More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0626 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0626  hypothetical protein  100 
 
 		 473 aa  959    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0665  hypothetical protein  67.02 
 
 		 473 aa  633  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3576  hypothetical protein  67.52 
 
 		 490 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3763  hypothetical protein  65.13 
 
 		 490 aa  622  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0777  hypothetical protein  59.44 
 
 		 481 aa  539  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.336131 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3499  hypothetical protein  53.13 
 
 		 512 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3371  hypothetical protein  53.13 
 
 		 512 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1042  hypothetical protein  53.13 
 
 		 518 aa  498  1e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0653884 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  52.16 
 
 		 461 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00106  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  52.16 
 
 		 461 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3495  type II secretion system protein E  52.16 
 
 		 461 aa  465  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  52.16 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3552  hypothetical protein  52.16 
 
 		 461 aa  465  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  51.95 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00105  hypothetical protein  52.16 
 
 		 461 aa  465  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  50 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0113  hypothetical protein  51.73 
 
 		 461 aa  459  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0160  hypothetical protein  50.11 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0157  hypothetical protein  50.11 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.208845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0155  hypothetical protein  50.11 
 
 		 461 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0156  hypothetical protein  50.11 
 
 		 461 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.836049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0163  hypothetical protein  50.11 
 
 		 461 aa  445  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104571  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  50 
 
 		 562 aa  360  3e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.8 
 
 		 569 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.29 
 
 		 569 aa  356  5e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.95 
 
 		 570 aa  356  5.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.43 
 
 		 569 aa  355  6.999999999999999e-97  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.53 
 
 		 569 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.94 
 
 		 570 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  48.48 
 
 		 579 aa  355  1e-96  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.94 
 
 		 570 aa  355  1e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.82 
 
 		 569 aa  355  1e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  47.34 
 
 		 564 aa  354  2e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.07 
 
 		 570 aa  354  2e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.75 
 
 		 562 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  41.32 
 
 		 563 aa  353  4e-96  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.8 
 
 		 549 aa  353  5e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.8 
 
 		 569 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  46.7 
 
 		 574 aa  352  1e-95  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  47.41 
 
 		 566 aa  352  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.58 
 
 		 569 aa  352  1e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  46.45 
 
 		 574 aa  351  2e-95  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.03 
 
 		 566 aa  350  3e-95  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.64 
 
 		 572 aa  350  3e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.53 
 
 		 568 aa  349  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  47.15 
 
 		 567 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0926  type IV pilus biogenesis protein PilB  46.84 
 
 		 564 aa  348  9e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  46.62 
 
 		 568 aa  348  9e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  48.56 
 
 		 561 aa  348  1e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  47.15 
 
 		 561 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.15 
 
 		 569 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.02 
 
 		 565 aa  346  4e-94  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  48.3 
 
 		 561 aa  346  6e-94  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  45.04 
 
 		 569 aa  345  7e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.77 
 
 		 568 aa  344  2e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.9 
 
 		 578 aa  343  4e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12090  type IV pilus assembly protein  47.03 
 
 		 566 aa  341  2e-92  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  39.67 
 
 		 571 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.24 
 
 		 577 aa  333  6e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.42 
 
 		 572 aa  332  8e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1951  type 4 pili biogenesis protein (nuleotide-binding protein)  44.07 
 
 		 517 aa  332  9e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0863  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  46.17 
 
 		 573 aa  332  9e-90  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.27 
 
 		 571 aa  331  1e-89  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  44.87 
 
 		 520 aa  330  4e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0775  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.69 
 
 		 567 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.621188  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.12 
 
 		 577 aa  329  7e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  43.07 
 
 		 503 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1136  type II/IV secretion system protein  46.94 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.84 
 
 		 574 aa  327  2.0000000000000001e-88  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  44.92 
 
 		 568 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  46.39 
 
 		 577 aa  327  2.0000000000000001e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0004  general secretory pathway protein E  49.56 
 
 		 501 aa  327  3e-88  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0631782 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1273  type II protein secretion ATPase LspE  45.84 
 
 		 494 aa  327  4.0000000000000003e-88  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3506  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.46 
 
 		 407 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.55 
 
 		 568 aa  326  5e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.13 
 
 		 577 aa  326  5e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3531  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.46 
 
 		 407 aa  326  5e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.15 
 
 		 568 aa  325  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  44.42 
 
 		 582 aa  326  7e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0504  Type II secretory pathway ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway ATPase PilB  45.67 
 
 		 431 aa  325  7e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.823394  normal  0.112253 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.15 
 
 		 568 aa  325  8.000000000000001e-88  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1274  type II protein secretion ATPase LspE  45.84 
 
 		 494 aa  325  9e-88  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  45.08 
 
 		 571 aa  325  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0453  type II/IV secretion system protein  47.57 
 
 		 407 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2531  type II/IV secretion system protein  47.57 
 
 		 419 aa  325  1e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  41.79 
 
 		 787 aa  325  1e-87  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.04 
 
 		 568 aa  325  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.77 
 
 		 568 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3527  type IV fimbrial biogenesis protein,PilB  47.46 
 
 		 419 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  45.36 
 
 		 520 aa  324  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  44.13 
 
 		 569 aa  324  2e-87  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.7 
 
 		 553 aa  324  2e-87  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  44.27 
 
 		 568 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  37.01 
 
 		 591 aa  323  3e-87  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.04 
 
 		 568 aa  323  3e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3251  type II/IV secretion system protein  47.31 
 
 		 407 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0247  type IV-A pilus assembly protein PilB  43.61 
 
 		 516 aa  323  4e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1311  type II/IV secretion system protein  47.31 
 
 		 407 aa  323  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  42.6 
 
 		 507 aa  323  4e-87  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  46.29 
 
 		 568 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>