More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3499 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A1042  hypothetical protein  100 
 
 		 518 aa  1053    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0653884 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3499  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1054    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3371  hypothetical protein  100 
 
 		 512 aa  1054    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0777  hypothetical protein  55.71 
 
 		 481 aa  541  9.999999999999999e-153  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.336131 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3576  hypothetical protein  52.76 
 
 		 490 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.356057  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3763  hypothetical protein  51.59 
 
 		 490 aa  501  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0626  hypothetical protein  53.13 
 
 		 473 aa  498  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0665  hypothetical protein  51.42 
 
 		 473 aa  490  1e-137  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0157  hypothetical protein  45.95 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.208845 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0160  hypothetical protein  45.95 
 
 		 461 aa  417  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0156  hypothetical protein  45.95 
 
 		 461 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.836049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0163  hypothetical protein  45.75 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.104571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0651  hypothetical protein  45.75 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.796568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0155  hypothetical protein  45.95 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00106  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  45.21 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0110  hypothetical protein  45.42 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157109  normal  0.596737 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3495  type II secretion system protein E  45.21 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00105  hypothetical protein  45.21 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3552  hypothetical protein  45.21 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000180133 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0111  hypothetical protein  45.21 
 
 		 461 aa  409  1e-113  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000253922  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0113  hypothetical protein  45.21 
 
 		 461 aa  410  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00764351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0109  hypothetical protein  45.21 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000141775  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3423  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.43 
 
 		 569 aa  397  1e-109  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0420  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.91 
 
 		 569 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3605  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.33 
 
 		 569 aa  395  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.464844  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0416  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.41 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0425  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.37 
 
 		 569 aa  394  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  hitchhiker  0.000552387 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0419  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.72 
 
 		 569 aa  395  1e-108  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.447977  hitchhiker  0.00974258 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0313  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.02 
 
 		 569 aa  389  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3438  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.63 
 
 		 569 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.141365  normal  0.083139 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3867  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.9 
 
 		 570 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000581945 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.17 
 
 		 570 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00735332  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4060  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.97 
 
 		 570 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0244852  normal  0.314215 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2630  type IV pilus assembly protein PilB  51 
 
 		 563 aa  385  1e-106  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3942  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.42 
 
 		 570 aa  388  1e-106  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2000  type IV pilus assembly protein PilB  44.06 
 
 		 562 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.758865  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0369  type IV pilus biogenesis protein PilB  41.67 
 
 		 568 aa  382  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0217494  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3389  type II secretion system protein E  41.05 
 
 		 569 aa  382  1e-105  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3783  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.47 
 
 		 568 aa  384  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.458272  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0787  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.75 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1479  pilus assembly protein PilB  42.28 
 
 		 574 aa  379  1e-104  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1504  pilus assembly protein PilB  42.48 
 
 		 574 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2174  type II secretion system protein E  49.37 
 
 		 579 aa  379  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0413  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.22 
 
 		 568 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0480  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.11 
 
 		 562 aa  380  1e-104  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.942114  normal  0.860525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4447  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.22 
 
 		 566 aa  377  1e-103  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12090  type IV pilus assembly protein  42.63 
 
 		 566 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58750  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  49.24 
 
 		 567 aa  378  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.497058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0798  type II secretion system protein E  41.9 
 
 		 564 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1579  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.13 
 
 		 565 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5162  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  48.98 
 
 		 561 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03469  hypothetical protein  48.84 
 
 		 561 aa  369  1e-101  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2681  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.98 
 
 		 572 aa  370  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.722105  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2184  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  49.21 
 
 		 572 aa  367  1e-100  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.48405  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0926  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.48 
 
 		 564 aa  368  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4820  type II secretion system protein E  48.76 
 
 		 566 aa  365  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.25811 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0775  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.85 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.621188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.59 
 
 		 577 aa  365  1e-99  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0550  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.62 
 
 		 574 aa  365  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002545  type 4 fimbrial assembly ATPase PilB  42.15 
 
 		 561 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.255614  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0509  pilus biogenesis ATPase  47.12 
 
 		 572 aa  360  2e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0385141 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3167  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  48.7 
 
 		 577 aa  361  2e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.644973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  39.68 
 
 		 571 aa  360  5e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0863  type 4 fimbrial biogenesis protein PilB  47.03 
 
 		 573 aa  358  9.999999999999999e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2079  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.55 
 
 		 578 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.292786 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0312  type II secretion system protein E  41.06 
 
 		 571 aa  357  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0805  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.39 
 
 		 577 aa  356  5e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0768  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.75 
 
 		 577 aa  356  6.999999999999999e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3680  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.98 
 
 		 578 aa  355  1e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0069  type II secretion system protein E  39.8 
 
 		 570 aa  355  1e-96  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.73093  normal  0.361926 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3071  general secretory pathway protein E  46.67 
 
 		 515 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000785682 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2034  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  47.93 
 
 		 577 aa  353  5.9999999999999994e-96  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.226289  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5488  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.5 
 
 		 580 aa  352  7e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.388204  normal  0.1076 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2114  pilus biogenesis protein  47.93 
 
 		 577 aa  352  8.999999999999999e-96  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0064  pilin secretion/fimbrial assembly system protein, PilB  39.15 
 
 		 591 aa  351  1e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.978792  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0387  general secretory pathway protein E  47.64 
 
 		 493 aa  351  2e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3520  general secretory pathway protein E  47.64 
 
 		 493 aa  351  2e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.189411  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0382  general secretory pathway protein E  41.97 
 
 		 507 aa  351  2e-95  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.432738 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0387  general secretory pathway protein E  47.64 
 
 		 493 aa  351  2e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0402565 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03177  general secretory pathway component, cryptic  47.64 
 
 		 493 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.227231  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.29 
 
 		 571 aa  350  4e-95  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03128  hypothetical protein  47.64 
 
 		 493 aa  350  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.182977  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0841  type II secretion system protein E  40.37 
 
 		 578 aa  349  7e-95  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0657263  normal  0.685721 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2096  type IV pilus assembly protein PilB  47.41 
 
 		 571 aa  347  2e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.25 
 
 		 569 aa  347  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  41.25 
 
 		 569 aa  347  3e-94  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  46.27 
 
 		 561 aa  347  4e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  39.31 
 
 		 568 aa  346  5e-94  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4220  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  40.78 
 
 		 577 aa  346  6e-94  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2902  type II secretion system protein E  40.12 
 
 		 577 aa  345  8e-94  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1300  general secretory pathway protein E  48.2 
 
 		 498 aa  345  8.999999999999999e-94  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  40.24 
 
 		 568 aa  345  1e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0766  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.67 
 
 		 578 aa  345  1e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.59759  normal  0.16115 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3919  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.02 
 
 		 555 aa  345  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.762326  normal  0.0339341 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  45.56 
 
 		 567 aa  344  2e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  38.89 
 
 		 571 aa  344  2.9999999999999997e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  45.6 
 
 		 568 aa  343  4e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  46.13 
 
 		 568 aa  343  5e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0151  type II secretion system protein E  43.9 
 
 		 420 aa  343  5e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  38.71 
 
 		 553 aa  342  9e-93  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0787535 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>