66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_1714 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_1714  FimV N-terminal domain protein  100 
 
 		 715 aa  1445    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1339  FimV N-terminal domain protein  29.67 
 
 		 826 aa  109  2e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.866454  normal  0.334377 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1249  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  30.71 
 
 		 914 aa  108  3e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.358578  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1561  tetratricopeptide TPR_4  27.18 
 
 		 1057 aa  107  6e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3066  putative type 4 pilus biogenesis  25.91 
 
 		 1027 aa  102  3e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0866  hypothetical protein  26.63 
 
 		 1036 aa  99  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  0.000000000000189668  hitchhiker  0.00567814 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01264  FimV  25.76 
 
 		 658 aa  94  9e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2061  hypothetical protein  25.13 
 
 		 819 aa  92.4  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2018  hypothetical protein  25.85 
 
 		 927 aa  92  3e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0727508  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1232  hypothetical protein  28.82 
 
 		 806 aa  91.7  5e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.755816  normal  0.21821 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2140  putative transmembrane protein  27.69 
 
 		 968 aa  91.3  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.704119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34230  hypothetical protein  24.62 
 
 		 946 aa  90.5  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1017  hypothetical protein  26.23 
 
 		 888 aa  89  3e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04701  hypothetical protein  29.13 
 
 		 673 aa  87.8  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0974302 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23830  pilus assembly protein  25.13 
 
 		 924 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0199592  normal  0.717366 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2082  Tfp pilus assembly protein FimV-like  26.09 
 
 		 1245 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0604144  normal  0.660247 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1701  hypothetical protein  25.5 
 
 		 1041 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0554599 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0641  hypothetical protein  24.15 
 
 		 640 aa  84.7  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2853  hypothetical protein  31.49 
 
 		 679 aa  84  0.00000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20860  putative Tfp pilus assembly protein FimV  25.76 
 
 		 681 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1986  hypothetical protein  25.96 
 
 		 962 aa  82.8  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.722287  normal  0.124787 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0725  hypothetical protein  24.42 
 
 		 640 aa  81.3  0.00000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1807  putative membrane protein; K07288 uncharacterized membrane protein  27.78 
 
 		 822 aa  80.9  0.00000000000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1646  LysM domain protein  28.95 
 
 		 717 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.435509  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1263  FimV protein  23.36 
 
 		 897 aa  80.5  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2718  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  23.45 
 
 		 931 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.513981  normal  0.0374909 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2309  peptidoglycan-binding LysM  25.31 
 
 		 952 aa  79.7  0.0000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3736  peptidoglycan-binding LysM  27.51 
 
 		 737 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.016486 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1918  hypothetical protein  25.38 
 
 		 828 aa  76.6  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.123699  normal  0.927889 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3043  putative transmembrane protein  26.89 
 
 		 870 aa  74.3  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1895  peptidoglycan-binding LysM  24.43 
 
 		 883 aa  73.6  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1993  peptidoglycan-binding LysM  23.24 
 
 		 911 aa  72.4  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.650593  normal  0.139886 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1815  peptidoglycan-binding LysM  23.56 
 
 		 692 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1554  peptidoglycan-binding LysM  25.07 
 
 		 896 aa  72  0.00000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.380472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3768  peptidoglycan-binding LysM  24.22 
 
 		 911 aa  70.9  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.853067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1470  LysM domain-containing protein  30.65 
 
 		 595 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.368966  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4871  putative transmembrane protein  24.81 
 
 		 959 aa  68.6  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.763378  normal  0.552077 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1790  motility protein FimV  25.52 
 
 		 683 aa  69.3  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1730  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  26.27 
 
 		 731 aa  68.9  0.0000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0317233  hitchhiker  0.00941699 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1816  hypothetical protein  46.05 
 
 		 969 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1527  peptidoglycan-binding LysM  25.14 
 
 		 912 aa  67  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.417424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2039  Tfp pilus assembly protein FimV-like protein  23.14 
 
 		 744 aa  65.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.177645  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2072  hypothetical protein  26.02 
 
 		 722 aa  65.5  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.813162  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2442  hypothetical protein  28.45 
 
 		 1097 aa  65.1  0.000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.39531  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1791  peptidoglycan-binding LysM  27.57 
 
 		 877 aa  63.2  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.420017  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3236  putative transmembrane protein  24.34 
 
 		 918 aa  60.8  0.00000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2470  peptidoglycan-binding LysM  29.41 
 
 		 940 aa  60.8  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.343292 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1661  hypothetical protein  26.09 
 
 		 948 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1651  hypothetical protein  24.84 
 
 		 945 aa  59.7  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000121455  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3818  hypothetical protein  25.11 
 
 		 947 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.899071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2589  putative transmembrane protein  23.6 
 
 		 885 aa  56.6  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3613  putative transmembrane protein  26.64 
 
 		 889 aa  55.8  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1915  transmembrane protein  23.39 
 
 		 279 aa  54.7  0.000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.678129  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2160  putative transmembrane protein  29.2 
 
 		 870 aa  52.8  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.12077 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1218  putative transmembrane protein  24.5 
 
 		 938 aa  52  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0213212 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3804  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1162 aa  50.1  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.866063  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1616  hypothetical protein  26.32 
 
 		 957 aa  49.3  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0172271  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1490  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1124 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00398816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1425  hypothetical protein  26.46 
 
 		 1129 aa  48.9  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000113276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03102  hypothetical protein  26.55 
 
 		 1482 aa  47.8  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1565  hypothetical protein  23.15 
 
 		 601 aa  47.8  0.0007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.218549  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2307  hypothetical protein  26.98 
 
 		 895 aa  47.4  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00252843  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1405  hypothetical protein  24.47 
 
 		 604 aa  46.6  0.001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0859572 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01203  AAA ATPase containing von Willebrand factor type A (vWA)  35.82 
 
 		 1359 aa  46.2  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2985  hypothetical protein  26.75 
 
 		 1135 aa  45.4  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00018881  normal  0.421866 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0661  hypothetical protein  45.1 
 
 		 392 aa  45.4  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>