More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_4762 on replicon NC_012855
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012855  Rpic12D_4762  type II secretion system protein E  100 
 
 		 641 aa  1337    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.228994  normal  0.63689 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6291  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 605 aa  380  1e-104  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.563661  normal  1 
 
 
-
 
NC_010679  Bphyt_7246  type II secretion system protein E  33.83 
 
 		 672 aa  324  3e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4235  type II secretion system protein E  33.08 
 
 		 655 aa  286  8e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2833  type II secretion system protein E  31.07 
 
 		 616 aa  180  7e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.587179  normal  0.68865 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4246  type II secretion system protein E  30.79 
 
 		 596 aa  159  2e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5555  type II secretion system protein E  25.96 
 
 		 770 aa  146  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.095618 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6561  type II secretion system protein E  26.87 
 
 		 755 aa  144  5e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5660  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 594 aa  144  7e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472724  normal  0.0115974 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5877  type II secretion system protein E  29.64 
 
 		 506 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5243  type II secretion system protein E  27.66 
 
 		 518 aa  136  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5448  type II secretion system protein E  27.8 
 
 		 520 aa  133  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.40051  normal  0.0905589 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3702  type II secretion system protein E  28.97 
 
 		 618 aa  129  2.0000000000000002e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2419  type II secretion system protein E  30.17 
 
 		 559 aa  128  3e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5912  type II secretion system protein E  29.2 
 
 		 544 aa  127  5e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.444946  decreased coverage  0.00648046 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0772  type II/IV secretion system protein  28.76 
 
 		 538 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.182118  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1090  response regulator receiver protein  29.65 
 
 		 846 aa  126  9e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.874134  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3196  type II general secretion pathway (GSP) E protein  28.89 
 
 		 478 aa  125  3e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3246  general secretory pathway protein GspE  27.75 
 
 		 497 aa  124  4e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.827332 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  29.51 
 
 		 558 aa  124  6e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  25.88 
 
 		 599 aa  123  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  28.07 
 
 		 497 aa  122  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0360  toxin co-regulated pilus biosynthesis protein T  24.95 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.547799  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2254  type IV pilus protein PilQ  27.39 
 
 		 536 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1982  type II secretion system protein E  30.07 
 
 		 573 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.981524  normal  0.437395 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  28.68 
 
 		 497 aa  120  6e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0653  type II/IV secretion system protein  27.71 
 
 		 536 aa  120  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  25.65 
 
 		 599 aa  120  7e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3004  type II secretion system protein E  29.28 
 
 		 573 aa  120  7.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000330393 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2170  type IV pilus protein PilQ  27.71 
 
 		 536 aa  120  7.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.284038  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3483  type II secretion system protein E  30.32 
 
 		 598 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136684  normal  0.490058 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  25.65 
 
 		 599 aa  120  9e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2288  type II secretion system protein E  30.32 
 
 		 598 aa  120  9e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0404074  normal  0.787377 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1982  type II/IV secretion system protein  27.71 
 
 		 536 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.288567  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1607  type II/IV secretion system protein  27.71 
 
 		 536 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0464448  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1295  type II secretion system protein  31.51 
 
 		 566 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.00227246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  28.33 
 
 		 571 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2463  type II secretion system protein E  30.45 
 
 		 596 aa  120  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0661  type II/IV secretion system protein  27.71 
 
 		 536 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.368751  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4020  type II secretion system protein E  27.76 
 
 		 597 aa  119  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1279  type II secretion system protein E  29.28 
 
 		 573 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  27.43 
 
 		 497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  29.2 
 
 		 576 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3407  type II secretion system protein E  30.87 
 
 		 568 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  27.43 
 
 		 497 aa  119  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0629  type II secretion system protein E  27.3 
 
 		 519 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2420  type II secretion system protein E  29.53 
 
 		 573 aa  119  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29150  type II secretion system protein E  31.33 
 
 		 568 aa  118  3.9999999999999997e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0342357  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  28.3 
 
 		 564 aa  118  3.9999999999999997e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2722  type II secretion system protein E  26 
 
 		 502 aa  117  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0462772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  30.74 
 
 		 520 aa  117  7.999999999999999e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  28.57 
 
 		 787 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  27.6 
 
 		 577 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0617  type II secretion system protein E  27.76 
 
 		 467 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.201563  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1586  type II secretion system protein E  26.34 
 
 		 538 aa  116  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0294354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1068  type II secretion system protein E  27.39 
 
 		 613 aa  116  1.0000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3360  type II secretion system protein E  27.7 
 
 		 585 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0078  type II secretion system protein E  30.77 
 
 		 554 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2454  type II secretion system protein E  30.39 
 
 		 557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1345  ATPases involved in pili biogenesis, PilB-like  29.4 
 
 		 563 aa  115  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.931675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0114  ATP-binding protein  28.99 
 
 		 517 aa  115  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  27.6 
 
 		 515 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0886  type II secretion system protein E  28.79 
 
 		 571 aa  114  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.135966  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0559  type II secretion system protein E  30.62 
 
 		 1126 aa  114  5e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2588  type II secretion system protein E  30.59 
 
 		 599 aa  114  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1787  type II secretion system protein E  27.54 
 
 		 544 aa  114  6e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.23276  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  30.97 
 
 		 561 aa  114  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  27.18 
 
 		 591 aa  114  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3413  type II secretion system protein E  26.6 
 
 		 598 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2747  type II secretion system protein E  26.6 
 
 		 598 aa  114  8.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  27.34 
 
 		 520 aa  113  9e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2033  type II secretion system protein E  29.28 
 
 		 628 aa  113  9e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  30.09 
 
 		 567 aa  113  9e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  27.46 
 
 		 558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1434  type II secretion system protein E  29.54 
 
 		 558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.351728  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  26.89 
 
 		 558 aa  113  1.0000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  29.86 
 
 		 523 aa  113  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3880  type II secretion system protein E  28.81 
 
 		 567 aa  112  1.0000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  27.85 
 
 		 574 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  28.27 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  28.27 
 
 		 499 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  27.34 
 
 		 520 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0908  type II secretion system protein E  27.85 
 
 		 568 aa  112  2.0000000000000002e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  28.73 
 
 		 569 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3984  type II secretion system protein E  26.56 
 
 		 611 aa  112  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.768816 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0641  type II secretion system protein E  28.07 
 
 		 560 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  28.53 
 
 		 498 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  28.53 
 
 		 497 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  28.7 
 
 		 561 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  27.75 
 
 		 522 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  28.21 
 
 		 559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  28.27 
 
 		 499 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  25.37 
 
 		 603 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  28.49 
 
 		 523 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  28.93 
 
 		 569 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  28.93 
 
 		 569 aa  111  4.0000000000000004e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  29.83 
 
 		 582 aa  111  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3882  type II secretion system protein E  26.29 
 
 		 603 aa  111  4.0000000000000004e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.712323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  30.64 
 
 		 566 aa  111  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0547  ATPase, type IV pilus assembly protein PilB  30.54 
 
 		 565 aa  111  5e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>