.24 
 
 		 574 aa  237  4e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  31.32 
 
 		 557 aa  233  7.000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  32.01 
 
 		 558 aa  230  5e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  33.71 
 
 		 571 aa  226  7e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  30.07 
 
 		 589 aa  224  3e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  31 
 
 		 585 aa  224  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  29.17 
 
 		 563 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.75 
 
 		 571 aa  223  6e-57  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  30.34 
 
 		 568 aa  223  8e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 586 aa  223  8e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 586 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  31.2 
 
 		 554 aa  223  9e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 586 aa  223  9e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  28.74 
 
 		 555 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  31.38 
 
 		 586 aa  223  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  31.47 
 
 		 571 aa  222  9.999999999999999e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  31.66 
 
 		 586 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  31.83 
 
 		 586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  31.83 
 
 		 586 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  31.83 
 
 		 586 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  31.64 
 
 		 586 aa  221  3e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  32.14 
 
 		 637 aa  220  6e-56  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  30.11 
 
 		 568 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  30.02 
 
 		 553 aa  219  7.999999999999999e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  32.03 
 
 		 584 aa  219  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  35.12 
 
 		 577 aa  218  2e-55  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  31.65 
 
 		 586 aa  218  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  39.13 
 
 		 579 aa  218  2e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  30.48 
 
 		 557 aa  218  2.9999999999999998e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  31.07 
 
 		 577 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.34 
 
 		 568 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  31.54 
 
 		 587 aa  218  2.9999999999999998e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  31.06 
 
 		 586 aa  217  4e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  30.73 
 
 		 586 aa  217  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.96 
 
 		 568 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.96 
 
 		 568 aa  217  5e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  30.63 
 
 		 787 aa  217  5e-55  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  38.59 
 
 		 497 aa  217  5.9999999999999996e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  38.14 
 
 		 497 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  29.37 
 
 		 568 aa  216  7e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  38.14 
 
 		 497 aa  216  7e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  31.87 
 
 		 565 aa  216  7e-55  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  35.6 
 
 		 558 aa  216  7e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  31.54 
 
 		 560 aa  216  9.999999999999999e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  38.59 
 
 		 497 aa  216  9.999999999999999e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.87 
 
 		 568 aa  215  1.9999999999999998e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  39.53 
 
 		 497 aa  214  1.9999999999999998e-54  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3473  response regulator receiver domain-containing protein  30.87 
 
 		 823 aa  214  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  30.43 
 
 		 558 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2278  type II secretion system protein E  37.31 
 
 		 599 aa  214  3.9999999999999995e-54  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0893  type II secretion system protein E  38.39 
 
 		 557 aa  214  4.9999999999999996e-54  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0853399  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  29.98 
 
 		 568 aa  213  5.999999999999999e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  38.08 
 
 		 871 aa  213  9e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.68 
 
 		 568 aa  212  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  37.36 
 
 		 507 aa  212  1e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  30.89 
 
 		 553 aa  213  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3029  general secretion pathway protein E  34.94 
 
 		 550 aa  211  3e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.599486  hitchhiker  0.00121357 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  31.34 
 
 		 582 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  30.39 
 
 		 563 aa  211  3e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  34.99 
 
 		 467 aa  211  3e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  32.5 
 
 		 553 aa  211  4e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  30.36 
 
 		 563 aa  210  5e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  32.13 
 
 		 561 aa  210  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.09 
 
 		 563 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  32.35 
 
 		 595 aa  210  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  37.24 
 
 		 494 aa  210  7e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  37.75 
 
 		 498 aa  209  9e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  35.05 
 
 		 570 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  28.44 
 
 		 562 aa  209  1e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  34.68 
 
 		 577 aa  209  1e-52  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.34 
 
 		 568 aa  209  1e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4573  MSHA biogenesis protein MshE  31.39 
 
 		 570 aa  208  2e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  31.19 
 
 		 568 aa  209  2e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  29.87 
 
 		 570 aa  208  2e-52  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  30.68 
 
 		 553 aa  208  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  36.53 
 
 		 561 aa  208  2e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  36.99 
 
 		 567 aa  209  2e-52  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  33.98 
 
 		 571 aa  207  3e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  36.13 
 
 		 469 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  30.41 
 
 		 568 aa  207  5e-52  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3033  type II secretion system protein E  37.02 
 
 		 594 aa  207  5e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000430768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  31.61 
 
 		 806 aa  206  6e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  35.76 
 
 		 468 aa  207  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  35.47 
 
 		 417 aa  207  6e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1644  general secretory pathway protein E  31.01 
 
 		 519 aa  206  7e-52  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.161212  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  31.41 
 
 		 561 aa  206  8e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  36.13 
 
 		 469 aa  206  9e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  34.56 
 
 		 477 aa  206  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1731  type II secretion system protein E  31.36 
 
 		 561 aa  206  1e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0239334 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  38.1 
 
 		 501 aa  206  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  37.12 
 
 		 572 aa  206  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1464  general secretory pathway protein E  31.01 
 
 		 519 aa  205  1e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 573 aa  205  2e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  29.35 
 
 		 569 aa  205  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  34.96 
 
 		 599 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3268  general secretion pathway protein E  36.96 
 
 		 503 aa  205  2e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000698586  hitchhiker  0.0000000000000127286 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  34.78 
 
 		 599 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>