More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_B0410 on replicon NC_008826
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008826  Mpe_B0410  type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  100 
 
 		 555 aa  1120    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0410101  hitchhiker  0.000278192 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4400  type II secretion system protein E  41.07 
 
 		 575 aa  393  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  30.04 
 
 		 558 aa  219  7.999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  30.75 
 
 		 556 aa  214  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  31.26 
 
 		 557 aa  213  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  31.9 
 
 		 557 aa  213  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  30.75 
 
 		 553 aa  212  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  38.83 
 
 		 571 aa  211  3e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  29.37 
 
 		 568 aa  208  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  28.84 
 
 		 562 aa  206  7e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  32.28 
 
 		 553 aa  206  1e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  35.19 
 
 		 611 aa  205  2e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  30.8 
 
 		 568 aa  204  3e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  30.04 
 
 		 555 aa  204  4e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  31.76 
 
 		 554 aa  203  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  37.83 
 
 		 499 aa  203  6e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  38.42 
 
 		 499 aa  203  7e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  37.83 
 
 		 499 aa  202  9e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  35.77 
 
 		 574 aa  202  9.999999999999999e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  37.83 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  38.42 
 
 		 498 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  37.83 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  28.73 
 
 		 563 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  37.83 
 
 		 499 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  38.01 
 
 		 515 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  37.24 
 
 		 604 aa  201  1.9999999999999998e-50  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  37.5 
 
 		 469 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  31.33 
 
 		 553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  31.45 
 
 		 553 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  37.54 
 
 		 497 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  37.54 
 
 		 497 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  37.54 
 
 		 497 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.38 
 
 		 568 aa  201  3e-50  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  37.54 
 
 		 497 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  37.54 
 
 		 497 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  37.54 
 
 		 497 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  37.54 
 
 		 497 aa  201  3e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  37.54 
 
 		 497 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  37.13 
 
 		 522 aa  200  5e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  27.76 
 
 		 558 aa  200  5e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  37.5 
 
 		 495 aa  200  5e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  35.98 
 
 		 565 aa  200  7e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  30.08 
 
 		 570 aa  199  9e-50  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  37.2 
 
 		 469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  36.59 
 
 		 468 aa  197  3e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  33.62 
 
 		 599 aa  197  3e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  29.7 
 
 		 571 aa  197  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  30.53 
 
 		 586 aa  195  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2859  general secretory pathway protein E  35.61 
 
 		 498 aa  195  1e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0972  type II secretion system protein E  31.63 
 
 		 528 aa  196  1e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  33.62 
 
 		 599 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  35.65 
 
 		 586 aa  195  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  29.78 
 
 		 561 aa  195  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  33.33 
 
 		 599 aa  195  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.46 
 
 		 568 aa  195  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  31.4 
 
 		 563 aa  194  3e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  29.29 
 
 		 568 aa  193  7e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1413  general secretory pathway protein E  35.31 
 
 		 498 aa  192  9e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  30.33 
 
 		 568 aa  192  1e-47  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  29.73 
 
 		 560 aa  192  1e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  30.79 
 
 		 571 aa  192  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.79 
 
 		 568 aa  192  1e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  27.59 
 
 		 787 aa  192  2e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0752  pilus assembly pathway ATPase PilB  34.37 
 
 		 577 aa  192  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.440841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  35.26 
 
 		 477 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  35.65 
 
 		 573 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1044  type II secretion system protein E  35.93 
 
 		 482 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  34.82 
 
 		 570 aa  191  4e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  29.33 
 
 		 577 aa  191  4e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  29.22 
 
 		 568 aa  190  5e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0966  type II secretion system protein E  32.84 
 
 		 746 aa  190  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.783688 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  29.46 
 
 		 577 aa  190  5.999999999999999e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4179  type II secretion system protein E  36.23 
 
 		 482 aa  190  7e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.262241  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1351  type II secretion system protein GspE  32.74 
 
 		 778 aa  189  1e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  34.36 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  35.57 
 
 		 487 aa  189  1e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  33.53 
 
 		 806 aa  189  1e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  30 
 
 		 577 aa  188  2e-46  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.22 
 
 		 568 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  29.09 
 
 		 568 aa  188  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  32.77 
 
 		 563 aa  189  2e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  28.32 
 
 		 569 aa  188  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3314  type II secretion system protein E  33.04 
 
 		 491 aa  188  2e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  36.39 
 
 		 474 aa  188  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1133  type II secretion system protein  32.16 
 
 		 778 aa  188  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  29.22 
 
 		 568 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  35.24 
 
 		 637 aa  188  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0531  type II secretion system protein E  33.63 
 
 		 417 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  32.43 
 
 		 589 aa  187  3e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3357  type II secretion system protein E  33.03 
 
 		 595 aa  188  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.987223 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2372  type II secretion system protein E  33.24 
 
 		 595 aa  187  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1533  type II secretion system protein E  32.99 
 
 		 595 aa  187  3e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.223548  normal  0.768195 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 586 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 586 aa  187  3e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  34.08 
 
 		 507 aa  187  3e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  34.94 
 
 		 586 aa  188  3e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  37.19 
 
 		 477 aa  187  3e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  31.3 
 
 		 568 aa  188  3e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1330  type II secretion system protein E  35.88 
 
 		 474 aa  187  4e-46  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  34.14 
 
 		 467 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>