More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2071 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  62.33 
 
 
673 aa  876    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  64.05 
 
 
676 aa  884    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0376  type II secretion system protein E  63.62 
 
 
670 aa  884    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2071  ATPase  100 
 
 
666 aa  1355    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4695  type II secretion system protein E  64.15 
 
 
668 aa  878    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.912927 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1748  type II secretion system protein E  54.89 
 
 
723 aa  775    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  62.56 
 
 
670 aa  884    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  62.48 
 
 
673 aa  877    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00191  general secretion pathway protein E  55.46 
 
 
638 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2264  type II secretion system protein E  41.4 
 
 
769 aa  505  9.999999999999999e-143  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00121216 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  40.8 
 
 
568 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.96 
 
 
568 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.15 
 
 
563 aa  418  9.999999999999999e-116  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.89 
 
 
871 aa  417  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.13 
 
 
568 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.26 
 
 
568 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.97 
 
 
568 aa  415  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  39.37 
 
 
566 aa  410  1e-113  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.38 
 
 
568 aa  410  1e-113  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1299  General secretory system II protein E domain protein  37.25 
 
 
747 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.97 
 
 
568 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.1 
 
 
568 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.59 
 
 
568 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  38.95 
 
 
787 aa  408  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  39.73 
 
 
558 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1268  General secretory system II protein E domain protein  36.86 
 
 
747 aa  408  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.43 
 
 
568 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1189  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like  50.75 
 
 
594 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06911  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB-like protein  48.79 
 
 
568 aa  404  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  40.92 
 
 
558 aa  399  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.95 
 
 
553 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.84 
 
 
571 aa  399  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  41.39 
 
 
557 aa  399  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  44.12 
 
 
563 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  41.32 
 
 
557 aa  393  1e-108  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.93 
 
 
568 aa  394  1e-108  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.8 
 
 
571 aa  392  1e-107  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  40.97 
 
 
577 aa  390  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3833  type II secretion system protein E  53.38 
 
 
568 aa  390  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.522953 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  40.72 
 
 
556 aa  389  1e-107  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  38.97 
 
 
553 aa  389  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  41.1 
 
 
560 aa  388  1e-106  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  38.46 
 
 
570 aa  386  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  38.94 
 
 
568 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  38.96 
 
 
573 aa  386  1e-106  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.31 
 
 
571 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  40.67 
 
 
559 aa  380  1e-104  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  39.13 
 
 
565 aa  382  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  36.14 
 
 
564 aa  377  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.8 
 
 
549 aa  376  1e-103  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3910  putative phytochrome sensor protein  51.6 
 
 
727 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0454039  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  39.01 
 
 
561 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  39.35 
 
 
891 aa  376  1e-103  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  38.5 
 
 
567 aa  377  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  36.33 
 
 
561 aa  377  1e-103  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.34 
 
 
570 aa  374  1e-102  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000000626903  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  39.71 
 
 
561 aa  373  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  37.63 
 
 
885 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  38.49 
 
 
561 aa  371  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  40.2 
 
 
571 aa  370  1e-101  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  40.3 
 
 
553 aa  369  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  37.42 
 
 
888 aa  369  1e-101  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.38 
 
 
577 aa  366  1e-100  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0639  type II secretion system protein E  43.17 
 
 
571 aa  369  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  43.44 
 
 
500 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.55 
 
 
572 aa  368  1e-100  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  38.22 
 
 
603 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  38.01 
 
 
570 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1701  type II secretion system protein E  40.84 
 
 
578 aa  366  1e-100  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  38.79 
 
 
599 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.02 
 
 
578 aa  364  2e-99  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.69 
 
 
569 aa  364  3e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  42.44 
 
 
561 aa  364  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.42 
 
 
572 aa  363  4e-99  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  37.81 
 
 
555 aa  363  4e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  37.83 
 
 
561 aa  363  4e-99  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  38.63 
 
 
599 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  37.72 
 
 
577 aa  362  1e-98  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  38.22 
 
 
569 aa  361  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  38.97 
 
 
569 aa  361  3e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  36.99 
 
 
564 aa  360  4e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  37.76 
 
 
612 aa  360  4e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  41.24 
 
 
520 aa  360  5e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  38.71 
 
 
599 aa  359  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  42.8 
 
 
501 aa  359  8e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  39.25 
 
 
553 aa  359  9e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  35.79 
 
 
552 aa  358  9.999999999999999e-98  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2370  type IV pilus assembly protein, PilB  36.19 
 
 
571 aa  358  1.9999999999999998e-97  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.881077  normal  0.0893992 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  39.58 
 
 
558 aa  358  1.9999999999999998e-97  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.04 
 
 
577 aa  358  1.9999999999999998e-97  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.78 
 
 
569 aa  358  1.9999999999999998e-97  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  41.39 
 
 
503 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.91 
 
 
569 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  36.63 
 
 
806 aa  357  3.9999999999999996e-97  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.69 
 
 
569 aa  357  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  40.29 
 
 
557 aa  357  5e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  34.76 
 
 
562 aa  357  5e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2377  general secretory pathway protein E  41.81 
 
 
489 aa  357  5e-97  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1175  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.11 
 
 
571 aa  356  5.999999999999999e-97  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.56 
 
 
569 aa  356  6.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>