More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_1189 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007577  PMT9312_1189  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like  100 
 
 
594 aa  1202    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06911  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like protein  66.22 
 
 
568 aa  770    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  48.92 
 
 
670 aa  427  1e-118  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  49.54 
 
 
670 aa  428  1e-118  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  49.65 
 
 
676 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  46.53 
 
 
673 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  46.53 
 
 
673 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  48.88 
 
 
668 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00191  general secretion pathway protein E  50.5 
 
 
638 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  50.75 
 
 
666 aa  404  1e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1748  type II secretion system protein E  49.88 
 
 
723 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  49.63 
 
 
871 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  45.54 
 
 
558 aa  369  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  43.76 
 
 
787 aa  352  1e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  44.99 
 
 
577 aa  352  1e-95  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  45.5 
 
 
573 aa  352  2e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.31 
 
 
571 aa  346  5e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  43.12 
 
 
556 aa  346  8.999999999999999e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  46.79 
 
 
571 aa  345  1e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.09 
 
 
571 aa  344  2e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1903  type II secretion system protein E  43.94 
 
 
487 aa  344  2.9999999999999997e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.19 
 
 
558 aa  343  5e-93  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  44.23 
 
 
557 aa  342  8e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  44.5 
 
 
564 aa  342  1e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  43.57 
 
 
503 aa  341  2e-92  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.2 
 
 
553 aa  340  5e-92  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  38.68 
 
 
524 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  45.45 
 
 
599 aa  339  9.999999999999999e-92  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  41.89 
 
 
500 aa  338  9.999999999999999e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  44.17 
 
 
575 aa  338  9.999999999999999e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.44 
 
 
568 aa  338  1.9999999999999998e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0167  general secretion pathway protein E  43.03 
 
 
521 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0090  type II secretion system protein E  45.36 
 
 
567 aa  337  2.9999999999999997e-91  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000779667  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  44.94 
 
 
599 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  44.9 
 
 
561 aa  337  2.9999999999999997e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  42.89 
 
 
561 aa  337  5e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  43.93 
 
 
571 aa  337  5e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.43 
 
 
568 aa  336  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0145  general secretory pathway protein E  42.42 
 
 
523 aa  336  7e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0154  general secretory pathway protein E  43.9 
 
 
521 aa  336  7e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  44.94 
 
 
599 aa  336  7e-91  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.49 
 
 
557 aa  336  7e-91  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0090  type II secretion system protein E  45.1 
 
 
566 aa  336  7e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0150  general secretory pathway protein E  43.9 
 
 
521 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0154  general secretory pathway protein E  43.9 
 
 
521 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.11492 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4205  general secretory pathway protein E  43.9 
 
 
521 aa  336  7.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.381078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4733  general secretory pathway protein E  43.1 
 
 
523 aa  336  9e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0457665  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  42.97 
 
 
561 aa  335  1e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0157  type II secretion system protein E (GspE)  42.72 
 
 
521 aa  335  1e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.96 
 
 
568 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  43.6 
 
 
580 aa  335  2e-90  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0106  general secretory pathway protein E  42.86 
 
 
514 aa  335  2e-90  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0152  type II secretion system protein E (GspE)  42.86 
 
 
521 aa  335  2e-90  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.203719  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.09 
 
 
563 aa  334  3e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  46.11 
 
 
727 aa  333  4e-90  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  42.96 
 
 
503 aa  333  4e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  44.58 
 
 
515 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3566  general secretion pathway protein E  42.82 
 
 
521 aa  333  4e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.294519  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  42.14 
 
 
558 aa  333  4e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0152  type II secretion system protein E (GspE)  42.72 
 
 
521 aa  333  5e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  42.57 
 
 
555 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  42.66 
 
 
499 aa  333  6e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  44.19 
 
 
497 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  41.4 
 
 
502 aa  333  8e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  40.96 
 
 
482 aa  332  9e-90  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0860  general secretion pathway protein E  45.23 
 
 
500 aa  332  1e-89  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.93 
 
 
568 aa  332  1e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.12 
 
 
568 aa  332  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0170  general secretion pathway protein E  42.72 
 
 
520 aa  332  1e-89  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  41.67 
 
 
501 aa  332  1e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1276  type II secretion system protein E  44.7 
 
 
563 aa  332  1e-89  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3393  type II secretion system protein E  43.04 
 
 
513 aa  332  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.118784  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  43.84 
 
 
610 aa  332  1e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  43.61 
 
 
514 aa  331  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  41.4 
 
 
502 aa  331  2e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3243  type II secretion system protein E  44.33 
 
 
499 aa  331  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.286765 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3426  general secretory pathway protein E  39.96 
 
 
497 aa  331  2e-89  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  44.58 
 
 
499 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  44.58 
 
 
499 aa  331  2e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  43.69 
 
 
499 aa  332  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  44.58 
 
 
499 aa  332  2e-89  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  43.94 
 
 
497 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  43.69 
 
 
495 aa  330  3e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  43.94 
 
 
497 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  43.94 
 
 
497 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  43.94 
 
 
497 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  43.94 
 
 
497 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  43.94 
 
 
497 aa  331  3e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  43.94 
 
 
497 aa  331  3e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  44.33 
 
 
553 aa  330  4e-89  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  43.69 
 
 
499 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  43.18 
 
 
563 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  42.78 
 
 
561 aa  330  7e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40.09 
 
 
585 aa  329  9e-89  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  42 
 
 
514 aa  329  9e-89  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02837  hypothetical type II secretion protein GspE  41.89 
 
 
497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.00000237275  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.39 
 
 
568 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02787  hypothetical protein  41.89 
 
 
497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.0000039107  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3137  general secretory pathway protein E  40 
 
 
497 aa  328  1.0000000000000001e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0062  general secretory pathway protein E  43.43 
 
 
498 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>