94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_2072 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  100 
 
 		 731 aa  1414    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  100 
 
 		 722 aa  1412    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  29.01 
 
 		 819 aa  114  9e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  28.85 
 
 		 1057 aa  112  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  29.17 
 
 		 822 aa  109  2e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  29.35 
 
 		 640 aa  105  3e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  29.12 
 
 		 640 aa  103  1e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  33.89 
 
 		 679 aa  102  2e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  28.18 
 
 		 914 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  33.57 
 
 		 658 aa  102  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  26.01 
 
 		 1245 aa  100  1e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  27.97 
 
 		 924 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  22.32 
 
 		 897 aa  97.4  8e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  33.33 
 
 		 1027 aa  95.1  4e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  30.8 
 
 		 888 aa  95.1  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  28.46 
 
 		 927 aa  93.6  1e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  27.39 
 
 		 1041 aa  90.5  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  27.84 
 
 		 883 aa  88.6  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  28.38 
 
 		 1036 aa  87  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  29.08 
 
 		 946 aa  85.9  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  29.39 
 
 		 279 aa  84  0.000000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  31.03 
 
 		 692 aa  81.6  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  32.14 
 
 		 806 aa  79.3  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  35.83 
 
 		 940 aa  78.6  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  30.26 
 
 		 969 aa  77  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  28.46 
 
 		 962 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  29.74 
 
 		 968 aa  75.5  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  26 
 
 		 911 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  36.54 
 
 		 952 aa  73.6  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  24.59 
 
 		 744 aa  73.9  0.00000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  26.7 
 
 		 911 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.68 
 
 		 931 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  26.91 
 
 		 883 aa  72.4  0.00000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  25.41 
 
 		 896 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  34.75 
 
 		 595 aa  70.9  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  28.98 
 
 		 870 aa  70.1  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  39.56 
 
 		 964 aa  70.5  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  29.48 
 
 		 959 aa  68.9  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  28.45 
 
 		 826 aa  68.6  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  38.32 
 
 		 947 aa  68.2  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  36.45 
 
 		 948 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  26.14 
 
 		 912 aa  67.4  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  26.83 
 
 		 918 aa  67.4  0.0000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  26.61 
 
 		 945 aa  66.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  27.27 
 
 		 877 aa  65.1  0.000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  37.76 
 
 		 933 aa  65.1  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  26.48 
 
 		 885 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  26.5 
 
 		 715 aa  63.9  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  28.94 
 
 		 937 aa  63.2  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  28.21 
 
 		 870 aa  62.4  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  35.96 
 
 		 673 aa  61.6  0.00000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  29.47 
 
 		 1454 aa  60.8  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  29.09 
 
 		 717 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  47.27 
 
 		 828 aa  58.2  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  39.74 
 
 		 1482 aa  57.8  0.0000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  36.36 
 
 		 737 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  25.56 
 
 		 1408 aa  57.8  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.64 
 
 		 472 aa  56.6  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2743  hypothetical protein  29.81 
 
 		 1147 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000711361  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  26.41 
 
 		 957 aa  56.2  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  25.54 
 
 		 458 aa  55.8  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  33.71 
 
 		 938 aa  55.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0519  hypothetical protein  30.69 
 
 		 1621 aa  55.8  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2760  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1143 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000120005  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1097 aa  55.1  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2837  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1149 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00137938  hitchhiker  0.00529506 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1616  hypothetical protein  29.52 
 
 		 1148 aa  55.1  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000783547  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  31.03 
 
 		 1162 aa  54.3  0.000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  29.07 
 
 		 895 aa  53.5  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  38.98 
 
 		 1359 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  28.25 
 
 		 1135 aa  53.9  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2843  hypothetical protein  34.29 
 
 		 474 aa  49.3  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00000192028  normal  0.281035 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1074  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1273 aa  49.3  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0955  hypothetical exported membrane associated protein  38.71 
 
 		 312 aa  48.1  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0306729  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1056  hypothetical protein  38.71 
 
 		 312 aa  48.1  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.802166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3362  ATPase  48.15 
 
 		 1247 aa  48.1  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.592552  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3069  hypothetical protein  26.95 
 
 		 1110 aa  47.8  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  52.27 
 
 		 710 aa  46.6  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  52.27 
 
 		 708 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  52.27 
 
 		 685 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  52.27 
 
 		 708 aa  47  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  52.27 
 
 		 694 aa  47.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1988  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  23.32 
 
 		 323 aa  46.2  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.686168  normal  0.436452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  50 
 
 		 802 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1124 aa  45.4  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1129 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1478  hypothetical protein  35.59 
 
 		 1115 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000313073  normal  0.981736 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  47.73 
 
 		 752 aa  45.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  51.16 
 
 		 882 aa  45.1  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2574  hypothetical protein  25.47 
 
 		 490 aa  44.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0316091  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2204  hypothetical protein  25.47 
 
 		 490 aa  44.7  0.006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0054085  normal  0.0499119 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1992  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  22.5 
 
 		 336 aa  44.7  0.007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.274788  normal  0.303251 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0676  transmembrane protein  50 
 
 		 844 aa  43.9  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  37.5 
 
 		 889 aa  43.9  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>