More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_3552 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00106  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  100 
 
 		 461 aa  937    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3495  type II secretion system protein E  100 
 
 		 461 aa  937    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0155  hypothetical protein  70.37 
 
 		 461 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0157  hypothetical protein  70.37 
 
 		 461 aa  677    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.208845 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0113  hypothetical protein  99.13 
 
 		 461 aa  926    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0160  hypothetical protein  70.37 
 
 		 461 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0156  hypothetical protein  70.37 
 
 		 461 aa  674    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.836049  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00105  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  937    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0163  hypothetical protein  70.15 
 
 		 461 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  68.76 
 
 		 461 aa  645    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  98.7 
 
 		 461 aa  925    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  99.57 
 
 		 461 aa  933    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  99.35 
 
 		 461 aa  931    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3552  hypothetical protein  100 
 
 		 461 aa  937    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0626  hypothetical protein  52.16 
 
 		 473 aa  465  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3576  hypothetical protein  50.1 
 
 		 490 aa  463  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3763  hypothetical protein  50 
 
 		 490 aa  458  9.999999999999999e-129  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0777  hypothetical protein  51.59 
 
 		 481 aa  451  1e-125  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.336131 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0665  hypothetical protein  50.33 
 
 		 473 aa  436  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1042  hypothetical protein  45.21 
 
 		 518 aa  409  1e-113  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0653884 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3371  hypothetical protein  45.21 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3499  hypothetical protein  45.21 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  49.74 
 
 		 574 aa  382  1e-105  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  49.74 
 
 		 574 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  42.44 
 
 		 561 aa  360  2e-98  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  42.27 
 
 		 579 aa  360  4e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  46.27 
 
 		 566 aa  357  1.9999999999999998e-97  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  46.67 
 
 		 562 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  39.16 
 
 		 570 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  46.34 
 
 		 568 aa  354  2e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.28 
 
 		 569 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.79 
 
 		 569 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.87 
 
 		 569 aa  353  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  46.6 
 
 		 568 aa  353  5e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  47.21 
 
 		 569 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  41.43 
 
 		 563 aa  351  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  40.25 
 
 		 561 aa  351  2e-95  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  46.61 
 
 		 571 aa  350  3e-95  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.95 
 
 		 569 aa  349  6e-95  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.29 
 
 		 562 aa  349  7e-95  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  38.82 
 
 		 591 aa  348  1e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.55 
 
 		 549 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.63 
 
 		 570 aa  347  2e-94  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  43.64 
 
 		 567 aa  347  2e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.4 
 
 		 570 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.4 
 
 		 570 aa  346  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.42 
 
 		 570 aa  346  6e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  45.45 
 
 		 566 aa  346  6e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  45.03 
 
 		 561 aa  346  6e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.15 
 
 		 569 aa  345  7e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.15 
 
 		 569 aa  344  2e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  44.28 
 
 		 564 aa  344  2e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.24 
 
 		 568 aa  343  2.9999999999999997e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.22 
 
 		 578 aa  343  2.9999999999999997e-93  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0926  type IV pilus biogenesis protein PilB  45.45 
 
 		 564 aa  343  5e-93  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.41 
 
 		 577 aa  343  5e-93  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  40.26 
 
 		 553 aa  342  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  46.42 
 
 		 568 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.36 
 
 		 568 aa  342  8e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.39 
 
 		 565 aa  342  1e-92  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  45.6 
 
 		 580 aa  340  2e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.92 
 
 		 569 aa  341  2e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.5 
 
 		 568 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.29 
 
 		 572 aa  340  4e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  40.69 
 
 		 871 aa  340  4e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  43.05 
 
 		 515 aa  339  5.9999999999999996e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  45.85 
 
 		 577 aa  339  5.9999999999999996e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.94 
 
 		 568 aa  339  7e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.83 
 
 		 568 aa  339  7e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  45.05 
 
 		 571 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2141  type II secretion system protein E  39.19 
 
 		 569 aa  338  9.999999999999999e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000466372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.62 
 
 		 571 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12090  type IV pilus assembly protein  43.28 
 
 		 566 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  45.27 
 
 		 569 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  43.05 
 
 		 522 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.27 
 
 		 569 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.92 
 
 		 577 aa  336  3.9999999999999995e-91  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03832  type II secretory pathway ATPase  47.47 
 
 		 604 aa  337  3.9999999999999995e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.67 
 
 		 578 aa  336  5e-91  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.72 
 
 		 568 aa  336  5e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2530  general secretory pathway protein E  48.54 
 
 		 477 aa  336  5.999999999999999e-91  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.247366  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  46.17 
 
 		 559 aa  335  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  45.64 
 
 		 553 aa  335  1e-90  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  42.45 
 
 		 569 aa  335  1e-90  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  43.5 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  44.82 
 
 		 568 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.03 
 
 		 577 aa  334  2e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0009  Type II secretion system gspE  42.82 
 
 		 499 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0061  general secretory pathway protein E  42.82 
 
 		 499 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.212522  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  43.28 
 
 		 495 aa  333  3e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  43.31 
 
 		 566 aa  333  3e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2305  general secretion pathway protein E  44.13 
 
 		 503 aa  333  4e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0080  general secretory pathway protein E  42.6 
 
 		 499 aa  333  5e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1951  type 4 pili biogenesis protein (nuleotide-binding protein)  43.42 
 
 		 517 aa  333  5e-90  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  42.16 
 
 		 603 aa  333  5e-90  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0008  general secretion pathway protein E  42.95 
 
 		 497 aa  333  5e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0008  general secretory pathway protein E  43.55 
 
 		 497 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2785  general secretion pathway protein E  43.55 
 
 		 497 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.254947  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0008  general secretory pathway protein E  43.55 
 
 		 497 aa  332  6e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2663  general secretion pathway protein E  43.55 
 
 		 497 aa  332  6e-90  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>