More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3859 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_3859  type II secretion system protein E  100 
 
 		 568 aa  1160    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.123854 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.59 
 
 		 871 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  39.49 
 
 		 558 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  40.26 
 
 		 577 aa  400  9.999999999999999e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.93 
 
 		 553 aa  402  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  40.95 
 
 		 561 aa  390  1e-107  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  39.96 
 
 		 558 aa  390  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  42.4 
 
 		 520 aa  383  1e-105  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  40.69 
 
 		 599 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  40.07 
 
 		 599 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  39.26 
 
 		 567 aa  384  1e-105  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  39.06 
 
 		 585 aa  381  1e-104  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  39.66 
 
 		 564 aa  380  1e-104  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  39.82 
 
 		 589 aa  379  1e-104  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.25 
 
 		 553 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  40.3 
 
 		 888 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  40.07 
 
 		 599 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  41.17 
 
 		 564 aa  381  1e-104  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  40.34 
 
 		 885 aa  381  1e-104  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  41.18 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  42.21 
 
 		 521 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  39.65 
 
 		 787 aa  376  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  40.85 
 
 		 520 aa  378  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  40.18 
 
 		 571 aa  376  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  41.6 
 
 		 553 aa  376  1e-103  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  42.41 
 
 		 520 aa  373  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000611826 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  37.91 
 
 		 556 aa  374  1e-102  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  38.96 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  39.31 
 
 		 891 aa  373  1e-102  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  38.9 
 
 		 558 aa  374  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  38.5 
 
 		 571 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.6 
 
 		 563 aa  375  1e-102  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  47.41 
 
 		 500 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  38.56 
 
 		 573 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  38.72 
 
 		 570 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  40.84 
 
 		 520 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  38.43 
 
 		 577 aa  370  1e-101  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  38.33 
 
 		 568 aa  369  1e-101  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  47.03 
 
 		 501 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  39.77 
 
 		 563 aa  371  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  39.16 
 
 		 610 aa  370  1e-101  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  41.43 
 
 		 521 aa  370  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  41.63 
 
 		 521 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  39.35 
 
 		 561 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  47.45 
 
 		 514 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3528  type II secretion system protein E  39.19 
 
 		 586 aa  370  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.305202  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  41.47 
 
 		 521 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  39.55 
 
 		 524 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  42.22 
 
 		 520 aa  371  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  37.03 
 
 		 577 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  39.96 
 
 		 557 aa  367  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  43.1 
 
 		 514 aa  367  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  38.19 
 
 		 557 aa  369  1e-100  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  44.5 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3618  general secretory pathway protein E  47.45 
 
 		 523 aa  367  1e-100  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.394925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  42.23 
 
 		 514 aa  368  1e-100  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  45.07 
 
 		 523 aa  368  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  37.31 
 
 		 555 aa  367  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  47.11 
 
 		 469 aa  366  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  47.41 
 
 		 523 aa  365  1e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  38.23 
 
 		 572 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  37.55 
 
 		 565 aa  364  2e-99  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  46.95 
 
 		 521 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  46.95 
 
 		 521 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  39.7 
 
 		 559 aa  361  2e-98  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  47.44 
 
 		 521 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  46.95 
 
 		 521 aa  361  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.73 
 
 		 570 aa  360  3e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  46.89 
 
 		 521 aa  360  3e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.43 
 
 		 568 aa  360  4e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.53 
 
 		 568 aa  359  9e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.52 
 
 		 568 aa  359  9.999999999999999e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  45.48 
 
 		 499 aa  358  9.999999999999999e-98  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3174  type II secretion system protein E (GspE)  45.12 
 
 		 468 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.277379  normal  0.0236631 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  45.08 
 
 		 487 aa  358  9.999999999999999e-98  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  46.43 
 
 		 471 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  45.08 
 
 		 503 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4590  general secretion pathway protein E  44.6 
 
 		 509 aa  357  3.9999999999999996e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  40 
 
 		 557 aa  357  3.9999999999999996e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3137  pili biogenesis ATPase  44.14 
 
 		 474 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.629616  hitchhiker  0.0029573 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  39.14 
 
 		 553 aa  356  5.999999999999999e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0098  general secretory pathway protein E  44.19 
 
 		 511 aa  355  7.999999999999999e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  36.41 
 
 		 561 aa  355  8.999999999999999e-97  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  41.16 
 
 		 670 aa  355  1e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  38.64 
 
 		 568 aa  355  1e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  39.19 
 
 		 554 aa  355  1e-96  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  35.04 
 
 		 591 aa  354  2e-96  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  48.28 
 
 		 668 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.88 
 
 		 568 aa  353  2.9999999999999997e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37 
 
 		 571 aa  354  2.9999999999999997e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  47.79 
 
 		 569 aa  353  4e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.77 
 
 		 568 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2210  general secretory pathway protein E  43.1 
 
 		 477 aa  353  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  41.96 
 
 		 515 aa  353  5e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4250  general secretory pathway protein E  44.31 
 
 		 494 aa  352  1e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0196458 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03957  Type II secretory pathway, ATPase PulE-like protein  45 
 
 		 519 aa  352  1e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1072  general secretory pathway protein E  47.03 
 
 		 463 aa  351  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.538099  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  45.48 
 
 		 495 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  42.86 
 
 		 513 aa  350  4e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0755  general secretory pathway protein E  46.51 
 
 		 469 aa  350  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.179891 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>