33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B2128 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  72.06 
 
 
708 aa  731    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  65.95 
 
 
694 aa  673    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  65.9 
 
 
685 aa  645    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  69.79 
 
 
710 aa  693    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  100 
 
 
802 aa  1535    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  72.06 
 
 
708 aa  731    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  67.86 
 
 
752 aa  233  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2448  hypothetical protein  73.86 
 
 
882 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.564795  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2310  hypothetical protein  73.81 
 
 
881 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259281  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0772  hypothetical protein  73.81 
 
 
881 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0676  transmembrane protein  73.81 
 
 
844 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1646  hypothetical protein  73.81 
 
 
875 aa  129  3e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1855  hypothetical protein  73.81 
 
 
875 aa  129  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0264173  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0526  hypothetical protein  73.81 
 
 
875 aa  129  3e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  42.86 
 
 
890 aa  128  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1724  hypothetical protein  73.81 
 
 
190 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2884  hypothetical protein  48.61 
 
 
882 aa  125  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.677887  normal  0.937663 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4371  hypothetical protein  66.25 
 
 
783 aa  120  7e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
940 aa  52.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  41.43 
 
 
962 aa  51.2  0.00008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  40.68 
 
 
969 aa  47.8  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  50 
 
 
1036 aa  47.8  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  45.83 
 
 
968 aa  47.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  35.65 
 
 
952 aa  46.6  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  34.87 
 
 
640 aa  46.2  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  41.38 
 
 
673 aa  47  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  51.16 
 
 
731 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  51.16 
 
 
722 aa  45.8  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  47.73 
 
 
948 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  47.73 
 
 
947 aa  45.4  0.004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  53.49 
 
 
806 aa  45.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  49.06 
 
 
883 aa  44.7  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  45.83 
 
 
679 aa  44.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>