88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0866 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  100 
 
 		 1036 aa  2050    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  30.29 
 
 		 819 aa  195  4e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  29.19 
 
 		 1245 aa  194  6e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.04 
 
 		 914 aa  187  8e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  34.56 
 
 		 938 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  34.54 
 
 		 927 aa  179  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  35.6 
 
 		 924 aa  177  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  33.59 
 
 		 946 aa  175  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  67.44 
 
 		 1027 aa  174  7.999999999999999e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  33.76 
 
 		 883 aa  163  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1418  putative transmembrane protein  47.19 
 
 		 933 aa  161  6e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  44.5 
 
 		 877 aa  157  7e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  29.68 
 
 		 1057 aa  157  8e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  46.35 
 
 		 962 aa  157  8e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  44.5 
 
 		 940 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  46.33 
 
 		 969 aa  154  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  29.47 
 
 		 888 aa  154  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  35.16 
 
 		 279 aa  152  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  46.33 
 
 		 968 aa  153  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  39.54 
 
 		 673 aa  149  3e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  30.68 
 
 		 911 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  30.73 
 
 		 911 aa  147  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  30.14 
 
 		 896 aa  147  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  46.07 
 
 		 828 aa  145  3e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  51.95 
 
 		 885 aa  145  3e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.89 
 
 		 931 aa  145  5e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  51.3 
 
 		 918 aa  144  9e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  48.88 
 
 		 889 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  34.57 
 
 		 948 aa  144  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  36.44 
 
 		 806 aa  143  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  46.15 
 
 		 952 aa  141  6e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5240  putative transmembrane protein  53.49 
 
 		 964 aa  140  8.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.313298  normal  0.899168 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  30.45 
 
 		 912 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  41.14 
 
 		 870 aa  134  6.999999999999999e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  29.34 
 
 		 640 aa  132  5.0000000000000004e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  31.79 
 
 		 679 aa  130  9.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1679  putative transmembrane protein  50.38 
 
 		 883 aa  129  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  30.5 
 
 		 658 aa  126  2e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  45.08 
 
 		 870 aa  124  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  33.77 
 
 		 681 aa  122  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  31.77 
 
 		 897 aa  118  6e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  41.4 
 
 		 959 aa  115  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  30.94 
 
 		 822 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  28.46 
 
 		 826 aa  110  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  35.44 
 
 		 692 aa  108  4e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  35.46 
 
 		 717 aa  102  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  41.43 
 
 		 595 aa  102  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  34.4 
 
 		 737 aa  98.2  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  29.88 
 
 		 715 aa  97.4  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  43.48 
 
 		 947 aa  94.4  1e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  34.02 
 
 		 683 aa  92  5e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  26.92 
 
 		 744 aa  89.4  3e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  28.47 
 
 		 731 aa  86.3  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  28.95 
 
 		 722 aa  84.7  0.000000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0769  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  32.8 
 
 		 458 aa  84  0.00000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  27.6 
 
 		 640 aa  75.9  0.000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1052  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  28.27 
 
 		 472 aa  65.9  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.295894 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1258  hypothetical protein  34.81 
 
 		 633 aa  59.3  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  26.7 
 
 		 895 aa  56.2  0.000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  34.55 
 
 		 1041 aa  56.2  0.000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  28.51 
 
 		 1097 aa  54.3  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  53.33 
 
 		 1359 aa  50.1  0.0002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1565  hypothetical protein  29.41 
 
 		 601 aa  50.1  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0676  transmembrane protein  38.2 
 
 		 844 aa  48.9  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0772  hypothetical protein  38.2 
 
 		 881 aa  48.9  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2310  hypothetical protein  38.2 
 
 		 881 aa  48.9  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.259281  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1646  hypothetical protein  38.2 
 
 		 875 aa  48.5  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1724  hypothetical protein  38.2 
 
 		 190 aa  48.9  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1855  hypothetical protein  38.2 
 
 		 875 aa  48.5  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0264173  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2448  hypothetical protein  38.2 
 
 		 882 aa  48.5  0.0006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.564795  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0526  hypothetical protein  38.2 
 
 		 875 aa  48.5  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  27.46 
 
 		 1135 aa  48.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2128  hypothetical protein  51.11 
 
 		 802 aa  47.8  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00604718 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1405  hypothetical protein  28.68 
 
 		 604 aa  47  0.002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859572 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  32.05 
 
 		 1162 aa  46.2  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4625  hypothetical protein  37.5 
 
 		 752 aa  46.6  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1394  ATPase  39.39 
 
 		 1408 aa  46.2  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2151  hypothetical protein  28.22 
 
 		 937 aa  45.8  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00179894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002873  AAA ATPase  28.68 
 
 		 1454 aa  45.8  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  35.14 
 
 		 1482 aa  45.8  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6845  hypothetical protein  36.07 
 
 		 890 aa  45.8  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000661999  normal  0.206537 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3345  hypothetical protein  46.67 
 
 		 694 aa  45.4  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1663  hypothetical protein  40 
 
 		 2449 aa  45.4  0.005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3850  hypothetical protein  46.67 
 
 		 685 aa  45.8  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.618617 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3005  hypothetical protein  39.82 
 
 		 570 aa  45.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0520915  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4412  hypothetical protein  46.67 
 
 		 708 aa  45.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3955  hypothetical protein  46.67 
 
 		 708 aa  45.1  0.007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.228959 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3573  hypothetical protein  46.67 
 
 		 710 aa  45.1  0.007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.338057  normal  0.799979 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>