More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_0893 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_0893  type II secretion system protein E  100 
 
 		 557 aa  1067    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0853399  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  60.23 
 
 		 567 aa  583  1.0000000000000001e-165  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  50.73 
 
 		 559 aa  499  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  47.68 
 
 		 585 aa  484  1e-135  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0856  general secretory pathway protein E  50.09 
 
 		 566 aa  462  1e-129  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.67783  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0769  general secretory pathway protein E  50.09 
 
 		 566 aa  463  1e-129  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02675  general secretory pathway protein E  49.73 
 
 		 575 aa  461  9.999999999999999e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  47.74 
 
 		 580 aa  457  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0546  general secretory pathway protein E  49.55 
 
 		 573 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0871321 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  45.85 
 
 		 575 aa  437  1e-121  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0688  general secretory pathway protein E  47.09 
 
 		 578 aa  435  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831226 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4160  general secretory pathway protein E  45.91 
 
 		 578 aa  431  1e-119  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00895585 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3317  general secretion pathway protein E  50.32 
 
 		 585 aa  427  1e-118  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.209109  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3151  type II secretion system protein E  50.53 
 
 		 585 aa  428  1e-118  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.421515  normal  0.768585 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  41.5 
 
 		 558 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2183  general secretory pathway protein E  46.38 
 
 		 563 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  42.91 
 
 		 557 aa  417  9.999999999999999e-116  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  44.24 
 
 		 553 aa  411  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.42 
 
 		 553 aa  411  1e-113  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  42.73 
 
 		 557 aa  403  1e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  42.35 
 
 		 558 aa  403  1e-111  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  41.99 
 
 		 555 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 565 aa  401  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.59 
 
 		 787 aa  395  1e-109  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  39.86 
 
 		 570 aa  395  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  42.65 
 
 		 574 aa  397  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.29 
 
 		 563 aa  399  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.99 
 
 		 568 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.16 
 
 		 568 aa  393  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  39.16 
 
 		 562 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  39.64 
 
 		 568 aa  392  1e-108  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  49.66 
 
 		 507 aa  392  1e-108  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  41.68 
 
 		 571 aa  395  1e-108  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.99 
 
 		 568 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.32 
 
 		 571 aa  393  1e-108  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  40.39 
 
 		 573 aa  391  1e-107  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  52.59 
 
 		 482 aa  391  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1415  general secretory pathway protein E  53.16 
 
 		 490 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.437005  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  39.08 
 
 		 568 aa  389  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.51 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0226  general secretory pathway protein E  46.62 
 
 		 518 aa  389  1e-107  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  41.81 
 
 		 568 aa  391  1e-107  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.68 
 
 		 568 aa  389  1e-107  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18700  type II secretion system protein E  52.37 
 
 		 514 aa  391  1e-107  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0316  type II secretion system protein E  49.77 
 
 		 497 aa  390  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.218046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.48 
 
 		 564 aa  389  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  39.34 
 
 		 563 aa  391  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  47.34 
 
 		 603 aa  388  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  40.61 
 
 		 570 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.38 
 
 		 568 aa  387  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  45.89 
 
 		 503 aa  389  1e-106  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  38.53 
 
 		 571 aa  387  1e-106  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  48.74 
 
 		 544 aa  387  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  41.67 
 
 		 559 aa  383  1e-105  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.53 
 
 		 568 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1047  type II secretion system protein E  51.86 
 
 		 483 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  40.97 
 
 		 589 aa  385  1e-105  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  39.22 
 
 		 566 aa  384  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1088  type II secretion system protein E  52.09 
 
 		 482 aa  384  1e-105  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.411891 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1044  type II secretion system protein E  51.74 
 
 		 482 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  40.98 
 
 		 556 aa  384  1e-105  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.21 
 
 		 568 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  40.71 
 
 		 566 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  40.72 
 
 		 564 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  50 
 
 		 497 aa  380  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  44.91 
 
 		 599 aa  380  1e-104  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  45.53 
 
 		 569 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  45.13 
 
 		 538 aa  379  1e-104  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  42.21 
 
 		 570 aa  379  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.15 
 
 		 568 aa  382  1e-104  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  51.55 
 
 		 497 aa  377  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  44.19 
 
 		 577 aa  377  1e-103  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  42.75 
 
 		 553 aa  378  1e-103  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  49.74 
 
 		 500 aa  375  1e-103  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  45.11 
 
 		 599 aa  378  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2652  type II secretion system protein E  53.12 
 
 		 505 aa  379  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  38.88 
 
 		 558 aa  378  1e-103  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  43.33 
 
 		 577 aa  378  1e-103  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  45.93 
 
 		 599 aa  379  1e-103  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2399  general secretory pathway protein E  49.14 
 
 		 515 aa  375  1e-103  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178866 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  46.44 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  52.38 
 
 		 497 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  41.03 
 
 		 553 aa  377  1e-103  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  40.62 
 
 		 563 aa  376  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  49.76 
 
 		 497 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  48.04 
 
 		 498 aa  374  1e-102  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  47.87 
 
 		 500 aa  374  1e-102  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  38.04 
 
 		 567 aa  373  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  40.4 
 
 		 561 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  48.77 
 
 		 489 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  49.76 
 
 		 497 aa  375  1e-102  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  43.06 
 
 		 594 aa  372  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2584  general secretory pathway protein E  54 
 
 		 486 aa  372  1e-102  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.855979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  50.51 
 
 		 513 aa  373  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2107  type II secretion system protein E  47.43 
 
 		 606 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  40.85 
 
 		 561 aa  370  1e-101  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  46.26 
 
 		 520 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  40.4 
 
 		 586 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  49.74 
 
 		 501 aa  370  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2028  type II secretion system protein E  48.39 
 
 		 541 aa  371  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.115803  normal  0.0405936 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>