More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0777 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_0777  hypothetical protein  100 
 
 		 481 aa  975    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.336131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3576  hypothetical protein  62.26 
 
 		 490 aa  585  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3763  hypothetical protein  61.28 
 
 		 490 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3499  hypothetical protein  55.71 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1042  hypothetical protein  55.71 
 
 		 518 aa  553  1e-156  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0653884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3371  hypothetical protein  55.71 
 
 		 512 aa  553  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0626  hypothetical protein  59.44 
 
 		 473 aa  543  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0665  hypothetical protein  57.08 
 
 		 473 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00106  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  51.59 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0113  hypothetical protein  51.8 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00764351  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3495  type II secretion system protein E  51.59 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  52.22 
 
 		 461 aa  464  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3552  hypothetical protein  51.59 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  51.59 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00105  hypothetical protein  51.59 
 
 		 461 aa  462  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  51.59 
 
 		 461 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0156  hypothetical protein  52.45 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.836049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0160  hypothetical protein  52.45 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0157  hypothetical protein  52.45 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.208845 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0155  hypothetical protein  52.45 
 
 		 461 aa  454  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0163  hypothetical protein  52.24 
 
 		 461 aa  453  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  50.21 
 
 		 461 aa  444  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.15 
 
 		 569 aa  412  1e-114  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.75 
 
 		 569 aa  413  1e-114  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  52.08 
 
 		 569 aa  415  1e-114  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  52.08 
 
 		 569 aa  410  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.82 
 
 		 569 aa  411  1e-113  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.88 
 
 		 568 aa  411  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.13 
 
 		 570 aa  409  1e-113  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  48.56 
 
 		 566 aa  408  1.0000000000000001e-112  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.56 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.56 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  51.56 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.48 
 
 		 562 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  46.42 
 
 		 579 aa  408  1.0000000000000001e-112  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  49.75 
 
 		 561 aa  404  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  51.29 
 
 		 564 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  49.12 
 
 		 569 aa  402  1e-111  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  50.63 
 
 		 568 aa  402  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0926  type IV pilus biogenesis protein PilB  51.29 
 
 		 564 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49 
 
 		 569 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  50.25 
 
 		 567 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.26 
 
 		 549 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.12 
 
 		 569 aa  396  1e-109  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.51 
 
 		 569 aa  396  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  49.38 
 
 		 566 aa  397  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  45.2 
 
 		 574 aa  392  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  44.49 
 
 		 563 aa  393  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.43 
 
 		 578 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  44.56 
 
 		 562 aa  392  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  44.56 
 
 		 574 aa  390  1e-107  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.38 
 
 		 568 aa  390  1e-107  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.43 
 
 		 572 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  47.04 
 
 		 570 aa  386  1e-106  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.65 
 
 		 577 aa  387  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  46.87 
 
 		 591 aa  384  1e-105  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.85 
 
 		 565 aa  382  1e-105  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12090  type IV pilus assembly protein  45.17 
 
 		 566 aa  385  1e-105  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  50.66 
 
 		 572 aa  384  1e-105  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  43.57 
 
 		 561 aa  380  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.48 
 
 		 577 aa  379  1e-104  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  43.15 
 
 		 571 aa  379  1e-104  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  43.96 
 
 		 561 aa  379  1e-104  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  46.19 
 
 		 571 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.8 
 
 		 568 aa  377  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  49.87 
 
 		 577 aa  376  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0863  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  47.72 
 
 		 573 aa  377  1e-103  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0775  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.43 
 
 		 567 aa  374  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.621188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.61 
 
 		 574 aa  372  1e-102  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1175  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.82 
 
 		 571 aa  375  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.323553  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.36 
 
 		 577 aa  374  1e-102  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3115  general secretion pathway protein E  47.57 
 
 		 533 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.59067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.83 
 
 		 568 aa  371  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.98 
 
 		 569 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  43.98 
 
 		 569 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.98 
 
 		 568 aa  369  1e-101  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  41.21 
 
 		 571 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3053  general secretory pathway protein E  46.07 
 
 		 518 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3400  general secretory pathway protein E  46.07 
 
 		 518 aa  372  1e-101  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0061  general secretory pathway protein E  47.25 
 
 		 499 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.14 
 
 		 568 aa  368  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  47 
 
 		 515 aa  368  1e-100  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  41.91 
 
 		 522 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0151  type II secretion system protein E  47.81 
 
 		 420 aa  368  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4357  general secretory pathway protein E  42.47 
 
 		 524 aa  364  2e-99  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.555593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0051  general secretory pathway protein E  47 
 
 		 499 aa  363  3e-99  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.582006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  46.63 
 
 		 572 aa  363  3e-99  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  44.87 
 
 		 497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  44.87 
 
 		 497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  44.87 
 
 		 497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0221  general secretory pathway protein E  44.87 
 
 		 497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1889  general secretion pathway protein E  44.87 
 
 		 497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.902732  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3517  general secretion pathway protein E  44.87 
 
 		 497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.385541  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  44.87 
 
 		 497 aa  363  5.0000000000000005e-99  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3428  general secretory pathway protein E  47.06 
 
 		 471 aa  362  6e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00010017 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  47.12 
 
 		 497 aa  362  6e-99  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  41.82 
 
 		 514 aa  362  6e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  46.77 
 
 		 578 aa  362  7.0000000000000005e-99  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.3 
 
 		 578 aa  362  8e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.76 
 
 		 568 aa  362  8e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>